| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4359852 = | 114 (0.940) | 106 (0.880) | 74/198 | 0.6 | 49.4% | coding (180/1335 nt) | cadB | putative lysine/cadaverine transporter |
| ? | NC_000913 | = 4375338 | 103 (0.850) | coding (320/1029 nt) | epmB | EF‑P‑Lys34 lysylation protein; weak lysine 2,3‑aminomutase | |||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
TTACCTGCGAACCTAGCAAGTATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/4359950‑4359852‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AATACCACAACCGGGCGCTTTTGCTGGTCAAAGGCGGCTGCGCGGTAAATTGCCGCTATTGCTTCCGTCGTCACTTCCCCTATGCCGAAAATCAGGGCA < NC_000913/4375338‑4375240 TTACCTGCGAACCTAGCAAGTATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGA > 2:891675/1‑100TTACCTGCGAACCTAGCAAGTATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGA > 1:509558/1‑100 ACCTGCGAACCTAGCAAGTATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAAT < 2:2622539/100‑1 ACCTGCGAACCTAGCAAGTATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAAT > 2:556133/1‑100 CCTGCGAACCTAGCAAGTATCGGTGGTCTTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATA > 1:419428/1‑100 CCTGCGAACCTAGCAAGTATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATA > 1:420517/1‑100 CCTGCGAACCTAGCAAGTATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATA > 1:419477/1‑100 CTGCGAACCTAGCAAGTATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATAC < 2:2008769/100‑1 TGCGAACCTAGCAAGTATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGTAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACC > 2:956257/1‑100 GCGAGCATAGCAAGTATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACC < 1:746677/99‑1 GCGAACCTAGCAAGTATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCA > 1:931528/1‑100 CGAACCTAGCAAGTATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCAC < 1:2927156/100‑1 GAACCTAGCAAGTATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACA > 2:2888463/1‑100 AACCTAGCAAGTATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAA > 1:104353/1‑100 ACCTAGCAAGTATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAAC > 2:1408527/1‑100 CCTAGCAAGTATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTACATGCCCGACTGAATACCACAACC > 2:1713183/1‑100 CTAGCAAGTATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCG > 1:1360258/1‑100 CTAGCAAGTATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCG < 1:1378657/100‑1 CTAGCAAGTATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCG > 1:2966736/1‑100 TAGCAAGTATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGG > 2:2657919/1‑100 TAGCAAGTATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGG > 2:529123/1‑100 AGCAAGTATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGG < 2:2472840/100‑1 CAAGTATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCG < 1:2776363/100‑1 CAAGTATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCG < 1:2778132/100‑1 AGTATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCT > 2:2800287/1‑100 TATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCctt > 2:24184/1‑97 TATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCTTT > 1:2646641/1‑100 TATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCTTT > 1:2314298/1‑100 TATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCTTT > 2:2207724/1‑100 ATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCTTTT > 2:627606/1‑100 CGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCTTTTGC < 2:269411/100‑1 TGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGTAGTGTCGCTGGTGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCTTTTGCTGG < 2:509560/100‑1 TGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCTTTTGCTGG < 2:717556/100‑1 TGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCTTTTGCTGG < 2:1220791/100‑1 TGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCTTTTGCTGG > 2:831571/1‑100 TGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCTTTTGCTGG < 2:2741102/100‑1 GGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCTTTTGCTGGT > 2:2183410/1‑100 GTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCTTTTGCTGGTC < 1:276081/100‑1 TATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCTTTTGCTGGTCA < 1:739562/100‑1 TATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCTTTTGCTGGTCA > 2:935440/1‑100 cTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCTTTTGCTGGTCAAA < 1:2150006/99‑1 TTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCTTTTGCTGGTCAAA < 2:312372/100‑1 gcgATCTGGGGTTGGATTATCTCCATTATTAGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCTTTTGCTGGGCAAAGG > 1:2549326/4‑100 TATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCTTTTGCTGGTCAAAGGCG < 2:214797/100‑1 TATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCTTTTGCTGGTCAAAGGCG < 1:2556475/100‑1 CTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCTTTTGCTGGTCAAAGGCGGC < 2:676902/99‑1 GGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCTTTTGCTGGTCAAAGGCGGCTGCG > 2:1504158/1‑100 GGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCTTTTGCTGGTCAAAGGCGGCTGCGC > 2:1153037/1‑100 GGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCTTTTGCTGGTCAAAGGCGGCTGCGC < 1:2054328/100‑1 GTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCTTTTGCTGGTCAAAGGCGGCTGCGCG > 1:497030/1‑100 GTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCTTTTGCTGGTCAAAGGCGGCTGCGCG < 1:2937375/100‑1 GTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTGAATACCACAACCGGGCGCTTTTGCTGGTCAAAGGCGGCTGCGCG > 2:2079810/1‑100 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TTACCTGCGAACCTAGCAAGTATCGGTGGTATTGCTATCTGGGGTTGGATTATCTCTATTATTGGTGCAATGTCGCTGGCGTATGTATATGCCCGACTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/4359950‑4359852‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AATACCACAACCGGGCGCTTTTGCTGGTCAAAGGCGGCTGCGCGGTAAATTGCCGCTATTGCTTCCGTCGTCACTTCCCCTATGCCGAAAATCAGGGCA < NC_000913/4375338‑4375240 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |