| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 274384 = | NA (NA) | 24 (0.200) | 9/172 | NT | NA | noncoding (766/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 274422 = | NA (NA) | noncoding (728/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
CGAGCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/274485‑274384‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCC > NC_000913/274422‑274520 CGAGCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTG < 2:1961282/100‑1CGAGCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTG > 1:2866569/1‑100CGAGCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTG < 1:3383676/100‑1CGAGCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTG > 1:519718/1‑100CGAGCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTG > 1:2465183/1‑100CGAGCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTG > 2:1229589/1‑100CGAGCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTG > 2:1487681/1‑100CGAGCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTG < 2:178519/100‑1CGAGCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTG < 2:2236240/100‑1CGAGCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTG < 2:2937760/100‑1CGAGCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTG > 2:523342/1‑100CGAGCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTG > 2:986614/1‑100 tcttccgatCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGG < 2:1388032/91‑1 GAGCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGG < 2:3178696/100‑1 GAGCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGG < 2:792126/100‑1 GAGCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGG < 1:835374/100‑1 GAGCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGG > 2:880723/1‑100 GAGCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGG > 2:927214/1‑100 nGCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGC > 2:855159/2‑100 AGCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTGCCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGC < 1:1030719/100‑1 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AGCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGC < 2:457604/100‑1 AGCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGC < 2:47560/100‑1 AGCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGC > 1:290949/1‑100 nCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGac > 1:2077775/2‑98 GCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGATGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGC > 2:2458759/1‑99 GCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGC < 1:1030635/99‑1 GCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGC < 1:236640/99‑1 GCATGACCACACTCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGATGGC < 1:824500/99‑1 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CGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCA > 2:1949401/1‑100 CGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCA > 2:388473/1‑100 CGATGCCGGCTACCAAGGAGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAGGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCA > 2:1902818/1‑100 nATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCAT > 1:127204/2‑100 GATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCAT > 2:1422627/1‑100 GATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCAT > 2:1362952/1‑100 GATGCCGGCTACCAAGGAGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCAT > 2:2249467/1‑100 ATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATG > 2:526043/1‑100 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CGAGCATGACCTCAATCAGCTGGGTAATCTGCTGCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/274485‑274384‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCC > NC_000913/274422‑274520 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |