| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 757,838 | Δ1 bp | 24.5% | coding (150/717 nt) | sdhB → | succinate dehydrogenase, FeS subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 757,838 | 0 | G | . | 24.5% | 283.8 / 101.3 | 106 | coding (150/717 nt) | sdhB | succinate dehydrogenase, FeS subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/46); new base . (13/13); total (47/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.50e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
TCCGCGTATGCAGGATTACACCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTACCCCGATTTCGGCACTCAAC > NC_000913/757739‑757937 | tCCGCGTATGCAGGATTACACCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCg < 1:1489006/100‑1 (MQ=255) cgcgTATGCAGGATTACACCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGtt < 1:2518378/100‑1 (MQ=255) gCAGGATTACACCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCcgccgc < 2:1117494/100‑1 (MQ=255) gCAGGATTACACCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCcgccgc < 2:3285821/100‑1 (MQ=255) cAGGATTACACCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCcgccgc > 2:1339270/1‑99 (MQ=255) cAGGATTACACCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCt < 2:1095139/100‑1 (MQ=255) cAGGATTACACCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCt > 2:3334619/1‑100 (MQ=255) cAGGATTACACCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCt < 2:3302291/100‑1 (MQ=255) cAGGATTACACCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTc > 1:277037/1‑100 (MQ=255) ttACACCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCACCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGc < 1:1984789/100‑1 (MQ=255) tACACCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGcc < 2:3028140/100‑1 (MQ=255) acacCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCg < 2:1943997/100‑1 (MQ=255) acacCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGAAATGATGCTGCTGGATGAGATTATACAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGACGCTCCTg > 1:3110209/1‑96 (MQ=255) cacCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCg < 1:72804/99‑1 (MQ=255) cacCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGt < 2:488678/100‑1 (MQ=255) cacCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGt > 2:441399/1‑100 (MQ=255) cacCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGt > 1:236326/1‑100 (MQ=255) ccttGGAAGCGGATGATGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCTAGCCTGTCGTTCCGCCGCTTCTGCCGTg < 1:1734804/96‑1 (MQ=255) cccTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGa > 2:954670/1‑100 (MQ=255) cccTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGa > 2:376897/1‑100 (MQ=255) cccTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGa > 2:196112/1‑100 (MQ=255) cccTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGaa < 2:2801291/100‑1 (MQ=255) cccTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGaa > 2:2081317/1‑100 (MQ=255) cccTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGaa > 2:2457536/1‑100 (MQ=255) ccTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAg > 1:2044981/1‑100 (MQ=255) ggAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAgg < 1:2862923/99‑1 (MQ=255) ggAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGgtg < 2:2492167/100‑1 (MQ=255) aGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGgtgtg < 2:1416575/100‑1 (MQ=255) aGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGgtgtg < 1:1351752/100‑1 (MQ=255) cGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGtgtgtg < 1:1056017/100‑1 (MQ=255) cGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGtgtgtg < 1:329401/100‑1 (MQ=255) ggATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGc < 1:2180586/100‑1 (MQ=255) ggATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCg > 2:3231455/1‑100 (MQ=255) aGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTcc < 2:236328/100‑1 (MQ=255) ggTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCg > 2:2637520/1‑100 (MQ=255) ggTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGa < 2:2422899/100‑1 (MQ=255) gTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGa > 1:36434/1‑100 (MQ=255) gTCGCGACATGATACTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGATTCCGa > 2:1135585/1‑100 (MQ=255) tCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGAc < 2:2315916/100‑1 (MQ=255) cgcgACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACg < 2:1094664/99‑1 (MQ=255) cgACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGt > 2:1423127/1‑100 (MQ=255) cgACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTc > 1:1930312/1‑100 (MQ=255) gACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTc < 2:1315635/100‑1 (MQ=255) tgatgCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGaa < 1:2806651/100‑1 (MQ=255) tgatgCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGaa > 1:3113766/1‑100 (MQ=255) gatgCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAAc < 2:2804512/100‑1 (MQ=255) tgcttcTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATg < 1:1263665/100‑1 (MQ=255) tgctgcTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACAt > 2:654174/1‑100 (MQ=255) tactgctgGATGCGCTTATACCGCTACAAGAGACCGATCCCCGGCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACa < 1:1135581/97‑1 (MQ=255) gctgctGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATg < 2:3127105/100‑1 (MQ=255) gctgctGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATg > 1:2015687/1‑100 (MQ=255) ctgctgGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGa > 1:2198551/1‑100 (MQ=255) ctgctgGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGCCTGAACATGa > 1:2041347/1‑100 (MQ=255) gctgGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAAc < 1:244746/100‑1 (MQ=255) gctgGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACg < 2:112492/100‑1 (MQ=255) ctgGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACg > 2:566931/1‑100 (MQ=255) ggATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACgtc < 2:2315733/100‑3 (MQ=255) ggATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCa > 2:767981/1‑100 (MQ=255) ggATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGAACCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCAGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGCCa > 1:832483/1‑100 (MQ=255) atctcgcTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCa < 2:3072379/96‑1 (MQ=255) aTGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCaa > 2:1316129/1‑100 (MQ=255) gcgcTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGa < 1:82603/100‑1 (MQ=255) gcgcTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGa > 2:2535856/1‑100 (MQ=255) cgcTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGat > 1:3072362/1‑99 (MQ=255) cgcTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGaa > 2:2493907/1‑100 (MQ=255) cgcCTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAAt > 2:1338761/1‑100 (MQ=255) cTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATg < 2:910145/100‑1 (MQ=255) tCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCt > 1:1604249/1‑100 (MQ=255) tCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTg < 2:2979996/100‑1 (MQ=255) ccAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTg < 2:2154534/100‑1 (MQ=255) ccAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTg > 1:2374799/1‑100 (MQ=255) cAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTgg < 1:1459020/100‑1 (MQ=255) cAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTg > 2:1381700/1‑99 (MQ=255) aGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGcc > 2:1495304/1‑100 (MQ=255) aGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGcc < 2:1860548/100‑1 (MQ=255) tAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTg > 2:792225/1‑100 (MQ=255) aaaaGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGt > 1:3202378/1‑100 (MQ=255) aaaGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTa < 2:1605794/100‑1 (MQ=255) atgagaAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCCAGAATGGTCTGGCCTGTAtt < 1:2081306/98‑1 (MQ=255) aaGAGAAAGTTCCTAGCCTTTCGTTTCTTCTCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTGCCGACGGTCTGAACATTAACGGCAATAATGGTCTGGCCTGTAt < 1:173433/100‑1 (MQ=255) aaGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTAt > 1:2904930/1‑100 (MQ=255) agagAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTAt > 1:692472/1‑99 (MQ=255) gagaAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTAc > 2:1777737/1‑100 (MQ=255) agaAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTAc < 2:898105/100‑1 (MQ=255) gaAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGGCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGACTGTATTAcc > 1:2242874/1‑100 (MQ=255) gaAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTAcc > 1:1080707/1‑100 (MQ=255) gATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTACCCCGa < 1:672325/100‑1 (MQ=255) gATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTACCCCGAt > 2:1955918/1‑100 (MQ=255) tCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTACCCCGAtt < 1:234922/100‑1 (MQ=255) tCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTACCCCGAtt > 2:5695/1‑100 (MQ=255) cAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTACCCCGATTTCgg < 1:737791/100‑1 (MQ=255) aGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTACCCCGATTTCgg < 2:3140602/100‑1 (MQ=255) aGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTACCCCGATTTCgg < 2:514976/100‑1 (MQ=255) aGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGCCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTACCCCGATTTCgg < 2:2041358/100‑1 (MQ=255) aGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTACCCCGATTTCGGc < 2:1582360/100‑1 (MQ=255) gCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTACCCCGATTTCg < 1:2031707/98‑1 (MQ=255) gCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTACCCCGATTTCGGc < 2:2764997/100‑1 (MQ=255) gCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGGGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGATCGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTACCCCGATTTCgn < 1:1321541/99‑2 (MQ=255) ccTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTACCCCGATTTCGGCa < 1:792223/100‑1 (MQ=255) gTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTACCCCGATTTCGGCACTCAAc < 2:2273753/100‑1 (MQ=255) | TCCGCGTATGCAGGATTACACCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTACCCCGATTTCGGCACTCAAC > NC_000913/757739‑757937 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |