Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,712,402 | A→G | 42.6% | S121S (AGT→AGC) | trmN ← | tRNA1(Val) (adenine(37)‑N6)‑methyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,712,402 | 0 | A | G | 42.6% | 34.9 / 109.7 | 92 | S121S (AGT→AGC) | trmN | tRNA1(Val) (adenine(37)‑N6)‑methyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (30/22); new base G (18/21); total (49/43) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.97e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.62e-01 |
AGGTCAGCAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGAT > NC_000913/2712305‑2712500 | aGGTCAGCAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCt < 2:264586/100‑1 (MQ=255) ggTCAGCAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCtg < 1:1328415/100‑1 (MQ=255) ggTCAGCAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACtg < 1:1979869/100‑1 (MQ=255) gTCAGCAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACtga < 1:1085265/100‑1 (MQ=255) cAGCAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGTGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTCGGTTGCtgatg < 2:1261151/100‑1 (MQ=255) cAGCAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACtgatg > 2:1485479/1‑100 (MQ=255) aGCAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTGTAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTTCTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCtgatga < 2:1433861/100‑1 (MQ=255) aGCAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACtgatga < 2:2341742/100‑1 (MQ=255) gCAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTgatgat > 2:2366227/1‑100 (MQ=255) aaCGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCTGATGATTa > 2:140599/1‑100 (MQ=255) aTGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATc < 1:1730910/100‑1 (MQ=255) tGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATCg < 2:1009479/100‑1 (MQ=255) gTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATCGAAg < 2:506089/100‑1 (MQ=255) gATAAAGCGTAGTAATATAGCGAGCCTTTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACGCTACTCCTTGCTGATAGTAAGGGGTGTTGCGGATGAGGAAATCGAAGCg > 2:2003926/1‑100 (MQ=255) aTCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCATGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGt > 2:384544/1‑100 (MQ=255) tCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGTa > 2:419750/1‑100 (MQ=255) cAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTAc > 1:1163652/1‑100 (MQ=255) cAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTAc < 1:1858622/100‑1 (MQ=255) cAAGCGTAGGGGTATAGCGAGCCTGTGCCCGTTGAGGTGTTGAGCAATCTACTCCCTGCGGATAGTAAGGTGTGTTGTTGATGATTAAATCGAAGCGTAc < 2:1389234/100‑1 (MQ=255) aaGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACt > 2:1071038/1‑100 (MQ=255) aGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTg > 2:1200552/1‑100 (MQ=255) aGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTg > 2:1631192/1‑100 (MQ=255) aGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTg > 1:235863/1‑100 (MQ=255) aGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTg > 1:236602/1‑100 (MQ=255) aGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTg > 2:2379824/1‑100 (MQ=255) cGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTc < 2:1429618/100‑1 (MQ=255) cGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTc < 1:1705044/100‑1 (MQ=255) aGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAATGTGGGTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTctgc < 2:1472534/100‑1 (MQ=255) aGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTctgc < 1:1200563/100‑1 (MQ=255) aGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTctgc < 1:1377094/100‑1 (MQ=255) ggTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCtgt > 1:161118/1‑100 (MQ=255) tataGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCtgtgt < 2:1814998/100‑1 (MQ=255) aGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCtgtgt < 2:170520/97‑1 (MQ=255) aGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGAt > 1:1042300/1‑100 (MQ=255) aGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCCGTGTGAt > 2:268749/1‑100 (MQ=255) aGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGGTGAGCACTCTACTCCCTTCTGATAGGAAGGTGGGTTCCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTATCTGCTGTATGAt > 2:1165379/1‑100 (MQ=255) gCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATc < 2:37842/100‑1 (MQ=255) cGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGTACAGTCTGCTATGTGAt > 1:81838/1‑98 (MQ=255) cGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATcc < 1:1662440/100‑1 (MQ=255) cGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATcc > 1:1566802/1‑100 (MQ=255) cGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATcc < 1:1492484/100‑1 (MQ=255) cGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATcc < 2:550678/100‑1 (MQ=255) aGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTTCTGTGTGATcccc < 1:1626319/100‑3 (MQ=255) cTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCActgc < 1:533430/100‑1 (MQ=255) cTGTTCCCGTGGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCActgc < 1:1071048/100‑1 (MQ=255) tGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCTGGTGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCActgc < 1:373674/99‑1 (MQ=255) tGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCActgct > 2:1112984/1‑100 (MQ=255) gTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCActgctg > 2:1820527/1‑100 (MQ=255) ttCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGa < 1:303777/100‑1 (MQ=255) ttCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGa < 2:531158/100‑1 (MQ=255) cccGTTGATGTGTCGAGCACTCTACGCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGaa < 2:830789/99‑1 (MQ=255) cGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAatat > 2:371495/1‑100 (MQ=255) ttGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATcc < 1:1594223/100‑1 (MQ=255) ggTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATccgccg > 2:2103705/1‑100 (MQ=255) ggTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATccgccg > 2:1803273/1‑100 (MQ=255) ggTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATccgccg > 2:1377134/1‑100 (MQ=255) ggTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATccgccg > 1:1235392/1‑100 (MQ=255) gtgtCGAGCACTCTACTCTCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGt < 2:2355819/100‑1 (MQ=255) gtgtCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGt < 1:1936742/100‑1 (MQ=255) tgtCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTa > 1:2173451/1‑100 (MQ=255) tgtCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTa > 1:570824/1‑100 (MQ=255) gAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGa > 2:2058581/1‑100 (MQ=255) gCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACg > 1:629501/1‑100 (MQ=255) cACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGt > 2:1869527/1‑100 (MQ=255) ctctACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGtt < 1:1369156/99‑1 (MQ=255) ctACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAAt > 2:816419/1‑100 (MQ=255) ctACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAAt > 1:997956/1‑100 (MQ=255) aCTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATcc > 2:609935/1‑100 (MQ=255) cTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCg > 2:513302/1‑100 (MQ=255) cccTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGct < 1:223737/100‑1 (MQ=255) ccTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGctc > 2:857875/1‑100 (MQ=255) ccTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGctc > 1:2192849/1‑100 (MQ=255) ctgctgATAGTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGctct < 1:2392224/100‑1 (MQ=255) ctgctgAGAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGctct < 2:1934619/100‑1 (MQ=255) gctgATGGTAGGGTGGGTGGCGGACGATGAATTCGATGCCGTCTGTCGCCTGGGTGATCCACTGCTGAATATCAGCCGTATGGCCGTTATTCCGctc < 2:1493479/97‑1 (MQ=255) gctgATAGTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGc < 1:1003284/100‑1 (MQ=255) gctgATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGc < 1:1112994/100‑1 (MQ=255) gctgATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGc > 2:1327875/1‑100 (MQ=255) aTAGTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCAc > 1:2298651/1‑100 (MQ=255) gTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACggg > 1:1597607/1‑100 (MQ=255) gTAAGGTGGGTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACggg > 1:394260/1‑100 (MQ=255) aaGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGa > 2:1704036/1‑100 (MQ=255) aGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGAc < 2:2010621/100‑1 (MQ=255) ggTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGAc < 1:1485495/99‑1 (MQ=255) gggTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGt > 1:1391099/1‑100 (MQ=255) ggTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGtt > 1:1448115/1‑100 (MQ=255) ggTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGtt > 2:133677/1‑100 (MQ=255) gTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTg > 1:1145869/1‑100 (MQ=255) gTTGCTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTg < 2:81836/100‑1 (MQ=255) gTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCCAggggtgaggtt > 1:2246201/1‑92 (MQ=255) gTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTg > 1:2139757/1‑100 (MQ=255) tACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGat > 2:2118785/1‑100 (MQ=255) | AGGTCAGCAACGATGGGTGATCAAGCGTAGTGGTATAGCGAGCCTGTTCCCGTTGAGGTGTCGAGCACTCTACTCCCTGCTGATAGTAAGGTGGGTTACTGATGATTAAATCGAAGCGTACTGTCTGCTGTGTGATCCACTGCTGAATATCCGCCGTATGGACGTTAATCCGCTCTGCCCACGGGGACTGGTTGAT > NC_000913/2712305‑2712500 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |