| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,793,843 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (‑160/‑140) | yibB ← / → hldD | YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3187426 | NA (NA) | 121 (1.110) | 76/198 | 0.3 | 99.1% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3793847 | 1 (0.010) | intergenic (‑164/‑140) | yibB/hldD | YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding | |||||
| * | ? | NC_000913 | 3793843 = | 1 (0.010) | 128 (1.180) | 79/198 | 0.2 | 99.2% | intergenic (‑160/‑144) | yibB/hldD | YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding |
| ? | NC_000913 | 4498181 = | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3187329‑3187426‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGATA < NC_000913/3793847‑3793752 AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACT < 2:957155/100‑1AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACT > 2:1522353/1‑100AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACT < 1:1349076/100‑1AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACT > 1:2103569/1‑100AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACT < 2:503055/100‑1 GTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTA > 1:2625091/1‑100 GTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTA > 1:1951975/1‑100 GCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGT > 1:1250257/1‑100 GCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGT > 1:1893449/1‑100 GCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCC < 2:1970990/100‑1 GCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCC < 1:1968467/100‑1 GCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTC > 1:212571/1‑99 TGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTT > 1:429945/1‑100 GGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTC > 2:1665768/1‑100 GGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTC > 1:856030/1‑100 GTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATCACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGACCTTCAT > 1:402661/1‑100 ATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGC > 1:1531399/1‑100 ATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGC < 2:2294535/100‑1 ttGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCG < 2:1636954/98‑1 TCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCG > 1:1440216/1‑100 CGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGG < 2:1870724/100‑1 CGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGG < 2:277113/100‑1 GCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGTGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGA > 1:172172/1‑100 GCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGA < 2:2652233/100‑1 CTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGCAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGAT < 2:1448610/100‑1 CTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGCAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGAT > 1:1521084/1‑100 TCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATn < 2:2568114/100‑2 CGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGT > 1:42030/1‑100 GCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTT > 2:2668535/1‑100 CCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTG > 2:1126296/1‑100 CCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTG > 1:2183380/1‑100 CACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGG < 2:839301/100‑1 CACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGG < 2:1952717/100‑1 CACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGG < 1:1487340/100‑1 AATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGC < 1:2075278/100‑1 AATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGC < 2:856022/100‑1 ATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCA < 2:2613307/100‑1 ATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCA < 1:664727/100‑1 TCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGT > 1:642530/1‑100 CTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTG < 2:1649631/100‑1 CTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTG < 2:1598766/100‑1 TGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGA > 2:453586/1‑100 TGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGA > 2:2263006/1‑100 GCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAA > 1:710536/1‑100 GCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAA < 2:1341346/100‑1 CGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAAT < 2:646798/100‑1 GCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAG < 1:1970152/100‑1 GCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAG > 2:1215406/1‑100 GCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGC < 2:489672/100‑1 GCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGC < 2:2265413/100‑1 GCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGACAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGC < 1:909517/100‑1 GGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTT > 1:858073/1‑100 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AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3187329‑3187426‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGATA < NC_000913/3793847‑3793752 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |