| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2597686 = | NA (NA) | 8 (0.070) | 7/166 | NT | NA | noncoding (14/46 nt) | REP181 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP181 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences |
| ? | NC_000913 | 2597714 = | NA (NA) | noncoding (42/46 nt) | REP181 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP181 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | |||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
TTACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGC > NC_000913/2597587‑2597785 | atccggcccttttttctgatatgatacgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtt < 1:2029162‑M1/1‑1 (MQ=255) tccggcccttttttctgatatgatacgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTc < 1:1665496‑M1/2‑1 (MQ=255) tACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTc < 2:320022/100‑1 (MQ=255) tACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTc < 2:486073/100‑1 (MQ=255) aCCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCg > 2:2796416/1‑100 (MQ=255) ccACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCgg > 2:468495/1‑100 (MQ=255) ccACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCgg > 1:1266074/1‑100 (MQ=255) ccACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCgg > 2:124241/1‑100 (MQ=255) ggcccttttttctgatatgatacgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCGGa > 2:1814737‑M1/96‑100 (MQ=255) ggcccttttttctgatatgatacgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCGGa < 2:2705960‑M1/5‑1 (MQ=255) cACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGa > 1:374986/1‑100 (MQ=255) cACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGa > 1:918673/1‑100 (MQ=255) gcccttttttctgatatgatacgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCGGAt > 1:1239744‑M1/95‑100 (MQ=255) aCGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGa > 2:2104039/1‑99 (MQ=255) cccttttttctgatatgatacgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagttcggcta < 1:2542765‑M1/7‑4 (MQ=255) cGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATg > 1:3133076/1‑100 (MQ=255) aTACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATgcg < 1:1537259/100‑1 (MQ=255) tACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATgcg > 1:422006/1‑99 (MQ=255) aCAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTTTCCCTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATgcggc < 1:1332388/100‑1 (MQ=255) cAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATgcggcg > 1:2265779/1‑100 (MQ=255) cAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATgcggcg > 2:1890725/1‑100 (MQ=255) aaCTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGt > 2:2168774/1‑100 (MQ=255) aCTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTg > 2:2914749/1‑100 (MQ=255) aCTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTg < 2:2205837/100‑1 (MQ=255) aCTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTg < 2:918675/100‑1 (MQ=255) ctaaGCTTGCTTTTGCAACTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTTTCGGATGCGGCGTg > 1:1410116/4‑99 (MQ=255) aGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACg < 1:1045744/100‑1 (MQ=255) gtttgcttTTGCATTTTTATCATTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACg < 1:1365411/97‑1 (MQ=255) cttgcttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAACATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGcn < 1:155909/100‑2 (MQ=255) cttgcttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATTTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCTGATGCGGCGTGAACGcc > 1:1003094/1‑100 (MQ=255) tctcttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCt < 2:2761092/97‑1 (MQ=255) tgcttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCtt < 1:1745007/100‑1 (MQ=255) gcttTTGCATCTTAATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTa > 1:2113589/1‑100 (MQ=255) cttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTAt > 1:2562322/1‑100 (MQ=255) cttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTAt > 2:1526367/1‑100 (MQ=255) cttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTAt > 2:1412107/1‑100 (MQ=255) cttTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTAt > 2:86332/1‑100 (MQ=255) ttttGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGGTTTAAAATCTTTGGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGTATGCGGCGTGAACTCCTTa > 1:1135858/1‑98 (MQ=255) tacgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATc > 2:400675‑M1/76‑100 (MQ=255) tttGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATcc < 1:2460576/100‑1 (MQ=255) tttGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATcc > 1:2778236/1‑100 (MQ=255) acgcaaacgtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaatgcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATcc > 2:1127014‑M1/75‑100 (MQ=255) tGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGa > 2:1141837/1‑100 (MQ=255) gCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGaa > 1:1101562/1‑100 (MQ=255) cATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAAc > 2:710131/1‑100 (MQ=255) aTCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACt < 2:683492/100‑1 (MQ=255) aTCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACt < 2:2782409/100‑1 (MQ=255) aTCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACt < 2:932649/100‑1 (MQ=255) aTCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACt < 1:707342/100‑1 (MQ=255) tCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTa < 1:2985963/100‑1 (MQ=255) cgtgtgcggctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTAc > 1:476406‑M1/68‑100 (MQ=255) cTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTAc > 1:1862972/1‑100 (MQ=255) cTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTAc > 2:120301/1‑100 (MQ=255) gtgtgcgtctgcaggaaaccgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACg > 2:2811555‑M1/67‑100 (MQ=255) gtgtgcgtctgcaggaaaacgcgattttagcggtaattcgcacgaaatttgtttgtcggacgtagtTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACg > 1:983067‑M1/67‑100 (MQ=255) aTCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTcc < 1:878016/100‑1 (MQ=255) aTCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTcc < 2:91383/100‑1 (MQ=255) tCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCg < 1:475555/100‑1 (MQ=255) 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2:2673359/1‑99 (MQ=255) aaTCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTa < 1:1224399/100‑1 (MQ=255) tCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTaaa < 2:3062397/100‑1 (MQ=255) tCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTaaa > 2:1072203/1‑100 (MQ=255) ttGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATcg < 1:1395890/100‑1 (MQ=255) ttGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATcg < 2:2994954/100‑1 (MQ=255) ttGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATcg < 1:2445945/100‑1 (MQ=255) gCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATcgcg > 2:822665/1‑100 (MQ=255) 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2:3137950/1‑93 (MQ=255) tgttgtGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTGATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGcaca < 1:3168256/100‑1 (MQ=255) gTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCacac > 2:3100511/1‑100 (MQ=255) ttGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGtt > 2:947309/1‑100 (MQ=255) TCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGc < 2:2106145‑M1/100‑1 (MQ=255) | TTACCACGATACAACTCAGCTTGCTTTTGCATCTTTATCACTCCTGGGTGTGAATTAACGTTTTAAAATCTTTTGCTGTCTGGTGTGCCGGATGTTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGAACTACGTCCGACAAACAAATTTCGTGCGAATTACCGCTAAAATCGCGTTTTCCTGCAGACGCACACGTTTGC > NC_000913/2597587‑2597785 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |