| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3620614 | NA (NA) | 10 (0.120) | 6/166 | NT | 100% | coding (1423/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 3620635 | 0 (0.000) | coding (1444/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
CAGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAAcgtcag‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3620516‑3620614‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT < NC_000913/3620635‑3620531 CAGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAAC < 2:974485/100‑1CAGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAAC < 1:1272611/100‑1 AGAGTACAGCCGGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCTCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCTCCACAACCAGTTAACG < 2:856681/100‑1 AGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACG < 2:820483/100‑1 AGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACG < 1:1709251/100‑1 AGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACG < 1:2092287/100‑1 gcGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGT < 2:1455225/98‑1 GAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGT > 2:666142/1‑100 GAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGT > 2:17413/1‑100 GAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTGAACGT < 2:512669/100‑1 GAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTAATATAACCACCAGAACCAGTTAACGT > 2:1449342/1‑100 GAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCACAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGT < 1:820604/100‑1 AGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTC < 1:847168/100‑1 GTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCA < 2:881174/100‑1 GTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCA < 1:2122312/100‑1 TACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAG < 2:573484/100‑1 TGACGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGT < 1:1413109/100‑1 TGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGT < 1:566738/100‑1 CGGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAA > 1:2356765/1‑100 GGGCCTCATCACGCGCATCACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAAC < 2:2356737/100‑1 tgcttttTCATGCTCATTACTACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAAC < 1:69656/92‑1 CCAGTTAACGTCAGCC‑ACCGGGCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGTTTATGCGCGTGATGAGG > 1:1064790/1‑100 CCAGTTAACGTCAGCC‑ACCGGGCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGG > 2:1639592/1‑100 CCAGTTAACGTCAGCC‑ACCGAGCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCCATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATG > 2:343312/1‑97 CAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGC > 1:349099/1‑100 AGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCC > 1:18331/1‑100 GTTAACGTCAGCC‑ACCGGGCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCC > 2:74831/1‑100 TAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGT > 2:2033343/1‑100 CGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCAC < 1:1325196/100‑1 CGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCAC > 1:120362/1‑100 CGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCA > 1:855394/1‑99 CGTCAGGA‑CTGGTGGCTGTCGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTTGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCAC < 2:205178/100‑1 ggCAGGC‑CCGGTGGGTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTC < 2:1983255/95‑1 GTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACC < 1:1458939/100‑1 GTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACC > 1:2301959/1‑100 CAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCAC < 1:956712/100‑1 CAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCAC < 2:921641/100‑1 AGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACA < 2:783658/100‑1 GGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT > 2:1631282/1‑100 GGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT > 1:919505/1‑100 CAGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAAcgtcag‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3620516‑3620614‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACAT < NC_000913/3620635‑3620531 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |