| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 228219 = | NA (NA) | 6 (0.050) | 3/166 | NT | NA | noncoding (2461/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon |
| ? | NC_000913 | 228248 = | NA (NA) | noncoding (2490/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon | |||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
TTAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/228323‑228219‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcggtGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGGTTTAG > NC_000913/228248‑228346 TTAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGTTGTGATGAGCCGACATCGAGGAGCCAAACACCGCCGTCGATCTGAACTCCTGG > 1:1617433/1‑100TTAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGG < 2:2633504/100‑1TTAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGG > 2:1579619/1‑100 TAAATGGCGAACATCCATAGCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG < 1:1529251/100‑1 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG < 2:3368762/100‑1 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG > 2:1433446/1‑100 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG < 1:3380876/100‑1 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG < 2:453284/100‑1 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGG > 1:2798419/1‑99 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTCATGAGCTGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG > 1:1063406/1‑100 AAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGC < 1:3320768/100‑1 AAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGC < 1:1742411/100‑1 AAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGC < 2:3137704/100‑1 AAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGC < 2:2259224/100‑1 AAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCAATACGAACTCTTGGGC > 1:2001858/1‑100 AAATGGCGAACAGCCATACCCTCGGGACCTAGTTCAGTCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGC < 1:2301471/100‑1 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGTCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG < 2:768704/100‑1 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG < 2:1070611/100‑1 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG < 2:1780742/100‑1 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG < 2:2149672/100‑1 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG < 1:636590/100‑1 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG > 1:241228/1‑100 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG < 1:1144384/100‑1 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG > 1:2179418/1‑100 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG < 2:313729/100‑1 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGCGGTTCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG > 1:2510872/1‑100 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 2:2655956/100‑1 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 1:2370021/100‑1 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG > 1:1631041/1‑100 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 2:2952545/100‑1 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG > 2:1491760/1‑100 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG > 2:646445/1‑100 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 2:160335/100‑1 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGCGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 1:1370990/100‑1 ATGGCGAACAGCCATACACTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGCTGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 1:2217354/100‑1 ATGGCCAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTCCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGGGCCAAACGCCGCAGTCGATATGAACGCTTGGGCGG < 1:439006/100‑1 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AACAGCCATACCCTTCGGACCTACGTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 1:2344790/94‑1 GCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTG > 2:3305958/1‑100 GCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTG > 1:302644/1‑100 AAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGAGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTC > 1:1929980/1‑100 AACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCG > 2:2558331/1‑100 ACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGC > 1:1115803/1‑100 ACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGC > 2:1912406/1‑100 aGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCTATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 1:15024/99‑1 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TTAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/228323‑228219‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcggtGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGGTTTAG > NC_000913/228248‑228346 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |