New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2728214 = | NA (NA) | 43 (0.350) | 9/170 | NT | NA | noncoding (971/2904 nt) | rrlG | 23S ribosomal RNA of rrnG operon |
? | NC_000913 | 2728240 = | NA (NA) | noncoding (945/2904 nt) | rrlG | 23S ribosomal RNA of rrnG operon |
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2728316‑2728214 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgtgTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTGGTAAGTCGGGATGACCCCCTTGCCGAAACAGTGCTCTACCCCCGGAGATGA > NC_000913/2728240‑2728338 GTTTCGGCAATGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACTGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC < 1:2344569/100‑1 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACTAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC > 1:157219/1‑100 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACGCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGCGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC > 1:2137855/1‑100 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGCCTGTTATCACGGGAGACACACGACGGGTGCTAACCTCCGTC > 1:2938599/1‑100 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC < 1:1158961/100‑1 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC < 1:441607/100‑1 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC > 2:1198504/1‑100 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC < 2:2126867/100‑1 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC > 2:3502579/1‑100 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC > 1:1872439/1‑100 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC > 1:172779/1‑100 TTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCG < 1:1747109/100‑1 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TTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCG < 2:2688271/100‑1 TTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCG < 2:3361413/100‑1 TTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCG > 1:1766985/1‑100 TTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTTCCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGT < 1:1208163/100‑1 TTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGT < 2:430368/100‑1 TTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGT < 2:1422887/100‑1 TCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTG < 2:660836/100‑1 TCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTG < 1:255073/100‑1 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CACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTGTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTGGTAAGTCGGGATGACCCCCTTGCCGA > 1:3038571/1‑100 CACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTGTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTGGTAAGTCGGGATGACCCCCTTGCCG > 1:1531681/1‑99 CACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTGTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCAGCGGGTTGGTAAGTCGGGATGACCCCCTTGCCGA > 1:1842012/1‑100 CACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTGTGTCTCCCGTGAGAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGAGGTGGTAAGTCGGGATGACCCCCTTGCCGA > 1:2812416/1‑100 CGTGTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTGGTAAGTCGGGATGACCCCCTTGCCGAAACAGTGCTCTACCCCCGGAGA < 2:3237142/100‑1 CGTGTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTGGTAAGTCGGGATGACCCCCTTGCCGAAACAGTGCTCTACCCCCGGAGA > 1:2576708/1‑100 CGTGTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTGGTAAGTCGGGATGACCCCCTTGCCGAAACAGTGCTCTACCCCCGGAGA < 1:1679756/100‑1 CGTGTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTGGTAAGTCGGGATGACCCCCTTGCCGAAACAGTGCTCTACCCCCGGAGA < 1:155047/100‑1 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |