| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1468681 | NA (NA) | 60 (0.970) +ACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGG |
10/90 | NT | NA | noncoding (560/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1650843 = | NA (NA) | noncoding (1/706 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 575 total aligned reads displayed.
GTACACTGAAAATTCAACAGGAAAAATCAGCCCGGTCATTGCTGCCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTG > NC_000913/1650746‑1650941 | cacTGAAAATTCAACAGGAAAAATCAGCCCGGTCATTGCTGCCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATggg < 1:2411943/100‑1 (MQ=255) cTGAAAATTCAACAGGAAAAATCAGCCCGGTCATTGCTGCCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGgcg > 2:1912249/1‑100 (MQ=255) tGAAAATTCAACAGGAAAAATCAGCCCGGTCATTGCTGCCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGgcgc > 1:724217/1‑100 (MQ=255) cAACAGGAAAAATCAGCCCGGTCATTGCTGCCATTCATCGCGAATACAATCAGACATGGAAAACACTGTATGACGAACTGGCCGATGGGCGCTGCTTCGc > 1:1992657/1‑100 (MQ=255) agaGGAAAAATCAGCCCGGTCATTGCTGCCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAg > 2:2314574/3‑100 (MQ=255) aCAGGAAAAATCAGCCCGGTCATTGCTGCCATTCCTCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGATTCGCAg < 1:1796476/100‑1 (MQ=255) cAGGAAAAATCAGCCCGGTCATTGCTGCCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGa < 2:551858/100‑1 (MQ=255) atgAAAAATCAGCCCGGTCATTGCTGCCATCCATCGCGAATACAAGAAGACATGGAAGACTCTGTATGACGAACTGGCTTATATGCGCTGCTTCGCAg < 1:1167737/96‑1 (MQ=255) atggtgtatacggagaagcacatccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAg > 2:1069566‑M2/74‑100 (MQ=255) ggtgtatacggagaagcacatccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGaa > 2:1173176‑M2/72‑100 (MQ=255) gtgtatacggagaagcacatccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGCAc > 1:3205165‑M2/71‑100 (MQ=255) gtatacggagaagcacatccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACtt > 2:1236288‑M2/69‑100 (MQ=255) cGGTCATTGCTGCCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGAt < 2:3139077/100‑1 (MQ=255) ggTCATTGCTGCCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATg < 2:2256611/100‑1 (MQ=255) gTCATTGCTGCCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGAt < 1:2855338/98‑1 (MQ=255) tccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGAt < 2:2052235‑M2/49‑1 (MQ=255) tccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGAt < 1:3159106‑M2/49‑1 (MQ=255) tccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGCATGCCTGCGAt < 1:2624724‑M2/49‑1 (MQ=255) ccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCTTGCGATc < 2:1791765‑M2/50‑1 (MQ=255) ccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATc < 1:675190‑M2/50‑1 (MQ=255) ccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATc > 2:2159925‑M2/51‑100 (MQ=255) ccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATc > 2:1751057‑M2/51‑100 (MQ=255) gtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCaa > 2:1634921‑M2/49‑100 (MQ=255) cATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCaa < 1:3035957/100‑1 (MQ=255) tatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAAt < 1:1751049‑M2/53‑1 (MQ=255) tCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATg < 1:2727889/100‑1 (MQ=255) atacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATg < 2:64557‑M2/54‑1 (MQ=255) atacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATg < 2:2375020‑M2/54‑1 (MQ=255) tacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGc < 1:1356897‑M2/55‑1 (MQ=255) tacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGc > 1:1932411‑M2/46‑100 (MQ=255) acaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGcc < 1:431896‑M2/56‑1 (MQ=255) acaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGcc < 1:415157‑M2/56‑1 (MQ=255) acaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGcc < 1:1109415‑M2/56‑1 (MQ=255) acaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGcc < 2:101050‑M2/56‑1 (MQ=255) acaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACCTGATGGTATGCCTGCGATCAATGcc > 1:1868740‑M2/45‑100 (MQ=255) caccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACCGGCAGCACTTGATGGTATGCCTCCGATCAATGCCa > 2:2761768‑M2/44‑100 (MQ=255) caccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCa < 2:1683442‑M2/57‑1 (MQ=255) caccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCa < 2:745454‑M2/57‑1 (MQ=255) caccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCa > 2:804307‑M2/44‑100 (MQ=255) catgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAAc < 1:248804‑M2/60‑1 (MQ=255) catgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAAc < 1:1566522‑M2/60‑1 (MQ=255) tgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCTATCAATGCCAAACgt > 2:3361659‑M2/39‑100 (MQ=255) tgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACgt > 2:1399123‑M2/39‑100 (MQ=255) gttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACgtg > 2:279287‑M2/38‑100 (MQ=255) gttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACgtg > 2:1859254‑M2/38‑100 (MQ=255) gCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGttt > 1:603879/1‑100 (MQ=255) atcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGttt < 2:2817427‑M2/66‑1 (MQ=255) cAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTCTGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTa > 1:960504/1‑100 (MQ=255) ggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTAcc > 1:1006368‑M2/32‑100 (MQ=255) ggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTAcc > 2:591369‑M2/32‑100 (MQ=255) gagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCg < 1:2641516‑M2/70‑1 (MQ=255) cATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCgg < 1:76579/100‑1 (MQ=255) gagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGa > 2:1974307‑M2/29‑100 (MQ=255) gagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCGGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCgg < 2:3020187‑M2/71‑1 (MQ=255) agctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGa < 2:1548987‑M2/72‑1 (MQ=255) gctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATc > 1:908468‑M2/27‑100 (MQ=255) ctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCa < 1:838100‑M2/75‑1 (MQ=255) ctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCa > 2:2889341‑M2/26‑100 (MQ=255) ctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCa < 2:1291183‑M2/75‑1 (MQ=255) tgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCAt < 2:2576093‑M2/76‑1 (MQ=255) gccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATg > 2:2231922‑M2/24‑100 (MQ=255) gccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATg > 2:921257‑M2/24‑100 (MQ=255) gccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATg > 1:1044248‑M2/24‑100 (MQ=255) gccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATg > 1:3250017‑M2/24‑100 (MQ=255) gccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTAGGCCTGCGATAAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCAt > 1:3375235‑M2/24‑99 (MQ=255) gccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGCATGCCTGCGATCAATGCGAAAGGTGTTTACCGGATAATg > 1:2555825‑M2/24‑100 (MQ=255) ccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATgc < 1:1698325‑M2/78‑1 (MQ=255) ccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGATGCTTCGAAGAGAGGCAGAACTTGGTGGTATGCCTGTGATCAATGCAAAACGTGTTTACCGGATGATgc > 1:1424696‑M2/23‑100 (MQ=255) aacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCGATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATgcgc > 1:1723934‑M2/21‑100 (MQ=255) aacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATgcgc > 2:134674‑M2/21‑100 (MQ=255) cgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCa > 2:3297380‑M2/19‑100 (MQ=255) cgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCa > 2:2940411‑M2/19‑100 (MQ=255) atggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGaa > 2:2636078‑M2/16‑100 (MQ=255) ggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGTCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATg < 1:640333‑M2/87‑1 (MQ=255) gttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATgc > 1:2776506‑M2/13‑100 (MQ=255) gttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATgc > 1:2331429‑M2/13‑100 (MQ=255) gttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATgc > 1:1223752‑M2/13‑100 (MQ=255) gttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATg > 1:3108838‑M2/13‑99 (MQ=255) gACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATgcgagatcggaa > 1:540493/1‑91 (MQ=255) tatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATgcgc < 2:506807‑M2/90‑1 (MQ=255) tatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATgcgc < 2:378744‑M2/90‑1 (MQ=255) tatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATgcgc > 1:2821758‑M2/11‑100 (MQ=255) cGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATgcgc > 1:2104869/1‑100 (MQ=40) cGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATgcgc < 1:2284670/100‑1 (MQ=40) atcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCt < 1:3315479‑M2/91‑1 (MQ=255) atcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGACGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCt < 1:2190076‑M2/91‑1 (MQ=255) tcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCt < 1:1279579‑M2/91‑1 (MQ=255) cgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGt < 2:1493134‑M2/93‑1 (MQ=255) gtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGtt < 1:2884391‑M2/94‑1 (MQ=255) tcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTg < 2:2002328‑M2/95‑1 (MQ=255) tGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTg < 1:299706/100‑1 (MQ=35) cgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGc > 1:354469‑M2/5‑100 (MQ=255) gggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCt > 2:704033‑M2/4‑100 (MQ=255) gggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCt > 1:1492907‑M2/4‑100 (MQ=255) ggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCtt > 2:2107681‑M2/3‑100 (MQ=255) ggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCtt > 2:2460102‑M2/3‑100 (MQ=255) ccTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCtt < 2:1104355/100‑1 (MQ=31) gTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTg < 1:1636591‑M2/99‑1 (MQ=255) gTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTg < 2:3195340‑M2/99‑1 (MQ=255) gTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTg > 2:296686‑M2/2‑100 (MQ=255) | GTACACTGAAAATTCAACAGGAAAAATCAGCCCGGTCATTGCTGCCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTG > NC_000913/1650746‑1650941 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |