| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4344813 = | NA (NA) | 12 (0.100) | 7/160 | NT | NA | intergenic (+23/+116) | melB/yjdF | melibiose:sodium symporter/DUF2238 family inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | 4344842 = | NA (NA) | noncoding (28/95 nt) | RIP327 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences and 1 IHF site | RIP327 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences and 1 IHF site | |||||
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
GTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATC > NC_000913/4344743‑4344941 | atgcctgatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCAc > 2:992279‑M1/71‑100 (MQ=255)atgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCAc > 2:992838‑M1/71‑100 (MQ=255)atgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCAc > 2:992666‑M1/71‑100 (MQ=255)atgccggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCAc > 2:2379036‑M1/71‑100 (MQ=255) ttCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACg < 2:978434/100‑1 (MQ=255) cATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTc > 2:432272/1‑100 (MQ=255) tGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCtt > 2:1260364/1‑100 (MQ=255) tGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCtt > 2:3418945/1‑100 (MQ=255) ggatgcggcgtgaattccttatccggtctacaaaatttgcaaatccaaagcattacattaagacgTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTctn > 1:859964‑M1/66‑99 (MQ=255) acTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTta < 2:1362440/99‑1 (MQ=255) cTGCTATTCCGGTCGGTGCAGTGAGGGATGTGAAAGCCTGACGTGGTCAATAGCTAACGAAAATGGCATGATGCGATATGTTTATCCGGCCAAGTCTtaa > 1:2555996/1‑100 (MQ=255) cTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTtaa < 1:1005026/100‑1 (MQ=255) tgtcatTCCGGTCGGTGCAGTGGGTTTTGTGAAAGCTTGACGTGGAAAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTtaat < 1:3434411/96‑1 (MQ=255) tGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTtaat > 1:2911143/1‑100 (MQ=255) tGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTtaat < 2:857038/100‑1 (MQ=255) gATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTtaatg < 2:2351799/100‑1 (MQ=255) gatctCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATTCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTtaatgt < 1:374375/96‑1 (MQ=255) tatTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCGTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCAATATGTTTATCAGGCCACGTCTtaatgta > 1:2318074/1‑100 (MQ=255) atTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTtaatgtaa > 1:339855/1‑100 (MQ=255) ccGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGc > 2:2894354/1‑100 (MQ=255) gtcggtGGAGTGAGTGTTGTGAAATCCGTACGTGGACAATAGCTTACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCttt < 1:1743974/100‑1 (MQ=255) cggtGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTgg < 2:3807663/100‑1 (MQ=255) cggtGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTgg < 2:527095/100‑1 (MQ=255) cggtGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTg < 2:1413123/99‑1 (MQ=255) ggtGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTg < 1:1077966/98‑1 (MQ=255) gtGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGAt < 1:3847896/100‑1 (MQ=255) gtGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGAt < 1:243943/100‑1 (MQ=255) gtGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGAt < 2:1169974/100‑1 (MQ=255) gtGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGAt > 2:15816/1‑100 (MQ=255) gtGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGAt < 1:2956243/100‑1 (MQ=255) gtGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGAt > 2:2669803/1‑100 (MQ=255) gCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGAttt < 2:3764155/100‑1 (MQ=255) cAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTg < 1:1260353/100‑1 (MQ=255) cAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTg < 2:532938/100‑1 (MQ=255) cAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTg < 1:473878/100‑1 (MQ=255) gtgagtgaTGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCa < 2:492223/100‑1 (MQ=255) agtgaTGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAAt < 2:3329339/100‑1 (MQ=255) gaTGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAAttt > 1:1920799/1‑99 (MQ=255) gaTGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTGATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAAtttt < 1:3505064/100‑1 (MQ=255) acgtgAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTg < 2:1992562/98‑1 (MQ=255) tgtgAAAGCCTGACGTGGATAATAGCTAACGAGAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTg < 1:2675420/99‑1 (MQ=255) tgtgAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGt < 2:3030200/100‑1 (MQ=255) tgAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTa > 2:3575350/1‑99 (MQ=255) gAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATTGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCATTGGATTTGCAAATTTTGTAGa > 2:769783/1‑100 (MQ=255) gAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGa > 1:799563/1‑100 (MQ=255) gAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGa > 2:3802863/1‑100 (MQ=255) atttgcaaatccaaagcattaaattaaaacgTGGCCTTATGCGATATGTTTATAATGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAg > 1:265379‑M1/32‑98 (MQ=255) aaGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGAcc < 2:1904409/100‑1 (MQ=255) ccTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGa > 1:21906/1‑100 (MQ=255) tGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATa < 2:2309201/100‑1 (MQ=255) gACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATaa > 2:3371554/1‑100 (MQ=255) cGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAgg > 1:1109492/1‑100 (MQ=255) cGTGGACAATAGCTAACGAAAAAGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTATTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAgg > 1:3331007/1‑100 (MQ=255) aCAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTc < 2:1945637/100‑1 (MQ=255) aaTAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCAc < 1:1233614/100‑1 (MQ=255) aTAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCAcg > 2:2900837/1‑100 (MQ=255) aGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCAcgcc < 1:2089399/100‑1 (MQ=255) gCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCAcgccg < 1:1502407/100‑1 (MQ=255) gCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCAcgccg > 2:1788218/1‑100 (MQ=255) cTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCAcgccgc > 2:1286646/1‑100 (MQ=255) tAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCa < 2:1473172/100‑1 (MQ=255) aaCGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCAt > 2:722986/1‑100 (MQ=255) aaCGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCAt > 2:1078628/1‑100 (MQ=255) nagacgtggcctgataaacatatcgcatcaggccaCGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATcc > 1:859964‑M2/36‑100 (MQ=255) aagacgtggcctgataaacatatcgcatcaggccaCGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATcc > 1:860427‑M2/36‑100 (MQ=255) gAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCg < 2:1543733/100‑1 (MQ=255) agacgtggcctgataaacatatcgcatcaggccaCGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCg > 1:630612‑M2/35‑100 (MQ=255) acgtggcctgataaacatatcgcatcaggccaCGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGc > 1:670590‑M2/33‑100 (MQ=255) cgtggcctgataaacatatcgcatcaggccaCGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCa > 1:947800‑M2/32‑100 (MQ=255) gtggcctgataaacatatcgcatcaggccaCGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCAt > 2:1171958‑M2/31‑100 (MQ=255) gtggcctgataaacatatcgcatcaggccaCGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCAt > 2:2379036‑M2/31‑100 (MQ=255) aTGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCAt < 2:2476429/100‑1 (MQ=255) TGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCa > 2:754646‑M1/1‑98 (MQ=255) TGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATc > 1:2606598‑M1/1‑100 (MQ=255) GGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAGTGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATca > 2:3838673‑M1/1‑100 (MQ=255) GCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTTACGCCGCATCCGGCATcaa > 1:1405071‑M1/1‑100 (MQ=255) GCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATcaa > 1:2976246‑M1/1‑100 (MQ=255) CCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTACTGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATcaac < 1:1197672‑M1/100‑1 (MQ=255) CCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATcaac < 2:3702796‑M1/100‑1 (MQ=255) CTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATcaaca > 1:1310016‑M1/1‑100 (MQ=255) TGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATcaaca > 1:3529918‑M1/1‑99 (MQ=255) TGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGc < 1:50345‑M1/100‑1 (MQ=255) TGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGc < 2:3102100‑M1/100‑1 (MQ=255) gCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAgcg > 1:366274/1‑100 (MQ=255) cGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAgcgc > 1:3581631/1‑100 (MQ=255) tttttgtcaggccaCGTCTTAATGTAATGCTTTGGAGTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAgt < 2:3470426‑M2/85‑1 (MQ=255) tGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAgtt > 2:3105219/1‑100 (MQ=255) gTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAgttg > 1:2179856/1‑100 (MQ=255) gTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCACCCGGCATCAACAAAGCGCACgtt > 1:3003598/1‑99 (MQ=255) ttATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAgttgtt > 2:3219077/1‑100 (MQ=255) tATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTa > 1:5292/1‑100 (MQ=255) atcaggccaCGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTAt > 1:1944809‑M2/10‑100 (MQ=255) aggccaCGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCg > 2:2789291‑M2/7‑100 (MQ=255) ggccaCGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCgg > 2:3651419‑M2/6‑100 (MQ=255) ggCCACGTCTTAGAGTAATGCGTTGGATTTGAAAATTTTGTAGACCGGATAAGAGATTCACGCCTCATCCTTCATCAACATAGCGCAAGTTGTTATCCg < 1:2066439/99‑1 (MQ=255) gccaCGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGt < 1:3105196‑M2/96‑1 (MQ=255) gccaCGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGt < 1:2890480‑M2/96‑1 (MQ=255) ccaCGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGCATTCACGCCGCATCCGCCACCAACAAAGCGCAAGTAGTTATCCGAtt > 1:3592358‑M2/4‑100 (MQ=255) caCGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTa < 1:29729‑M2/98‑1 (MQ=255) cGTCTTAATGTAATGCTTTAGATTTGCAAATTTTGTAGCCCGGATAAGGCATTCACGCCGCATCAGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTCTCCGGTtctc > 1:160423/1‑100 (MQ=25) | GTTCATGCTGATATTCCGGTCGGTGCAGTGAGTGATGTGAAAGCCTGACGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATGTAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATCAACAAAGCGCAAGTTGTTATCCGGTTATC > NC_000913/4344743‑4344941 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |