| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3898629 = | NA (NA) | 12 (0.100) | 8/162 | NT | NA | intergenic (+20/+42) | cbrC/yieK | UPF0167 family protein/putative 6‑phosphogluconolactonase |
| ? | NC_000913 | 3898659 = | NA (NA) | intergenic (+50/+12) | cbrC/yieK | UPF0167 family protein/putative 6‑phosphogluconolactonase | |||||
AGCTGCATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3898735‑3898629‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tccggcctTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATC > NC_000913/3898659‑3898757 AGCTGCATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCT < 2:2419243/100‑1AGCTGCATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCT > 1:2625934/1‑100 GCTGCATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTC > 1:207914/1‑100 GCTGCATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTC > 1:2176032/1‑100 GCTGCATCCTTCGCTGATGGTAATCGAAGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTC > 1:542882/1‑100 CTGCATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCC < 2:2634237/100‑1 TGCATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCG > 2:80516/1‑100 TGCATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCG > 1:90312/1‑100 TGCATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCG < 1:3369146/100‑1 TGCATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCG > 1:3295211/1‑100 TGCATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTAAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCG > 1:1014735/1‑100 GCATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGG > 1:1063112/1‑100 cagCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCGGCAGAATTATCACTCGGTTGAGCTTAGGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCAGC < 1:1943353/97‑1 CATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGC > 2:1724459/1‑100 ATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCC < 2:2854472/100‑1 ATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCC > 1:311167/1‑100 ATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCC < 2:207915/100‑1 TCCTTCGCGGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACGCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGC < 2:224106/98‑1 ttaGCTGATGGTAATCGCTGATTAAACCGCTGCCTCGTAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGC < 1:1294867/92‑1 CTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCA > 1:2604364/1‑100 AGAAATAAGGCCGGCTGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAATCTTAACCGAGTGCTAATTCTTCGGCAGCGGCTTTATCAGCCATTACCATCAG > 1:1252261/1‑100 GAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGC > 2:1107968/1‑100 AAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGG > 1:682594/1‑100 AGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGA > 2:805854/1‑100 AGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGA > 2:3157359/1‑100 GGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGAT > 1:207054/1‑100 GGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGAT > 1:2758132/1‑100 GGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGAT > 2:3191117/1‑100 GGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGAT > 2:1417169/1‑100 GCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATG > 1:577737/1‑100 CCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGC > 2:2644178/1‑100 TCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTG < 2:1989991/100‑1 TCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTG > 1:119502/1‑100 TCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTG < 2:2987760/100‑1 CGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTtg < 1:546170/99‑3 CGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGA < 2:2295871/100‑1 CGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGA < 2:2595366/100‑1 GGCTTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGGGCTAATTCTGCTGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAA < 2:1454346/100‑1 GGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAA < 1:2854454/100‑1 GCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAAC < 2:607436/100‑1 CCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACA < 2:1692331/100‑1 CTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACAT > 2:2640867/1‑100 CTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACAT > 1:1345302/1‑100 CTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATGACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACAT > 2:161830/1‑100 TTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATC < 1:2766035/100‑1 AGCTGCATCCTTCGCTGATGGTAATCGCTGATAAAGCCGCTGCCGCAGAATTAGCACTCGGTTAAGCTTAAGAAATAAGGCCGGATGTGTGAATTACGCTCCGGCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3898735‑3898629‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tccggcctTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATC > NC_000913/3898659‑3898757 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |