| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 3,793,843 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (‑160/‑140) | yibB ← / → hldD | YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 3793843 = | 1 (0.010) | 152 (0.990) | 96/198 | 0.2 | 99.3% | intergenic (‑160/‑144) | yibB/hldD | YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding |
| ? | NC_000913 | 4498181 = | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 314 total aligned reads displayed.
CTGTATATTATCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATT > NC_000913/3793744‑3793941 | tcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaa < 2:2969118‑M1/1‑1 (MQ=255) tGTATATTATCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGAc > 1:1091821/1‑100 (MQ=255) caatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAc > 2:1938240‑M1/99‑100 (MQ=255) gTATATTATCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACt > 2:2944576/1‑100 (MQ=255) attatCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtg < 2:2826280‑M2/100‑3 (MQ=255) attatCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtg > 2:3638796‑M2/1‑98 (MQ=255) atctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCt > 2:1871680‑M1/94‑100 (MQ=255) tatCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtgga < 1:324810‑M2/100‑5 (MQ=255) tatCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtgga < 1:1448719‑M2/100‑5 (MQ=255) tgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTaaa < 2:2462530‑M1/10‑1 (MQ=255) tgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTaaa < 2:2917090‑M1/10‑1 (MQ=255) atCCATTCAAATGCTACCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggat > 1:3799066‑M2/1‑95 (MQ=255) tccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAAcc < 2:3374329‑M1/13‑1 (MQ=255) ccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCaa < 2:1811559‑M1/16‑1 (MQ=255) aaTGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgccccta < 1:1572395‑M2/100‑15 (MQ=255) actagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGt < 1:968928‑M1/22‑1 (MQ=255) ttCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatattt < 1:517482‑M2/100‑20 (MQ=255) tCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttc > 1:2357215‑M2/1‑80 (MQ=255) ccGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttcc < 2:2184027‑M2/100‑22 (MQ=255) cGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttcca > 1:57592‑M2/1‑78 (MQ=255) ttatttatCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCCAAACCAACCTCCGCCATGAAGGTCTAGtggatttgcccctatatttcca > 2:2253822‑M2/1‑76 (MQ=255) taaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGc > 1:1811563‑M1/72‑100 (MQ=255) taaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGc < 1:2646104‑M1/29‑1 (MQ=255) taaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagatccagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGc < 2:1653227‑M1/29‑1 (MQ=255) tatttatCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagac > 2:587732‑M2/1‑75 (MQ=255) aaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggcccgtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCa < 1:2257064‑M1/30‑1 (MQ=255) actagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcggggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTa > 1:3302315‑M1/67‑100 (MQ=255) actagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTa < 2:1747018‑M1/34‑1 (MQ=255) ctagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAg > 2:543054‑M1/66‑100 (MQ=255) ctagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAg < 2:517158‑M1/35‑1 (MQ=255) atCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctg > 1:1128721‑M2/1‑70 (MQ=255) atCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctg < 1:3062046‑M2/100‑31 (MQ=255) gtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCAt > 1:288864‑M1/63‑100 (MQ=255) aCATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatc > 1:1368591‑M2/1‑65 (MQ=255) aCATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatc < 2:3088777‑M2/100‑36 (MQ=255) cATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatca > 2:2602150‑M2/1‑64 (MQ=255) agactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtttaACTAGCTAAATCCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGc > 1:717004‑M1/57‑100 (MQ=255) ggAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcactta > 1:1745866‑M2/1‑60 (MQ=255) ggAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcactta < 2:1612117‑M2/100‑41 (MQ=255) gactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCa < 1:826947‑M1/45‑1 (MQ=255) aaTATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATACGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaac < 2:454006‑M2/100‑43 (MQ=255) tatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACct < 1:2411138‑M1/48‑1 (MQ=255) tatTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaccc < 1:2763532‑M2/100‑45 (MQ=255) ttGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccat > 1:3516978‑M2/1‑54 (MQ=255) ttGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccat < 2:3828230‑M2/100‑47 (MQ=255) cacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTa > 2:2799467‑M1/50‑100 (MQ=255) tGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatt < 2:1266541‑M2/100‑48 (MQ=255) gATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatta > 1:3634086‑M2/1‑52 (MQ=255) gATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatta > 1:3463895‑M2/1‑52 (MQ=255) gATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatta < 2:1953614‑M2/100‑49 (MQ=255) cttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATg > 1:1037493‑M1/48‑100 (MQ=255) aTACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattac > 1:268985‑M2/1‑51 (MQ=255) tACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattaca > 1:660334‑M2/1‑50 (MQ=255) tACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattaca < 1:1934528‑M2/100‑51 (MQ=255) taagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAgg > 1:335771‑M1/42‑100 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |