Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,202,693 | C→G | 15.7% | P268R (CCG→CGG) | cca → | fused tRNA nucleotidyl transferase/2'3'‑cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase and phosphatase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,202,693 | 0 | C | G | 15.7% | 368.4 / 60.6 | 134 | P268R (CCG→CGG) | cca | fused tRNA nucleotidyl transferase/2'3'‑cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase and phosphatase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (58/55); new base G (13/8); total (71/63) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.77e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.54e-01 |
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
GCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGACTGG > NC_000913/3202595‑3202791 | gCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCcg > 1:164566/1‑100 (MQ=255) ctctCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCcgc > 2:916777/1‑100 (MQ=255) tctcAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCcgcg < 2:1351206/100‑1 (MQ=255) tctcAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCcgcg < 2:74109/100‑1 (MQ=255) tctcAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCcgcg < 2:683805/100‑1 (MQ=255) tcAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGtc < 2:1065121/100‑1 (MQ=38) cAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGtca > 2:184386/1‑100 (MQ=255) aaTGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGtcat < 2:2781199/100‑1 (MQ=255) aTGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGtcagc < 2:675465/100‑3 (MQ=38) aTGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGtcagc < 2:1289615/100‑3 (MQ=38) aTGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGtcagc < 2:2261051/100‑3 (MQ=38) gcggcgATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCGCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGtcagc < 1:1045206/97‑3 (MQ=37) ggcaatcttGAGTCCGCCGGTCTATGTCGGTTTCGCAACTTGATGCCACGATCTCGGTAAAGGCCTTACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTcatcat < 1:2336569/89‑1 (MQ=255) gcgATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCAtcatggtc > 2:396556/1‑100 (MQ=255) cgATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCAtcatggtca > 2:1029276/1‑100 (MQ=255) gATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCAtcatggtcat > 1:3212934/1‑100 (MQ=255) tGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCAtcatggtcatgg > 1:1043167/1‑100 (MQ=255) tGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCAtcatggtcatgg < 1:2051466/100‑1 (MQ=255) tGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCAtcatggtcatgg > 2:3222158/1‑100 (MQ=255) gCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGc < 2:3010051/100‑1 (MQ=255) gCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGc < 2:549784/100‑1 (MQ=255) tGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGccc < 2:152942/100‑1 (MQ=255) aGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCcgg > 1:900857/1‑100 (MQ=255) ccGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCcggcgg < 2:935493/100‑1 (MQ=255) ccGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCcggcgg < 2:2712935/100‑1 (MQ=255) cGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCggg > 1:1137201/1‑100 (MQ=255) cGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCggg < 1:1520652/100‑1 (MQ=255) cGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCggg < 2:1768386/100‑1 (MQ=255) gCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGgt < 2:1280722/100‑1 (MQ=255) cAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGgtg < 2:3540408/100‑1 (MQ=255) cAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGgtg < 2:3012746/100‑1 (MQ=255) gTCGATGTCCGTGTCGCCACTTTAGGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTa < 1:1928347/100‑1 (MQ=255) gATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGGACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTa < 1:1008032/97‑1 (MQ=255) gATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGt < 2:2140616/100‑1 (MQ=255) tGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTa < 2:1938590/100‑1 (MQ=255) tCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGt > 1:2979826/1‑100 (MQ=255) ccGTTTGGCTTCTGTATGCGACGGTCTCGGTAAAGGGCTGACGGCGCCAGAGCTCTGGCCGCGTCAGCATGGGGATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTg < 1:2340033/100‑1 (MQ=255) ccGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTg > 2:2326511/1‑100 (MQ=255) gTTTCGCCACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGa < 1:1354319/100‑1 (MQ=255) tttCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGaa < 2:2533979/100‑1 (MQ=255) tCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGaaca < 1:916771/100‑1 (MQ=255) tCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGaaca < 2:1533157/100‑1 (MQ=255) cGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGaacaa > 2:3082462/1‑100 (MQ=255) cGCAACTTTATGCCACGATATCGGTAAAGGGCTGACACCGCCAGAAATCTGGCCGCGTCAGCAGGGTAATGGCCCGGCGGGTGTAAAGATAGTGGcacga > 1:2322219/1‑98 (MQ=255) cAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACt > 1:594138/1‑100 (MQ=255) cTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATg < 1:709563/100‑1 (MQ=255) cTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATg < 2:894497/100‑1 (MQ=255) cTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATg < 2:2544627/100‑1 (MQ=255) tttATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGc < 2:291758/100‑1 (MQ=255) gCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCg < 2:3038258/100‑1 (MQ=255) gCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCg > 1:1239986/1‑100 (MQ=255) gCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCg > 1:3395326/1‑100 (MQ=255) gCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTAATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTAGGCCAGCg > 1:1555050/1‑100 (MQ=255) ccACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGt > 2:1985998/1‑100 (MQ=255) ccACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGt > 2:323505/1‑100 (MQ=255) ccACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGt > 2:724168/1‑100 (MQ=255) ccACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGt > 2:1436500/1‑100 (MQ=255) ccACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGt > 1:548230/1‑100 (MQ=255) ccACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGt > 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aGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAAt < 2:3520758/100‑1 (MQ=255) gggCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTTAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATg > 1:2500045/1‑100 (MQ=255) gggCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCAGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATg > 1:1972492/1‑100 (MQ=255) ggCTGAAGCCGCCAGACCTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAAt < 1:343047/98‑1 (MQ=255) gCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGaa < 2:549848/100‑1 (MQ=255) cTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGaaa < 1:817458/100‑1 (MQ=255) gACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAAtt > 1:3483793/1‑100 (MQ=38) gACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAAtt > 1:369664/1‑100 (MQ=38) gACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAAtt > 2:817012/1‑100 (MQ=38) gACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAAtt > 1:1154518/1‑100 (MQ=255) aCGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTc > 2:3136760/1‑100 (MQ=38) gatctccAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTcg < 2:2677343/95‑1 (MQ=255) cgcggcCAGAGTTCTGGCGGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTcg > 1:1423416/1‑100 (MQ=255) cgcggcCAGAGTTCTGGCGGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTcg > 1:3543049/1‑100 (MQ=255) cgcggcCAGAGTTCTGGCGGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCATGCCAAATGAAATTcg > 1:2079441/1‑100 (MQ=255) cgcggcCAGAGTTCTGGCGGCGTCATCATGGGAATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGACAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAACtt > 2:2645055/1‑98 (MQ=37) cgccgcCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTcg > 1:2979888/1‑100 (MQ=255) cgccgcCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTcg < 1:963832/100‑1 (MQ=255) ccgccAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATACCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTcg > 1:3253130/1‑98 (MQ=255) cgccAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGa > 2:2458852/1‑100 (MQ=255) cgccAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGa > 2:865049/1‑100 (MQ=255) gccAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGAt > 2:1831655/1‑100 (MQ=255) ccAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGAtt > 2:2427188/1‑100 (MQ=255) ccAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGAGAtc > 1:2677326/1‑99 (MQ=255) cAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGAttt < 1:532683/100‑1 (MQ=255) aGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTa > 1:2511933/1‑100 (MQ=255) gAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAg < 2:1444812/100‑1 (MQ=255) aCTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGcc > 2:3275544/1‑100 (MQ=255) aCTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGcc > 2:2548295/1‑100 (MQ=255) ctctGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCa > 2:1552602/1‑100 (MQ=255) ctctGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCa > 1:2831784/1‑100 (MQ=255) tctGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAg > 2:82070/1‑100 (MQ=255) tctGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAAGTCGCGATTTAGCCAg > 2:3499238/1‑100 (MQ=255) ggCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGACt > 2:3285750/1‑100 (MQ=255) | GCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGACTGG > NC_000913/3202595‑3202791 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |