| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 572,447 | IS2 (+) +5 bp | coding (80‑84/102 nt) | ylcH → | uncharacterized protein, DLP12 prophage |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 572447 = | 1 (0.010) | 127 (1.050) | 80/198 | 0.3 | 99.2% | coding (80/102 nt) | ylcH | uncharacterized protein, DLP12 prophage |
| ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 572451 | 1 (0.010) | 146 (1.220) | 93/196 | 0.0 | 99.3% | coding (84/102 nt) | ylcH | uncharacterized protein, DLP12 prophage |
| ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
TCCAGATAAGGCTGGATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/572545‑572447‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTA > NC_000913/1467910‑1468008 TCCAGATAAGGCTGGATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTT > 1:407373/1‑100 CCAGATAAGGCTGGATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTG > 1:1138826/1‑100 CCAGATAAGGCTGGATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTG < 1:2735847/100‑1 CCAGATAAGGCTGGATCTGCCGACCGATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTG > 2:318279/1‑100 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ATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATC < 1:2328990/100‑1 ATAGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATC < 1:540065/100‑1 AGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTG < 1:1650716/100‑1 AGCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATCTCCAGACATCTG < 2:1971218/100‑1 GCGGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGT > 1:1151702/1‑100 GGTGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTA > 1:1284025/1‑100 TGAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATC < 2:1378510/100‑1 GAAGTTGCCGCGATGTAATTTGATGCCGTCTTGTGAGAGGTTCACGCTTCCCCTCCGCAGAGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCA < 1:397289/100‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |