| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,471,300 | T→A | 18.1% | Q73L (CAG→CTG) | yfdK ← | CPS‑53 (KpLE1) prophage; conserved protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,471,300 | 0 | T | A | 18.1% | 214.4 / 37.2 | 90 | Q73L (CAG→CTG) | yfdK | CPS‑53 (KpLE1) prophage; conserved protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/39); new base A (11/5); total (46/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.67e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.60e-01 | |||||||||||
AGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTCGGCGGTAATCCGGAAAACTCAA > NC_000913/2471201‑2471399 | aGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCt > 1:1755300/1‑100 (MQ=255)aGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCt > 2:809405/1‑100 (MQ=255) cgacCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGtt < 2:1818222/100‑1 (MQ=255) gacCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTc > 2:833087/1‑100 (MQ=255) acCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTcc < 1:1105481/100‑1 (MQ=255) acCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTcc > 1:1859189/1‑100 (MQ=255) acCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTcc > 1:2032806/1‑100 (MQ=255) acCAATAGCCGCTTTAAAAACCCAAAAATTAATGTACATATAATCGTAGGCCTGATTAATCAATTACTGCTTTTTAAGTTCGGCTGCAGCAAACTGTTcc > 2:955794/1‑100 (MQ=255) ccAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTcat > 1:185547/1‑98 (MQ=255) aaTAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCa < 1:1188942/100‑1 (MQ=255) aaTAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCa < 1:943801/100‑1 (MQ=255) aaTAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCa > 1:68703/1‑100 (MQ=255) aGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCAtgt < 1:648221/100‑1 (MQ=255) gCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCAtgt < 1:648231/99‑1 (MQ=255) gCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCAGTTCCTCATGTGTtg > 1:829014/1‑100 (MQ=255) tctACCAGCCCATTGTTTACTGTTCAGATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTCCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTtggt < 2:827150/98‑1 (MQ=255) ttACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTtggtg < 2:1364946/100‑1 (MQ=255) tACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTtggtgg > 2:511800/1‑100 (MQ=255) tACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTtggtgg < 2:155442/100‑1 (MQ=255) tACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCAGTTCCTCATGTGTtggtgg < 2:464717/100‑1 (MQ=255) aCCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTtggtggt < 1:1298468/100‑1 (MQ=255) ccAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTtggtggtg < 1:495894/100‑1 (MQ=255) cAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTtggtggtgg < 2:1628948/100‑1 (MQ=255) gCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGaa > 2:2189813/1‑100 (MQ=255) cccATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTCATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAAt > 2:1276318/1‑100 (MQ=255) ccATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCAGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAAtt > 2:1483484/1‑100 (MQ=255) cATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAAttt < 2:401140/100‑1 (MQ=255) aTTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCAGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTc > 2:1882743/1‑100 (MQ=255) ttGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCa < 1:353996/100‑1 (MQ=255) ttGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCa < 2:499221/100‑1 (MQ=255) ttGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCAGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCa > 1:54429/1‑100 (MQ=255) tctttACTGTTCACATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCCGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAg > 1:1622543/3‑100 (MQ=255) tGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCa > 2:574940/1‑99 (MQ=255) tGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAg < 1:777834/100‑1 (MQ=255) gTTTACTGTTCATATTATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCAGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGa < 1:2370200/100‑1 (MQ=255) aCTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCAt > 1:1307833/1‑100 (MQ=255) aCTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCAt > 1:1747687/1‑100 (MQ=255) tGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGc < 1:2044494/100‑1 (MQ=255) tGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGc > 1:414768/1‑100 (MQ=255) tGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGc < 1:252911/100‑1 (MQ=255) nttCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCAGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCa > 1:750596/2‑100 (MQ=255) tCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTTGTGGAATTTCAGACCATGCAgg < 2:341790/100‑1 (MQ=255) tCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAgg < 2:1629596/100‑1 (MQ=255) tCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAgg < 1:1200217/100‑1 (MQ=255) cATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCAGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGa > 2:1504038/1‑100 (MQ=255) tataATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGaaa > 1:1273511/1‑100 (MQ=255) ataATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTAGCAATCTGTTCCTAATGTGTTGTTAATGGAATTTCAGTCCATGCAGGata > 2:327360/1‑97 (MQ=255) tcaTCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTACTCATGTGTTGGTGTTTGAATTTCAGACCATGCACGAAAAc > 2:1866518/3‑100 (MQ=255) taATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGCCCATGCAGGAAAAc > 1:2200200/1‑100 (MQ=255) aaTCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCAGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAAcc > 1:1536304/1‑100 (MQ=255) tGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTtc < 2:544061/100‑1 (MQ=255) ggCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCTGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGACTTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTtct > 2:1434784/1‑100 (MQ=255) gCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTtctc > 1:105723/1‑100 (MQ=255) gCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCAGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTtctc > 1:531658/1‑100 (MQ=255) ccTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTTTTTTTTTTTTCAGCAATAAATTTCTCATATTTTTGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACTATTTTCTcc > 2:104900/1‑100 (MQ=255) ccTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTcc < 1:833096/100‑1 (MQ=255) tGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAg > 2:2191196/1‑100 (MQ=255) gATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGc > 1:235485/1‑100 (MQ=255) aTTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTACCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCg < 2:1536035/100‑1 (MQ=255) aTCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATAc < 2:909420/100‑1 (MQ=255) aTCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATAc < 1:746923/100‑1 (MQ=255) aaTTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCAGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGa < 2:54428/100‑1 (MQ=255) ttGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGAtt > 2:1262744/1‑100 (MQ=255) ttGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGAtt < 1:619332/100‑1 (MQ=255) ttGCTGCTTGTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGTAATTTCAGACCATGCAGTAAAATCATTTTCTCCAGCGATACGGAt < 2:1919767/99‑1 (MQ=255) ctgctTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGAttttt > 1:1388221/1‑100 (MQ=255) ctgctTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGAttttt < 1:790955/100‑1 (MQ=255) ctgctTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGAttttt > 2:725467/1‑100 (MQ=255) ctgctTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCAGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGAAttttt > 1:1080142/1‑100 (MQ=255) tgctTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTc < 2:1690107/100‑1 (MQ=255) gctTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTcc > 2:1084637/1‑100 (MQ=255) gctTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTcc > 2:184475/1‑100 (MQ=255) ctTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCTGCGATACGGATTTTTCCt < 2:947861/100‑1 (MQ=255) tttttCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCtt < 2:1860553/100‑1 (MQ=255) ttttCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCttt > 1:1122714/1‑100 (MQ=255) tttCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTc < 1:353873/100‑1 (MQ=255) tCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTcgg < 1:1375543/100‑1 (MQ=255) cAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTcggc < 2:105721/100‑1 (MQ=255) cAGTTCGGCTGCAGCAATCCGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTcgg > 1:603927/1‑99 (MQ=255) cAGTTCGGCTGCAGCAATCAGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTcggc < 1:1504055/100‑1 (MQ=255) gTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTcggcgg > 1:1050161/1‑100 (MQ=255) gTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTcggcgg < 2:414765/100‑1 (MQ=255) gTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTcggcgg < 2:2079172/100‑1 (MQ=255) ggCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTCGGCGGTAAt > 1:1914319/1‑100 (MQ=255) ggCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTCGGCGGTAAt > 2:1761330/1‑100 (MQ=255) gCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTCGGCGGTAAt > 2:61383/1‑99 (MQ=255) gcagcaATCAGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTCGGCGGTAATCCgg > 1:804928/1‑100 (MQ=255) gcaATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTCGGGGGTAATCCGGaca < 1:1626681/100‑3 (MQ=255) gcaATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTCGGCGGTAATCCGGaaa > 1:1846171/1‑100 (MQ=255) gcaATCAGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTCGGCGGTAATCCGGaaa < 2:1539835/100‑1 (MQ=255) aTCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTCGGCGGTAATCCGGAAAACt < 2:2346144/100‑1 (MQ=255) tCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTCGGCAGTAATCCGGAAAAc > 2:2086657/1‑98 (MQ=255) tGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTCGGCGGTAATCCGGAAAACTCaa > 1:234734/1‑100 (MQ=255) | AGACGACCAATAGCCGCTTTACCAGCCCATTGTTTACTGTTCATATAATCGTTGGCCTGATTAATCAATTGCTGCTTTTTCAGTTCGGCTGCAGCAATCTGTTCCTCATGTGTTGGTGGTGGAATTTCAGACCATGCAGGAAAACCATTTTCTCCAGCGATACGGATTTTTCCTTTCGGCGGTAATCCGGAAAACTCAA > NC_000913/2471201‑2471399 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |