| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4027573 | NA (NA) | 11 (0.090) | 8/166 | NT | NA | noncoding (252/281 nt) | REP291 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 6 REP sequences | REP291 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 6 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 4027601 | NA (NA) | noncoding (280/281 nt) | REP291 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 6 REP sequences | REP291 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 6 REP sequences | |||||
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
GCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAGACCGATACACATCGTCGCCAGACCA > NC_000913/4027474‑4027672 | gCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGa > 2:185134/1‑100 (MQ=18) ccGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGAc > 2:1019193‑M1/1‑99 (MQ=255) gATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGAc > 1:3417370‑M1/1‑96 (MQ=255) tAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGAccggat < 1:3401599‑M1/100‑7 (MQ=255) tAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGAccggat < 2:1599983‑M1/100‑7 (MQ=255) aaGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATa < 2:2790789/100‑1 (MQ=255) aGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATaa > 1:428966/1‑100 (MQ=255) ggCGTTTACGCCGCATCCGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGAACGGTAGACCGGATAAg > 1:2161306/1‑100 (MQ=255) agccgttACGCACCATCAGGCAATCGGTGAATCATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCTTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAg < 1:920121/95‑1 (MQ=21) gCGTTTACGCCGCATCCGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAgg < 1:115075/100‑1 (MQ=255) gCGTTTACGCCGCATCCGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAgg < 2:3196222/100‑1 (MQ=255) gCGTTTACGCCGCATCCGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAgg < 2:179979/100‑1 (MQ=255) gCGTTTACGCCGCATCCGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAgg < 1:577049/100‑1 (MQ=255) tttACGCCGCATCCGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGAccagatcggaaga > 1:84886‑M1/1‑87 (MQ=255) ttACGCCGCATCCGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGAGCGGATAAGGCgct < 2:2495807/100‑3 (MQ=255) tACGCCGCATCCGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTc > 2:1331946/1‑100 (MQ=255) tACGCCGCATCCGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTc < 2:597897/100‑1 (MQ=255) cgccgcATCCGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCAc > 1:169192/1‑100 (MQ=255) gccgcATCCGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCAcg < 2:830176/100‑1 (MQ=255) cgcATCCGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCAcgcc < 2:2019071/100‑1 (MQ=255) cgcATCCGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTACACCGGATAAGGCGTTCAcgc < 1:2253876/99‑1 (MQ=255) gcATCCGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCAcgccg > 2:3504608/1‑100 (MQ=255) cATCCGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCAcgccgc > 2:357443/1‑100 (MQ=255) aTCCGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCA > 1:1217172‑M2/1‑100 (MQ=255) cGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCC < 2:3221751‑M2/100‑1 (MQ=255) cGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCC < 2:1149740‑M2/100‑1 (MQ=255) ggCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCG > 2:169192‑M2/1‑100 (MQ=255) gCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGAccggatgcggcgtgaacgccttatccgg < 1:463887‑M1/100‑29 (MQ=255) cAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGc < 1:1310382/100‑1 (MQ=255) cAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGc < 2:3275330/100‑1 (MQ=255) aaTTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCa < 2:2063935/100‑1 (MQ=255) ttGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTCCATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAg < 1:1659834/100‑1 (MQ=255) ttGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAg < 2:369290/100‑1 (MQ=255) tGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGAccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctac < 1:3668169‑M1/100‑34 (MQ=255) ggTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGAccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacc < 2:3050777‑M1/100‑35 (MQ=255) gTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTgg < 2:147269/100‑1 (MQ=255) tGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGt > 2:2178641/1‑100 (MQ=255) gCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGtt < 1:2448600/100‑1 (MQ=255) gCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGtt > 2:2545604/1‑100 (MQ=255) gCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGt < 2:93725/99‑1 (MQ=255) cATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTa < 2:2717819/100‑1 (MQ=255) cATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTa < 2:2551831/100‑1 (MQ=255) cATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTa > 2:50450/1‑100 (MQ=255) tgatgCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTaaa < 1:414583/100‑1 (MQ=255) tgatgCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTaaa > 1:347920/1‑100 (MQ=255) gatgCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAAc < 1:1424330/100‑1 (MQ=255) atgCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAAcc < 1:263339/100‑1 (MQ=255) tgCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAAccc < 1:3506151/100‑1 (MQ=255) tgCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAAccc > 2:750528/1‑100 (MQ=255) ccTGATGCGACGCTGCCGCGTCTGAGCAGGCCTACATGGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAAcc < 1:2979051/97‑1 (MQ=21) cTGATGCGGCGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTATACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGc < 2:2971038/99‑1 (MQ=255) cTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCt > 2:361946/1‑100 (MQ=255) cTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCt < 2:289033/100‑1 (MQ=255) cTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCt < 2:1318262/100‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCa > 1:3159605/1‑100 (MQ=255) tGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCaaa < 1:3582353/100‑1 (MQ=255) gCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGCTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAac < 2:1531890/100‑1 (MQ=255) cGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGtctaccgatccggcaccaatgtag < 1:3343812‑M2/100‑25 (MQ=255) cGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCTGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAaca > 2:3610463/1‑100 (MQ=255) cGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAaca > 1:3684635/1‑100 (MQ=255) cGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCg < 1:1837626/100‑1 (MQ=255) gCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGt > 2:3402788/1‑100 (MQ=255) cTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGGGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTc > 1:1792046/1‑100 (MQ=255) tGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCg < 2:924835/100‑1 (MQ=255) tGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCg < 1:2520410/100‑1 (MQ=255) ggCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGc < 1:17439/100‑1 (MQ=255) gcgcGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCa < 2:633745/100‑1 (MQ=255) tCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATAcc < 2:2161319/100‑1 (MQ=255) cTTATCAGGCCTACATTTGTGCCGGATCGGTAGACCTAATAAGGCTTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTATACCCGCTCAAACACCGTCGCAATAccc > 1:1454717/1‑100 (MQ=37) cTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATAccc < 2:2112377/100‑1 (MQ=255) tCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGAc < 1:1431853/100‑1 (MQ=255) cAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGAcc < 2:2253544/100‑1 (MQ=255) gCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAg < 2:3469702/100‑1 (MQ=255) gCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAg < 1:2317201/100‑1 (MQ=255) ccTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAGa > 2:2406508/1‑100 (MQ=255) cTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAGAc > 2:3006924/1‑100 (MQ=255) tACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAGAcc < 1:2583334/100‑1 (MQ=255) tACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAGAcc < 1:2717745/100‑1 (MQ=255) tACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAGAcc < 1:572292/100‑1 (MQ=255) ttGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAGACCGATa < 2:61341/100‑1 (MQ=255) ggTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTTAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAGACCGATac > 1:1206855/1‑99 (MQ=255) tGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAGACCGATGcaca > 1:737031/1‑100 (MQ=255) tGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAGACCGATAcaca < 1:670088/100‑1 (MQ=255) tGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAGACCGATAcaca < 2:2617581/100‑1 (MQ=255) tGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAGACCGATAcaca > 1:3215233/1‑100 (MQ=255) gCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAGACCGATACACAt > 1:3405016/1‑100 (MQ=255) gCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAGACCGATACACAt < 1:3334179/100‑1 (MQ=255) ggATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAGACCGATACACAtcgt < 1:1590955/100‑1 (MQ=255) gATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAGACCGATACACAtcgtc < 1:2675972/100‑1 (MQ=255) tCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAGACCGATACACAtcgtcg > 1:354677/1‑99 (MQ=255) cGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAGACCGATACACATCGTCGct < 2:3684664/100‑2 (MQ=255) cGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAGACCGATACACATCGTCGcc < 2:2328624/100‑1 (MQ=255) cGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAGACCGATACACATCGTCGcc < 1:2376670/100‑1 (MQ=255) ggTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAGACCGATACACATCGTCGCCa > 1:2505413/1‑100 (MQ=255) gTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAGACCGATACACATCGTCGCCAg < 2:1985276/100‑1 (MQ=255) aGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAGACCGATACACATCGTCGCCAGAc > 2:3663942/1‑100 (MQ=255) aGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAGACCGATACACATCGTCGCCAGAc > 2:283730/1‑100 (MQ=255) gACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGtctaccgatccggcaccaatgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaatt < 1:1920413‑M2/100‑71 (MQ=255) gACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAGACCGATACACATCGTCGCCAGAcc < 1:1854152/100‑1 (MQ=255) aCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGtctaccgatccggcaccaatgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaattg < 1:2410178‑M2/100‑72 (MQ=255) | GCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATTGGTGCATGATGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACATTGGTGCCGGATCGGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGTGGTTAAACCCGCTCAAACACCGTCGCAATACCCTGACCCAGACCGATACACATCGTCGCCAGACCA > NC_000913/4027474‑4027672 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |