| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3620116 | NA (NA) | 14 (0.110) | 7/166 | NT | 100% | coding (925/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 3620152 | 0 (0.000) | coding (961/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
GGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCC > NC_000913/3620053‑3620251 | tatttatcatcgtaagtaaagctgcgcacctgtttgccactacggtcatacaccaccgccagttcgccgcgtggcgtccagccatagcgcaccagcggcg > 1:2926345‑M2/95‑100 (MQ=255)ggCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCG > 1:56937‑M2/1‑100 (MQ=255)ggCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCG > 1:3544250‑M2/1‑100 (MQ=255)ggCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTACCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCG > 2:3037704‑M2/1‑100 (MQ=255) gtcatacaccaccgccagttcgccgcgtggcgtccagccatagcgcaccaGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGc > 1:2773305‑M2/51‑100 (MQ=255) gttcgccgcgtggcgtccagccatagcgcaccagcggcGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACga > 1:2046056‑M2/39‑99 (MQ=255) ccTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagac < 2:2064184‑M2/100‑58 (MQ=255) ccTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagac < 2:1837207‑M2/100‑58 (MQ=255) ccTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgcgtcgtgcgtcagccacacggcagacagac < 1:1608939‑M2/100‑58 (MQ=255) tcgccgcgtggcgtccagccatagcgcaccagcggcGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACgatga > 2:149533‑M2/37‑100 (MQ=255) cTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagac < 1:382013‑M2/99‑58 (MQ=255) tGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacgg < 2:1517886‑M2/100‑60 (MQ=255) tGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacgg < 2:1506597‑M2/100‑60 (MQ=255) tGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacgg < 2:2406291‑M2/100‑60 (MQ=255) gccgcgccgcTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacgga < 2:230365‑M2/100‑61 (MQ=255) gccgcgccacTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggaaatccgggtcgtgcgcctgccacacgccagacagacgg < 1:3165499‑M2/99‑60 (MQ=255) agttcgccgcgtggcgtccagccatagcgcaccaGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATa > 2:426124‑M2/35‑100 (MQ=255) agttcgccgcgtggcgtccagccatagcgcaccaGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATa > 1:2441493‑M2/35‑100 (MQ=255) gttcgccgcgtggcgtccagccatagcgcaccaGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATaa > 2:1594214‑M2/34‑100 (MQ=255) cgcgccgcTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatg < 1:325911‑M2/100‑63 (MQ=255) cgcgccgcTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatg < 2:1283697‑M2/100‑63 (MQ=255) gcgccgcTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCCCGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgc < 2:3184057‑M2/100‑64 (MQ=255) gcgccgcTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgc < 1:2257079‑M2/100‑64 (MQ=255) gccgcgtggcgtccagccatagcgcaccaGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATAc > 2:2720734‑M2/30‑100 (MQ=255) cTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgt < 2:3402827‑M2/100‑70 (MQ=255) gcggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccgg > 1:546593‑M2/1‑6 (MQ=255) GCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCacac < 1:1422475‑M2/100‑1 (MQ=255) GCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCacac > 2:1627102‑M2/1‑100 (MQ=255) GCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCacac < 2:1777014‑M2/100‑1 (MQ=255) cggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggc < 2:364042‑M2/100‑96 (MQ=255) cggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggc > 2:1243823‑M2/1‑5 (MQ=255) cggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggc > 1:725049‑M2/1‑5 (MQ=255) cggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggc < 1:465458‑M2/100‑96 (MQ=255) CGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACg > 2:1694747‑M2/1‑100 (MQ=255) CGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACGTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTcaca < 1:2198669‑M2/98‑1 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggctgccgttgtaccggccatattcggtgtaacccggc < 1:1055219‑M2/99‑96 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggca < 2:2123293‑M2/100‑97 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggca > 2:3440962‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggca < 2:926172‑M2/100‑97 (MQ=255) GGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACTGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGtcacacag > 2:1910783‑M2/1‑98 (MQ=255) GGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACgg > 1:3289264‑M2/1‑100 (MQ=255) GGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACgg < 2:2069191‑M2/100‑1 (MQ=255) GCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACggg < 1:2331289‑M2/100‑1 (MQ=255) GCGAACTGGCGGTGGTGTATAACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACggg > 1:2261104‑M2/1‑100 (MQ=255) cgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcagg < 2:3123711‑M2/100‑99 (MQ=255) cgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcagg < 2:3675153‑M2/100‑99 (MQ=255) cgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcagg > 2:632144‑M2/1‑2 (MQ=255) cgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcagg > 2:1255294‑M2/1‑2 (MQ=255) cgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcagg > 1:547751‑M2/1‑2 (MQ=255) cgcggcaggtaaagtctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcagg > 2:1969516‑M2/1‑2 (MQ=255) cGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGC > 1:1255288‑M2/1‑100 (MQ=255) cGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGC > 2:2421694‑M2/1‑100 (MQ=255) gcggcaggtaaattctccggttattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcaggg > 1:3097049‑M2/1‑1 (MQ=255) gcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcttgcggcagccacacggcagacagacggattccgttgtccggtccatatgcggtgtaacccggcaggg < 1:740487‑M2/100‑100 (MQ=255) gcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccgtccatattcggtgtaacccggcaggg > 1:439483‑M2/1‑1 (MQ=255) gcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcaggg > 1:3439468‑M2/1‑1 (MQ=255) gcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcaggg < 2:3543081‑M2/100‑100 (MQ=255) gcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcaggg > 2:515970‑M2/1‑1 (MQ=255) gcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcaggg > 1:178990‑M2/1‑1 (MQ=255) gcggcaggtaaattctccgggaattgcgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcagg < 1:633839‑M2/99‑99 (MQ=255) gcggcacataactcctccgagtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcaggg > 2:3327019‑M2/1‑1 (MQ=255) gAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCC > 2:1017804‑M2/1‑100 (MQ=255) gAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCC > 1:3258799‑M2/1‑100 (MQ=255) gAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCC > 1:3060541‑M2/1‑100 (MQ=255) gAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCC > 2:2070225‑M2/1‑100 (MQ=255) | GGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCC > NC_000913/3620053‑3620251 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |