| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,793,843 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (‑160/‑140) | yibB ← / → hldD | YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3187426 | NA (NA) | 165 (1.170) | 99/198 | 0.1 | 100% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3793847 | 0 (0.000) | intergenic (‑164/‑140) | yibB/hldD | YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding | |||||
| * | ? | NC_000913 | 3793843 = | 0 (0.000) | 153 (1.090) | 93/198 | 0.2 | 100% | intergenic (‑160/‑144) | yibB/hldD | YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding |
| ? | NC_000913 | 4498181 = | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 316 total aligned reads displayed.
CTGTATATTATCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATT > NC_000913/3793744‑3793941 | tcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaa < 2:2634726‑M1/1‑1 (MQ=255) tGTATATTATCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGAc < 2:3015526/100‑1 (MQ=255) caatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggggattcagggggccagtctaAc > 1:811463‑M1/99‑100 (MQ=255) caatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaAc < 1:2592312‑M1/2‑1 (MQ=255) aatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACt > 2:2973309‑M1/98‑100 (MQ=255) atcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTa < 1:3163144‑M1/4‑1 (MQ=255) atatTATCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAg < 2:3314832/100‑1 (MQ=255) catctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGc > 2:3186772‑M1/95‑100 (MQ=255) attatCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtg > 1:2279193‑M2/1‑98 (MQ=255) atCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGTCATGAAGGACTAGtggat < 1:1765449‑M2/100‑6 (MQ=255) ctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAAccc < 2:387406‑M1/14‑1 (MQ=255) ctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAAccc > 2:3078102‑M1/87‑100 (MQ=255) aTTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgc < 1:850013‑M2/100‑10 (MQ=255) aTTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgc < 1:2047107‑M2/100‑10 (MQ=255) ttCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGGAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcc > 1:2184297‑M2/1‑90 (MQ=255) ttCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcc < 1:3097982‑M2/100‑11 (MQ=255) ttCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcc > 1:1263025‑M2/1‑90 (MQ=255) ttCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcc > 2:47401‑M2/1‑90 (MQ=255) ttCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcc < 1:1171057‑M2/100‑11 (MQ=255) ccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCaa < 2:2942807‑M1/16‑1 (MQ=255) cAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccc > 2:2595764‑M2/1‑88 (MQ=255) cAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccc < 2:1565062‑M2/100‑13 (MQ=255) atgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACt > 2:2895424‑M1/82‑100 (MQ=255) nttcCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatt < 2:2685473‑M2/99‑19 (MQ=255) ctagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGtt < 2:2498807‑M1/23‑1 (MQ=255) cTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatt < 1:2058397‑M2/100‑19 (MQ=255) cTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatt < 2:1449402‑M2/100‑19 (MQ=255) cTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCAAGAAGGACTAGtggatttgcccctatatt < 1:1421527‑M2/100‑19 (MQ=255) ttCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatattt < 1:551014‑M2/100‑20 (MQ=255) tctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTttgtt < 2:1020063‑M1/27‑1 (MQ=255) gTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccag < 1:948853‑M2/100‑24 (MQ=255) ctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTttgttg < 2:1918213‑M1/28‑1 (MQ=255) ctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTttgttg < 1:3302245‑M1/28‑1 (MQ=255) taaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGc < 1:3342062‑M1/29‑1 (MQ=255) aaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCa < 1:2947516‑M1/30‑1 (MQ=255) aaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCaa < 1:2372336‑M1/31‑1 (MQ=255) aaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCaa < 2:570774‑M1/31‑1 (MQ=255) aaaactagtatgaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCaa < 1:1045574‑M1/31‑1 (MQ=255) actagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTa > 2:3236612‑M1/67‑100 (MQ=255) tCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgt > 2:785595‑M2/1‑69 (MQ=255) agtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCa > 1:2243390‑M1/64‑100 (MQ=255) gacaaccaatatcacttaaataagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATc < 1:62758‑M1/39‑1 (MQ=255) attaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcggggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATcc < 1:1967508‑M1/40‑1 (MQ=255) cATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatca > 1:3459017‑M2/1‑64 (MQ=255) taagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGcatcaga < 2:1602658‑M1/42‑4 (MQ=255) tCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcact > 1:1878315‑M2/1‑62 (MQ=255) agactgtcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGc > 2:949356‑M1/57‑100 (MQ=255) actatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCAc < 1:1691295‑M1/46‑1 (MQ=255) ttccgatctctaaagcactATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacc > 1:1607528‑M2/10‑57 (MQ=255) tGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatt > 2:353655‑M2/1‑53 (MQ=255) tGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatt > 1:2430832‑M2/1‑53 (MQ=255) acttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTa > 1:2647089‑M1/49‑99 (MQ=255) gATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatta > 2:295361‑M2/1‑52 (MQ=255) cttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATg < 2:2768791‑M1/53‑1 (MQ=255) tatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTa < 2:1774154‑M1/55‑1 (MQ=255) tACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattaca < 1:743888‑M2/100‑51 (MQ=255) aCTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaa > 1:500728‑M2/1‑49 (MQ=255) cTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaag < 1:1323368‑M2/100‑53 (MQ=255) tAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGCAGGACTAGtggatttgcccttatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagc > 1:1934464‑M2/1‑47 (MQ=255) aaaGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcc > 1:3529986‑M2/1‑46 (MQ=255) tctgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTATATGTAAAGGGc > 2:2325842‑M1/40‑100 (MQ=255) agtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGc > 2:517350‑M1/40‑100 (MQ=255) aGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccg > 2:1323374‑M2/1‑44 (MQ=255) aCTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctg < 1:15066‑M2/100‑60 (MQ=255) tattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAg > 1:1567921‑M1/35‑100 (MQ=255) tattggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAg > 2:604374‑M1/35‑100 (MQ=255) tATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgcc > 2:2882389‑M2/1‑39 (MQ=255) attggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAgg > 1:3194275‑M1/34‑100 (MQ=255) attggttgtctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAgg > 1:461439‑M1/34‑100 (MQ=255) ttCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgc > 2:2058410‑M2/1‑37 (MQ=255) cacaTGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcag > 1:3046838‑M2/1‑35 (MQ=255) cacaTGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcag > 1:2521173‑M2/1‑35 (MQ=255) caTGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagat > 1:2006124‑M2/1‑33 (MQ=255) caTGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagat < 1:2790294‑M2/100‑68 (MQ=255) caTGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAAtggattcgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagat > 1:2480905‑M2/1‑33 (MQ=255) ctggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGAt < 2:2026811‑M1/76‑1 (MQ=255) tggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGAtg < 1:435273‑M1/77‑1 (MQ=255) ggagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGAtgt < 2:45401‑M1/78‑1 (MQ=255) gagattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGAtgtg > 2:2261372‑M1/22‑100 (MQ=255) aaCCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccg < 2:2424831‑M2/100‑75 (MQ=255) aaCCAACATCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccg > 2:1716898‑M2/1‑26 (MQ=255) gattcagggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGAt > 2:1045578‑M1/20‑100 (MQ=255) tcagggggccagtctaACGAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGt > 1:3259282‑M1/17‑100 (MQ=255) tCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagc > 2:3136018‑M2/1‑18 (MQ=255) tCCGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagc > 2:3296203‑M2/1‑18 (MQ=255) ggggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGa > 2:847267‑M1/13‑100 (MQ=255) caccatGAAGGACAAGtggatttgcccctataattccagacaactgatatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcga < 2:2383470‑M2/98‑85 (MQ=255) cGCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcga < 2:1404967‑M2/100‑85 (MQ=255) ggccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGatggtaagatc < 1:3000829‑M1/90‑6 (MQ=255) gCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgat > 2:2135263‑M2/1‑15 (MQ=255) gCCATGAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgat < 2:1482233‑M2/100‑86 (MQ=255) gccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTa > 1:387405‑M1/10‑100 (MQ=255) ccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTAc < 2:359636‑M1/92‑1 (MQ=255) ccagtctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTAc < 2:1953366‑M1/92‑1 (MQ=255) gAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataaccc > 1:2327964‑M2/1‑10 (MQ=255) gAAGGACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataaccc > 2:22420‑M2/1‑10 (MQ=255) ctaACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGAc > 1:702641‑M1/4‑99 (MQ=255) gACTAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcg < 1:1254759‑M2/100‑95 (MQ=255) aACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACAtt > 2:1160740‑M1/2‑100 (MQ=255) aACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACAtt < 2:813942‑M1/99‑1 (MQ=255) | CTGTATATTATCCATTCAAATGCTTCCGTTATTTATCATACATCGGAATATTGATACTAAAGCACTATTCACATGCAAAACCAACATCCGCCATGAAGGACTAGCTAAAACCCAAACTAGTTTGTTGCAATTAGCATCCTTGCACCTCTATGTAAAGGGCTGAAGGGATTCGGATGTGATGGTATGATTACAGACATT > NC_000913/3793744‑3793941 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |