| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,128,358 | 0 | G | A | 32.2% | 192.3 / 126.7 | 155 | A13V (GCT→GTT) | metJ | transcriptional repressor, S‑adenosylmethionine‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (40/63); new base A (16/33); total (58/97) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.29e-01 | |||||||||||
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
CCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGATGTGGGTACTG > NC_000913/4128260‑4128457 | ccTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGc > 2:408531/1‑100 (MQ=255) cTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAAGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAACg < 2:2458785/100‑1 (MQ=255) tGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGt < 1:1580393/100‑1 (MQ=255) tGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGt > 1:3361946/1‑100 (MQ=255) gacgacGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTa > 1:261130/1‑100 (MQ=255) gacgacGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAACGTa < 1:290858/100‑1 (MQ=255) cgacgCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATg < 2:3716885/100‑1 (MQ=255) cgacgCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATg < 2:263794/100‑1 (MQ=255) cgacgCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAACGTATg < 2:2006893/100‑1 (MQ=255) acgCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTATCATCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGCCTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAACGTATggg < 2:2319704/100‑1 (MQ=255) acgCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATggg < 2:1606978/100‑1 (MQ=255) cgcgTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGc < 1:1564433/100‑1 (MQ=255) cgcgTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGc > 1:3151772/1‑100 (MQ=255) gtgcgtTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGa < 2:2377391/100‑1 (MQ=255) tgcgtTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGat < 2:824995/100‑1 (MQ=255) gcgtTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGata < 1:593443/100‑1 (MQ=255) gcgtTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGata > 2:3396792/1‑100 (MQ=255) gcgtTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAACGTATGGGCTGata > 2:3164482/1‑100 (MQ=255) gcgtTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAACGTATGGGCTGata < 1:402698/100‑1 (MQ=255) gtTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAACGTATGGGCTGatata < 2:2206000/100‑1 (MQ=255) cATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTc < 1:2009899/100‑1 (MQ=255) cATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTc > 1:2205926/1‑100 (MQ=255) cATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAACGTATGGGCTGATATATTc > 2:3634719/1‑100 (MQ=255) cATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAACGCATGGGCTGATATATTc > 2:2268125/1‑100 (MQ=255) cGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTcgcc < 2:32080/100‑1 (MQ=255) tGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAACGTATGGGCTGATATATTCGCCGCt > 2:38327/1‑100 (MQ=255) gAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTc < 2:369002/100‑1 (MQ=255) aGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTcc < 1:2407366/100‑1 (MQ=255) ggATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCa > 1:1122853/1‑100 (MQ=255) ggATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCa < 1:2209629/100‑1 (MQ=255) ggATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCa > 2:423510/1‑100 (MQ=255) ggATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCCCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCa > 1:1915719/1‑100 (MQ=255) gATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCAt > 1:157823/1‑100 (MQ=255) aTTTTTAACCCCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTCGTTCAATCTTCTTGCCGTGCTCACCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCAtt > 1:2148710/1‑100 (MQ=255) aTTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCAtt > 1:447324/1‑100 (MQ=255) aTTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCAtt > 2:3738817/1‑100 (MQ=255) tttAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAACGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAg > 1:1874666/1‑100 (MQ=255) ttAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGc < 1:378754/100‑1 (MQ=255) ttAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGc < 2:1438956/100‑1 (MQ=255) ttAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGc < 1:787119/100‑1 (MQ=255) acacCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCAt > 1:2497716/1‑100 (MQ=255) cacCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAACGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATg < 2:1847439/100‑1 (MQ=255) ccTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATgag < 1:3396822/100‑1 (MQ=255) ccTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAACGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATgag > 1:2585213/1‑100 (MQ=255) cTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTTACTCTTCTTGCCGTGCTCACCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATgaga < 2:2115913/100‑1 (MQ=255) cTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATgaga < 1:1392129/100‑1 (MQ=255) tAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATa > 1:2424191/1‑100 (MQ=255) aaGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATAc < 2:2833228/100‑1 (MQ=255) agagGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACt < 1:780723/100‑1 (MQ=255) agagGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAACGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACt > 1:586269/1‑100 (MQ=255) agagGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAACGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACt < 1:3634751/100‑1 (MQ=255) ggAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAACGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTaa > 1:2895882/1‑100 (MQ=255) gAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCGGCCATGAGATACTTAAt < 2:2148692/100‑1 (MQ=255) gAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAACGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAAt > 2:538741/1‑100 (MQ=255) aTGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAACGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATcc < 2:161873/100‑1 (MQ=255) ggAAACCGTAATCTTTTTGACCTGTTCACTCTTATTGCCGTGCTCAACGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCctc > 2:2324069/1‑100 (MQ=255) cGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTc < 2:1390104/100‑1 (MQ=255) gTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCa < 2:630845/100‑1 (MQ=255) gTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCa < 1:2121851/100‑1 (MQ=255) tAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCaa > 2:2518392/1‑100 (MQ=255) tAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAACGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCaa < 2:1776061/100‑1 (MQ=255) aTCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAACGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATa < 2:586267/100‑1 (MQ=255) cTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATaaa > 1:1334099/1‑100 (MQ=255) tttGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAAtt < 2:3859564/99‑1 (MQ=255) tttGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAACGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTg < 1:1166520/100‑1 (MQ=255) ttGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTga < 2:1477509/100‑1 (MQ=255) tGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTgag < 2:2017139/100‑1 (MQ=255) tGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTgag < 1:985859/100‑1 (MQ=255) tGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAACGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTgag < 1:299158/100‑1 (MQ=255) gACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTGAACGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCGTCTTCGTCAATAAATTgaga < 2:2379730/100‑1 (MQ=255) gACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTgaga > 1:1310998/1‑100 (MQ=255) gACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTgaga > 1:540532/1‑100 (MQ=255) gACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTgaga > 1:556594/1‑100 (MQ=255) aCTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGagac < 1:3858747/100‑1 (MQ=255) cTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTgaga < 2:1011266/98‑1 (MQ=255) tGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAACGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGagaccag < 2:500421/100‑1 (MQ=255) gTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGagaccaga > 1:3042042/1‑100 (MQ=255) ttCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGagaccagac < 1:3447651/100‑1 (MQ=255) ttCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGagaccagac > 2:2531023/1‑100 (MQ=255) tctctctTCTTGCCGTGCTCAACGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGagaccagacc < 1:924407/97‑1 (MQ=255) tCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGagaccagacc < 1:1452888/100‑1 (MQ=255) tCACTCTTCTTGCCGTGCTCAACGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGagaccagacc < 2:3241936/100‑1 (MQ=255) ctctTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACcaca > 2:2827410/1‑100 (MQ=255) tcttctTGCCGTGCTCAACGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACcacac < 1:1356657/100‑1 (MQ=255) cttcttGCCGTGCTCAACGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACcacaca < 2:3463456/100‑1 (MQ=255) tcttGCCGTGCTCAACGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGt < 1:1110438/100‑1 (MQ=255) ttGCCGTGCTCAACGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTg < 2:333384/100‑1 (MQ=255) tGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGa > 1:139966/1‑100 (MQ=255) tGCCGTGCTCAACGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGa > 2:3526228/1‑100 (MQ=255) ccGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGAtg > 2:227085/1‑100 (MQ=255) ccGTGCTCAACGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGAtg < 2:3811684/100‑1 (MQ=255) tGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGATGTgg < 2:1295238/100‑1 (MQ=255) gCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGATGTggg < 2:3042016/100‑1 (MQ=255) gCTCAGCATATGGACGGATATGTTCGCCACTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATTCACTTCGTCAATAAATTAAGACCAGACCACCCAGTTGGTGTggg > 2:1794860/1‑100 (MQ=255) gCTCAACGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGATGTggg < 2:2585190/100‑1 (MQ=255) cAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGATGTGGGTAc > 1:1476858/1‑100 (MQ=255) cAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGATGTGGGTAc < 2:2695201/100‑1 (MQ=255) gCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGATGTGGGTACTg < 2:540531/100‑1 (MQ=255) gCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGATGTGGGTACTg < 2:1314615/100‑1 (MQ=255) gCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGATGTGGGTACTg < 1:1003013/100‑1 (MQ=255) | CCTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGATGTGGGTACTG > NC_000913/4128260‑4128457 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |