New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2728214 = | NA (NA) | 41 (0.350) | 12/170 | NT | NA | noncoding (971/2904 nt) | rrlG | 23S ribosomal RNA of rrnG operon |
? | NC_000913 | 2728240 = | NA (NA) | noncoding (945/2904 nt) | rrlG | 23S ribosomal RNA of rrnG operon |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2728316‑2728214 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgtgTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTGGTAAGTCGGGATGACCCCCTTGCCGAAACAGTGCTCTACCCCCGGAGATGA > NC_000913/2728240‑2728338 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC < 2:886116/100‑1 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC < 1:3219363/100‑1 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC > 1:2337894/1‑100 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC < 2:1181954/100‑1 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC > 1:1996893/1‑100 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC > 2:2923535/1‑100 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC > 2:3054114/1‑100 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC > 1:1720080/1‑100 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC < 1:1668111/100‑1 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC > 2:3264550/1‑100 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC < 2:450120/100‑1 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC > 2:482083/1‑100 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC > 1:519536/1‑100 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC > 2:3269649/1‑100 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC < 2:707209/100‑1 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACCTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC > 2:1893426/1‑100 TTTCGGCAAGGTGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCt < 1:1328965/100‑2 TTTCGGCAAGGGGGTCTTCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCG < 1:1992941/100‑1 TTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCG < 2:695527/100‑1 TTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCG < 1:315136/100‑1 TTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCG < 2:2274347/100‑1 TTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCG < 1:2569408/100‑1 TTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCG < 1:3334044/100‑1 TTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCG < 2:1024032/100‑1 TTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCG < 2:3250089/100‑1 TTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCG < 1:1629513/100‑1 TTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCG < 2:1129832/100‑1 TTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGT > 2:1386386/1‑100 TTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGT < 2:2286611/100‑1 TCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTG < 2:1546733/100‑1 TCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTG < 2:1374744/100‑1 TCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTG < 2:2368036/100‑1 TCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTG < 2:3338962/100‑1 TCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTG < 1:1469840/100‑1 TCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGAGGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACTGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTG < 1:2714334/100‑1 GTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTGTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTGGTAAGTCGGG > 2:1843069/1‑100 ATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTGTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTGGTAAGTCGGGATG > 1:554722/1‑100 CGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTGTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTGGTAAGTCGGGATGACCC > 1:611723/1‑100 CGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTGTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTGGTAAGTCGGGATGA > 1:769554/1‑97 GGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTGTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTGGTAAGTCGGGATGACCCC > 1:2915954/1‑100 GGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC‑‑GTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTGGTAAGTCGGGATGACCCCCT > 2:551888/1‑100 GGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTGTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTGGTAAGTCGGGATGACCCCC > 2:1881908/1‑100 GGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTGTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTGGTAAGTCGGGATGACCCCC > 1:745875/1‑100 GACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTGTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTGGTAAGTCGGGATGACCCCCTTG > 2:958806/1‑100 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CACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTGTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTGGTAAGTCGGGATGACCCCCTTGCCGA > 2:2767736/1‑100 CACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTGTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTGGTAAGTCGGGATGACCCCCTTGCCGA > 2:2226608/1‑100 CACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTGTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTGGTAAGTCGGGATGACCCCCTTGCCGA > 1:538671/1‑100 CACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTGTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTGGTAAGTCGGGATGACCCCCTTGCCGA > 2:1068367/1‑100 CGTCGTGTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTGGTAAGTCGGGATGACCCCCTTGCCGAAACAGTGCTCTACCCCCGG < 1:389049/100‑1 CGTGTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTGGTAAGTCGGGATGACCCCCTTGCCGAAACAGTGCTCTACCCCCGGAGA < 2:1200803/100‑1 CGTGTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTGGTAAGTCGGGATGACCCCCTTGCCGAAACAGTGCTCTACCCCCGGAGA > 2:2604008/1‑100 CGTGTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTGGTAAGTCGGGATGACCCCCTTGCCGAAACAGTGCTCTACCCCCGGAGA > 2:2845924/1‑100 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |