| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1468596 = | NA (NA) | 22 (0.270) | 10/166 | NT | 47.6% | noncoding (645/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1650887 | 26 (0.300) | noncoding (45/706 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 315 total aligned reads displayed.
GCCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACCGCCATCGAAACGGGCACATACAGGCA > NC_000913/1650789‑1650986 | tcagtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGTAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGAt < 2:452561‑M2/49‑1 (MQ=255) ccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATc < 2:291050‑M2/50‑1 (MQ=255) ccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATc < 2:2097560‑M2/50‑1 (MQ=255) ccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATc > 1:347011‑M2/51‑100 (MQ=255) ccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATc < 2:775061‑M2/50‑1 (MQ=255) tatacaccatgttatcggagagctgccaacttatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAAt < 2:1962607‑M2/53‑1 (MQ=255) tatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAAt > 1:1198176‑M2/48‑100 (MQ=255) tatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAAt < 2:1630280‑M2/53‑1 (MQ=255) tatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatgggtatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAATTTGATGGTATGCCTGCGATCAAt > 2:1147752‑M2/48‑100 (MQ=255) atacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATg < 1:1990140‑M2/54‑1 (MQ=255) gcgAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGcc > 1:168176/1‑100 (MQ=255) acaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGcc > 1:1734189‑M2/45‑100 (MQ=255) gaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCa > 2:910575‑M2/44‑100 (MQ=255) caccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTGTGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCa > 1:654185‑M2/44‑100 (MQ=255) caccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCa < 2:1563782‑M2/57‑1 (MQ=255) caccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCa > 1:1800221‑M2/44‑100 (MQ=255) ccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCaaa > 1:37562‑M2/42‑100 (MQ=255) ccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCaaa > 1:854554‑M2/42‑100 (MQ=255) ccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCaaa > 2:2052161‑M2/42‑100 (MQ=255) gttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACgtg > 1:1535275‑M2/38‑100 (MQ=255) cAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCaaaag > 1:122180/1‑96 (MQ=255) ttatcggagagctgtcaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATAAATGCCAAACgtgt < 2:1031417‑M2/64‑1 (MQ=255) ttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACgtgt > 1:769314‑M2/37‑100 (MQ=255) tatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGtt < 1:549628‑M2/65‑1 (MQ=255) atcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGttt > 2:934831‑M2/35‑100 (MQ=255) cggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTAc > 2:588207‑M2/33‑100 (MQ=255) cggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTAc > 2:541376‑M2/33‑100 (MQ=255) ggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTAcc > 2:386220‑M2/32‑100 (MQ=255) agagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCgg < 2:2189779‑M2/71‑1 (MQ=255) tGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGACAAACGCGTTTACCGGa > 2:749835/1‑99 (MQ=255) agctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGAt < 1:1949374‑M2/73‑1 (MQ=255) agctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGAt < 2:1908049‑M2/73‑1 (MQ=255) gctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATc > 2:817372‑M2/27‑100 (MQ=255) ctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCa < 1:2203024‑M2/75‑1 (MQ=255) ctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCa > 2:127209‑M2/26‑100 (MQ=255) ctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCa > 2:1413002‑M2/26‑100 (MQ=255) ctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCa < 1:802652‑M2/75‑1 (MQ=255) ctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCa < 2:1695158‑M2/75‑1 (MQ=255) tgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCa > 2:11755‑M2/25‑99 (MQ=255) tgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCAt > 1:494764‑M2/25‑100 (MQ=255) gccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATg > 1:162821‑M2/24‑100 (MQ=255) gccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATg > 2:442222‑M2/24‑100 (MQ=255) gccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATg > 2:415654‑M2/24‑100 (MQ=255) gccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATg > 2:888527‑M2/24‑100 (MQ=255) ccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATgc > 2:186940‑M2/23‑100 (MQ=255) ccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATgc < 1:1757678‑M2/78‑1 (MQ=255) ccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATgc > 2:2235695‑M2/23‑100 (MQ=255) caacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACATGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATgcg > 2:334358‑M2/22‑100 (MQ=255) acacTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATgcg < 1:1856235/100‑1 (MQ=255) aacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATgcgc < 1:2020825‑M2/80‑1 (MQ=255) aacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATgcgc > 2:697186‑M2/21‑100 (MQ=255) tGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAg < 1:1353944/100‑1 (MQ=255) ggATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAATTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCCTGCGCCAGa > 1:943555/1‑100 (MQ=255) ggATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGa < 1:32178/100‑1 (MQ=255) atggttatcgtcgggTATTGGCGCTGCTTCGCAGACAGGGAGAACTTGCTGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGaa < 2:1069191‑M2/85‑1 (MQ=255) atggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGaa < 1:2087650‑M2/85‑1 (MQ=255) ggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATg < 2:26100‑M2/87‑1 (MQ=255) gttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATAATGCGCCAGAATg > 2:1467113‑M2/13‑99 (MQ=255) tatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATgcgc < 2:1192965‑M2/90‑1 (MQ=255) tatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATgcgc < 1:145909‑M2/90‑1 (MQ=255) tatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATgcgc < 1:1931565‑M2/90‑1 (MQ=255) tatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATgcgc < 1:2212901‑M2/90‑1 (MQ=255) atcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCt > 1:1484637‑M2/10‑100 (MQ=255) cgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGt < 2:2269674‑M2/93‑1 (MQ=255) cgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGt > 1:1159812‑M2/8‑100 (MQ=255) gtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGtt < 1:472197‑M2/94‑1 (MQ=255) gtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGtt > 2:628902‑M2/7‑100 (MQ=255) gtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGtt > 1:2244879‑M2/7‑100 (MQ=255) tcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTg < 1:1561710‑M2/95‑1 (MQ=255) tcggaTATGGGCACTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGACTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTATCGGATCATCCGCCAGAAGGCGCTGTTg < 2:1446442‑M2/95‑1 (MQ=255) gggTATGGGCGCTGCTTCGCAGATAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCt < 2:1381214‑M2/97‑1 (MQ=255) gggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCt > 1:1407505‑M2/4‑100 (MQ=255) gggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCt < 1:1016588‑M2/97‑1 (MQ=255) gCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCt < 1:1175655/100‑1 (MQ=32) ggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCGAAAATTGTTTACCTAATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCtt > 2:657818‑M2/3‑100 (MQ=255) ggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCtt < 1:2147937‑M2/98‑1 (MQ=255) ggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCtt > 1:1648372‑M2/3‑100 (MQ=255) gTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTg < 2:1222504‑M2/99‑1 (MQ=255) cGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGtctgcgaagcagcgcccatacccgacgataaccatacgttggcagctctccgataacatggtgtatacg < 1:594654‑M2/100‑70 (MQ=255) cAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGtctgcgaagcagcgcccatacccgccgataaccatacgatggcagctctccgataacatggtgtatacgca < 1:2318698‑M2/100‑72 (MQ=255) cAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGtctgcgaagcagcgcccatacccgacgataaccatacgttggcagctctccgataacatggtgtatacgga < 1:268474‑M2/100‑72 (MQ=255) cAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGtctgcgaagcagcgcccatacccgacgataaccatacgttggcagctctccgataacatggtgtatacgg < 1:42709‑M2/99‑71 (MQ=255) tgaCAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGtctgcgaagcagcgcccatacccgacgataaccatacgttggcagctctccgataacatggtgtatacggag > 1:635013‑M2/2‑28 (MQ=255) gACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGtctgcgaagcagcgcccatacccgacgataaccatacgttggcagctctccgataacatggtgtatacggaga < 1:106677‑M2/100‑74 (MQ=255) ggCAGAACTTGATGGTATGCCTGtctgcgaagcagcgcccatacccgacgataaccatacgttggcagctctccgataacatggtgtatacggagaagca < 1:2356418‑M2/100‑78 (MQ=255) ggCAGAACTTGATGGTATGCCTGtctgcgaagcagcgcccatacccgacgataaccatacgttggcagctctccgataacatggtgtatacggagaagca < 1:100148‑M2/100‑78 (MQ=255) ggCAGAACTTGATGGTATGCCTGtctgcgaagcagcgcccatacccgacgataaccatacgttggcagctctccgataacatggtgtatacggagaagca < 1:881488‑M2/100‑78 (MQ=255) tGCCTGtctgcgaagcagcgcccatacccgacgataaccatacgttggcagctctccgataacatggtgtatacggagaagcacatccgtatcatcagtg < 2:1094349‑M2/100‑95 (MQ=255) gCCTGtctgcgaagcagcgcccatacccgacgataaccatacgttggcagctctccgataacatggtgtatacggagaagcacatccgtatcatcagtgt > 2:283182‑M2/1‑5 (MQ=255) ccTGtctgcgaagcagcgcccatacccgacgataaccatacgttggcagctctgcgataacatggtgtatacggagaagcacatccgtatcatcagtgtg > 2:1332011‑M2/1‑4 (MQ=255) ccTGtctgcgaagcagcgcccatacccgacgataaccatacgttggcagctctccgataacatggtgtatacggagaatcacatccgtatcatcagtgtg > 1:911965‑M2/1‑4 (MQ=255) ccTGtctgcgaagcagcgcccatacccgacgataaccatacgttggcagctctccgataacatggtgtatacggagaagcacctccgtatcatcagtg < 2:1525376‑M2/98‑95 (MQ=255) ccTGtctgcgaagcagcgcccatacccgacgataaccatacgttggcagctctccgataacatggtgtatacggagaagcacatccgtatcatcagtg < 1:710876‑M2/98‑95 (MQ=255) cTGtctgcgaagcagcgcctatacccgacgataaccatacgttggcagctctccgataacatggtgtatacggagaagcacatccgtatcatcagtgtga > 2:2367129‑M2/1‑3 (MQ=255) tGtctgcgaagcagcgcccatacccgacgataaccatacgttggcagctctccgataacatggtgtatacggagaagcacatccgtatcatcagtgtgac > 1:15943‑M2/1‑2 (MQ=255) tGtctgcgaagcagcgcccatacccgacgataaccatacgttggcagctctccgataacatggtgtatacggagaagcacatccgtatcatcagtgtgac > 2:1751453‑M2/1‑2 (MQ=255) tGtctgcgaagcagcgcccatacccgacgataaccatacgttggcagctctccgataacatggtgtatacggagaagcacatccgtatcatcagtgtgac < 2:2109527‑M2/100‑99 (MQ=255) gtctgcgaagcagcgcccatacccgacgataaccatacgttggcagctctccgataacatggtgtatacggagaagcacatccgtatcatcagtgtgacg < 2:1588602‑M2/100‑100 (MQ=255) gtctgcgaagcagcgcccatacccgacgataaccatacgttggcagctctccgataacatggtgtatacggagaagcacatccgtatcatcagtgtgacg > 1:1305587‑M2/1‑1 (MQ=255) gtctgcgaagcagcgcccatacccgacgataaccatacgttggcagctctccgataacatggtgtatacggagaagcacatccgtatcatcagtgtgacg < 2:1720717‑M2/100‑100 (MQ=255) | GCCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGAAAACCTGCTGTACCGCCATCGAAACGGGCACATACAGGCA > NC_000913/1650789‑1650986 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |