Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,183,345:1 | +T | 15.4% | intergenic (+22/+468) | zupT → / ← ribB | zinc transporter/3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,183,345 | 1 | . | T | 15.4% | 675.9 / 136.0 | 201 | intergenic (+22/+468) | zupT/ribB | zinc transporter/3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (98/72); new base T (19/12); total (117/84) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.43e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
CCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGC > NC_000913/3183246‑3183444 | cTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCa > 2:3390473/1‑100 (MQ=255) cTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCAGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCa > 1:2197949/1‑100 (MQ=255) tagggCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGAATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCAt < 2:474789/97‑1 (MQ=255) tATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGGTAAAAACATCATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCAt > 1:2604737/1‑100 (MQ=255) gTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACaa > 2:2889516/1‑100 (MQ=255) tACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAAc < 2:751969/100‑1 (MQ=255) aCTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGTTGCTACAAACGGCGGAAATCAGAAAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAAc < 1:2102583/99‑1 (MQ=25) aCTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACt < 2:1052421/100‑1 (MQ=39) tATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACtt < 1:3308223/99‑1 (MQ=39) tATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTc < 2:185489/100‑1 (MQ=39) tATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTc > 2:1002876/1‑100 (MQ=255) aTGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGTGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCt < 2:131924/100‑1 (MQ=38) aTGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCt < 2:3280427/100‑1 (MQ=38) gtgGAATTAGAGTGATGGTGGTCAGTCGCGTGCTGTTACCGACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACTGCAGAAGTTCTCTA‑GCGCATGGACAAGTTccag < 1:1705179/100‑4 (MQ=255) gtgGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCt < 1:2123793/98‑1 (MQ=38) gtgGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGc > 1:466176/1‑100 (MQ=255) gtgGAATGTCAGTGATGGGATTCAGGTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAGGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGc < 1:1132041/100‑1 (MQ=255) gtgCAATGTAAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTg < 1:2943773/99‑1 (MQ=37) ggAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTgatg < 2:2987449/100‑4 (MQ=38) ggAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCa > 1:3536773/1‑100 (MQ=255) ggAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCa < 2:2052747/100‑1 (MQ=255) aaTGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGc < 2:260432/100‑1 (MQ=255) cAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCAc > 1:195580/1‑100 (MQ=255) cAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCAc > 1:1267218/1‑100 (MQ=255) gTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGa < 2:1949777/100‑1 (MQ=255) tGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGaa < 2:3034631/100‑1 (MQ=255) gATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGaaa > 2:3053694/1‑100 (MQ=255) gATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGaaa > 1:2971574/1‑100 (MQ=255) aTGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAg < 2:1613176/100‑1 (MQ=255) aTGGGAGTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAg < 2:2399810/100‑1 (MQ=255) tGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGc > 2:3143430/1‑100 (MQ=255) tGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGc > 1:353016/1‑100 (MQ=255) gggATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGcc < 2:3816713/100‑1 (MQ=255) ggATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCt > 2:2464633/1‑100 (MQ=255) aTTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTa < 1:2734192/100‑1 (MQ=255) tcagggtAGTGCGGCGATAAACGGAGGTGTTTGGTTAAAAACAGTATCAGAAGTAGTCCA‑CGGCATGGGCAACTTCTGCCGGCTTCACGAAAGCCTTAtt < 1:3349851/94‑1 (MQ=255) aGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGCATTGGTTAAACACAACATCAGCAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAGCTTCTGGCAGCTTCACGATAGCCTTAtt < 1:3744436/98‑1 (MQ=255) aGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCt < 1:2434756/100‑1 (MQ=255) tttAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAAGTGGTTAAAAACAACGTCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCCGCTGCACGAAAGCCTTATTCTAc < 1:3252151/100‑1 (MQ=255) ttAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTAcc < 2:3108944/100‑1 (MQ=255) tAGTGCTGCTACAAACGGCTGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGTACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTAcc < 2:3642697/99‑1 (MQ=255) aGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTTACGAAAGCCTTATTCTACCt < 1:2366040/99‑1 (MQ=255) gctgctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTc > 1:2413262/1‑100 (MQ=255) gctgctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGAACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTc > 2:2119693/1‑100 (MQ=255) tgctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCgg < 2:333815/100‑1 (MQ=255) gctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGc < 2:2312662/100‑1 (MQ=255) gctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGc > 2:409469/1‑100 (MQ=255) gctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGc < 1:247696/100‑1 (MQ=255) gctACAAACGGCGGGAATTGGTCAAAAACAACATCAGAAGTTGTACA‑GCGCATGGACACCTTCTGCCCGCTACACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGc < 1:3658552/100‑1 (MQ=255) ctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTCATTCTACCTTTTCGGCt < 1:3037598/100‑1 (MQ=255) ctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTACTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCt > 2:50069/1‑100 (MQ=255) tACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTg > 1:1464853/1‑100 (MQ=255) aCAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGt > 1:864143/1‑100 (MQ=255) aCAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGt > 1:2139807/1‑100 (MQ=255) cAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtc > 2:3518404/1‑100 (MQ=255) aaaCGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtct > 1:3204119/1‑100 (MQ=255) aaaCGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtct > 1:2765134/1‑100 (MQ=255) cggcggGAATTGGTTAAAAGCAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGTATGGACAACTTCTGCCAGCTTCCCGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctct < 1:2225820/99‑1 (MQ=255) cggcggGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctctt > 2:608220/1‑100 (MQ=255) cggGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTTCCTTTTCGGCTGtctcttctc < 1:3074040/100‑1 (MQ=255) gggAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTATACCTTTTCGGCTGtctcttctct > 1:1902922/1‑100 (MQ=255) ggAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTtctctc < 2:667166/100‑1 (MQ=255) ggAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTtctctc > 2:220950/1‑100 (MQ=255) gAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCGA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTGGCGGCTGTCTCTTCTCTCg < 1:1586088/100‑1 (MQ=255) gAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCg < 1:1061325/100‑1 (MQ=255) 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2:689741/1‑100 (MQ=255) aaaaaCAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTa > 1:3556350/1‑100 (MQ=255) aaaCAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAg < 2:3556376/100‑1 (MQ=255) aacaTCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTAtt < 2:2991179/100‑1 (MQ=255) aacaTCAGAAGTTGTCCA‑GCGCAGGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCGTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTAt < 2:253682/99‑1 (MQ=255) acaTCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTAt < 1:1920742/98‑1 (MQ=255) caTCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTg < 1:404459/100‑1 (MQ=255) caTCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTg > 2:1677306/1‑100 (MQ=255) caTCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTg > 2:792266/1‑100 (MQ=255) aTCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGt > 1:2449061/1‑100 (MQ=255) aTCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGt > 2:1968704/1‑100 (MQ=255) aTCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTCCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGt > 1:342649/1‑100 (MQ=255) cAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTc > 1:2876207/1‑100 (MQ=255) aGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTcc > 2:1357124/1‑100 (MQ=38) gAAGTTTTCTA‑GCGCATGGATATCTTTTGTCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTATCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTACGTATTTGtt < 1:1678144/97‑1 (MQ=255) gAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCcg > 1:1410709/1‑100 (MQ=39) gAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCcg > 2:891348/1‑100 (MQ=39) gAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCcg > 1:284988/1‑100 (MQ=39) gAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCcg > 2:26469/1‑100 (MQ=39) gAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCACTCATACTGTTTAAGTATTTCtt > 1:1458425/1‑97 (MQ=37) gAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCcg > 1:1768226/1‑100 (MQ=255) aaGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCcgc > 1:70939/1‑100 (MQ=39) gTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCgcgc > 2:1211195/1‑100 (MQ=39) ttGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCt < 1:817332/100‑1 (MQ=255) ttGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCt < 2:1927584/100‑1 (MQ=255) ccA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCaa > 2:1065476/1‑100 (MQ=255) cA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAg > 2:2246231/1‑100 (MQ=255) a‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGc < 2:2176138/100‑1 (MQ=255) | CCCAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGC > NC_000913/3183246‑3183444 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |