| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3944978 | NA (NA) | 40 (0.350) | 14/166 | NT | 78.2% | noncoding (1275/2904 nt) | rrlC | 23S ribosomal RNA of rrnC operon |
| ? | NC_000913 | = 4038811 | 12 (0.100) | noncoding (1293/2905 nt) | rrlA | 23S ribosomal RNA of rrnA operon | |||||
GCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGAGGCCGAAAGGCGTAGTCGATGGGAAACAGGTTAA > NC_000913/4038712‑4038910 | gCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCT > 2:3177690‑M2/1‑100 (MQ=255) gTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCg > 1:1727759/1‑100 (MQ=32) gTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCg > 2:1316190/1‑100 (MQ=33) cTGTAAGCCTGTGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGcct > 2:930497/1‑99 (MQ=17) tGTAAGCCTGTGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGGGACAAGCCCGCTCGctg > 1:3403559/1‑97 (MQ=255) gTAAGCCTGTGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGa > 1:3224719/1‑100 (MQ=33) gTAAGCCTGTGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGa > 1:225753/1‑100 (MQ=32) gTAAGCCTGTGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGa > 2:2031372/1‑100 (MQ=33) aaGCCTGTGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAg > 2:1953629/1‑100 (MQ=33) aGCCTGTGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGa > 1:2323054/1‑100 (MQ=33) aGCATGTGAAGGTGTGCTGTGAGGCATACTGGAGCTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCACTCggc > 1:2616075/1‑92 (MQ=11) gCCTGTGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttact < 2:1632160‑M2/100‑12 (MQ=255) gCCTGTGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGAc > 1:669284/1‑100 (MQ=32) cTGTGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGATGACATAAGTAGCGAGAAAGCGGGTGAAAAGCCGGGTCGCCGGAGGActa > 1:1499177/1‑98 (MQ=11) tgtgAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCaa > 2:1049361/1‑100 (MQ=32) gtgAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCTCCGGAAGACCAAg < 2:1548406/100‑1 (MQ=14) gtgAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAg > 2:139130/1‑100 (MQ=31) gtgAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAg > 1:2319786/1‑100 (MQ=31) tgAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAgn < 1:3130888/100‑2 (MQ=11) aGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGCTTTTCACCCGCTttatcgttacttatgtcag > 2:2020564‑M2/1‑81 (MQ=255) gCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcg < 2:3040762‑M2/100‑26 (MQ=255) aTCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGATGAAAAGCACGCTttatcggtacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcat < 2:722497‑M2/100‑47 (MQ=255) gCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCActatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcac < 1:1181767‑M2/98‑54 (MQ=255) cATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgc < 1:2531651‑M2/100‑67 (MQ=255) aCGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttcc < 1:1200799‑M2/100‑75 (MQ=255) aCGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttac < 2:3225441‑M2/100‑75 (MQ=255) aCGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttac < 2:3265516‑M2/100‑75 (MQ=255) aCGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttac < 1:1107482‑M2/100‑75 (MQ=255) cGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttaca < 1:899334‑M2/100‑76 (MQ=255) cGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttaca < 2:3251571‑M2/100‑76 (MQ=255) cGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttaca < 2:647745‑M2/100‑76 (MQ=255) cGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttaca < 2:822216‑M2/100‑76 (MQ=255) cGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttaca < 1:652006‑M2/100‑76 (MQ=255) cGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgccgcacagcacaccttcgcaggcttaca < 2:3119828‑M2/100‑76 (MQ=255) cGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatacctcacagtacaccttcacaggcttaca < 2:2891379‑M2/100‑76 (MQ=255) cGATAAAACGGGTGAAAAGCCCGCTttatcggtacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacaacacaccttcgcaggct < 1:3269258‑M2/96‑72 (MQ=255) gATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctcccgcatacctcacagtccaccttcaaaggcttacag < 1:871027‑M2/100‑77 (MQ=255) gATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacag < 1:3264530‑M2/100‑77 (MQ=255) gATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacag < 2:3028163‑M2/100‑77 (MQ=255) gATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcacaggcttacag < 1:2188632‑M2/100‑77 (MQ=255) gATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatacctcacagtacaccttcacaggcttacag < 2:1970380‑M2/100‑77 (MQ=255) gATAAAGCGGGTGAAAAGCCAGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacag < 1:2085994‑M2/100‑77 (MQ=255) aTAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttcttatacctcccgcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttccaga < 2:1219099‑M2/100‑78 (MQ=255) aTAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacaga < 2:2737248‑M2/100‑78 (MQ=255) aTAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacaga < 2:2162775‑M2/100‑78 (MQ=255) aTAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacaga < 2:1518638‑M2/100‑78 (MQ=255) aTAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacaga < 2:802502‑M2/100‑78 (MQ=255) aTAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacaga < 1:2788035‑M2/100‑78 (MQ=255) aTAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacaga < 1:1246506‑M2/100‑78 (MQ=255) aTAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcacaggcttacaga < 1:1033998‑M2/100‑78 (MQ=255) aTAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatacctcacagtacaccttcacaggcttacaga < 2:850691‑M2/100‑78 (MQ=255) tAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTttattgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatacctcacagtacaccttcacaggcttacagaa < 1:3205959‑M2/100‑79 (MQ=255) aaaGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaac < 1:965896‑M2/100‑80 (MQ=255) aaGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacg < 1:18343‑M2/100‑81 (MQ=255) aaGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacg < 2:770123‑M2/100‑81 (MQ=255) aaGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaac < 2:974472‑M2/99‑80 (MQ=255) aGCGGGTGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgc < 1:1336345‑M2/100‑82 (MQ=255) tGAAAAGCCCGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccct < 2:2034466‑M2/100‑88 (MQ=255) cccGCTttatcgttacttatgtcagcatttgcacttctgatacctcccgcatgcctcccagcaccccttcgcaggcttacataacgctcccctgccccac < 1:1872933‑M2/100‑95 (MQ=255) cccGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcccagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaac < 2:1077591‑M2/100‑95 (MQ=255) cccGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaac < 2:2777789‑M2/100‑95 (MQ=255) cccGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaac < 2:2088789‑M2/100‑95 (MQ=255) cccGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaac > 1:2966287‑M2/1‑6 (MQ=255) cccGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaac > 2:1904690‑M2/1‑6 (MQ=255) cccGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaac < 1:43092‑M2/100‑95 (MQ=255) cccGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaac < 1:3087139‑M2/100‑95 (MQ=255) cccGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaac > 1:3171337‑M2/1‑6 (MQ=255) cccGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaac < 1:423933‑M2/100‑95 (MQ=255) cccGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaac > 2:1845741‑M2/1‑6 (MQ=255) cccGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaac < 1:2345956‑M2/100‑95 (MQ=255) cccGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaac < 1:746006‑M2/100‑95 (MQ=255) cccGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaac < 2:1501767‑M2/100‑95 (MQ=255) cccGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaac < 1:2111257‑M2/100‑95 (MQ=255) cccGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctaccc > 1:2088977‑M2/1‑6 (MQ=255) cccGCTttatcgttacgtatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaac > 1:1998933‑M2/1‑6 (MQ=255) ccGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcactgcacacctccgcaggcctacagaacgctcccctacccaaca > 1:2665492‑M2/1‑5 (MQ=255) ccGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaaca > 2:1949734‑M2/1‑5 (MQ=255) ccGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaaca > 1:1323488‑M2/1‑5 (MQ=255) ccGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaaca < 2:196887‑M2/100‑96 (MQ=255) ccGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaaca < 2:805976‑M2/100‑96 (MQ=255) ccGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaaca < 1:378164‑M2/100‑96 (MQ=255) cGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaacaa < 1:2156645‑M2/100‑97 (MQ=255) cGCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaacaa < 2:1317953‑M2/100‑97 (MQ=255) gCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaacaac < 2:1826142‑M2/100‑98 (MQ=255) gCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaacaac < 1:3137498‑M2/100‑98 (MQ=255) gCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaacaac < 1:2674162‑M2/100‑98 (MQ=255) gCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaacaac > 2:442688‑M2/1‑3 (MQ=255) gCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaacaac < 2:377180‑M2/100‑98 (MQ=255) gCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaacaac < 2:3327559‑M2/100‑98 (MQ=255) gCTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaacaac > 2:1274008‑M2/1‑3 (MQ=255) cTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacactttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaacaacg > 1:1826134‑M2/1‑2 (MQ=255) cTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaacaacg > 2:35224‑M2/1‑2 (MQ=255) cTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaacaacg > 2:35030‑M2/1‑2 (MQ=255) cTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaacaacg > 1:1765810‑M2/1‑2 (MQ=255) cTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaacaacg > 2:1124672‑M2/1‑2 (MQ=255) cTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaacaac > 1:1500237‑M2/1‑2 (MQ=255) cTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaacaac < 1:2126055‑M2/99‑98 (MQ=255) cTttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcagccttacagaacgctcccctacccaacaacg > 1:2209485‑M2/1‑2 (MQ=255) tttatcgttacttatgtcagcattcgcacttctgatacctccagcatgcctcacagcacaccttcgcaggcttacagaacgctcccctacccaacaacgc > 1:1381804‑M2/1‑1 (MQ=255) | GCGTTCTGTAAGCCTGTGAAGGTGTGCTGTGAGGCATGCTGGAGGTATCAGAAGTGCGAATGCTGACATAAGTAACGATAAAGCGGGTGAAAAGCCCGCTCGCCGGAAGACCAAGGGTTCCTGTCCAACGTTAATCGGGGCAGGGTGAGTCGACCCCTAAGGCGAGGCCGAAAGGCGTAGTCGATGGGAAACAGGTTAA > NC_000913/4038712‑4038910 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |