| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,862,917 | T→G | 18.7% | Y195D (TAC→GAC) | ygbK → | FliA‑regulated DUF1537 family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,862,917 | 0 | T | G | 18.7% | 240.9 / 54.9 | 107 | Y195D (TAC→GAC) | ygbK | FliA‑regulated DUF1537 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (43/44); new base G (12/8); total (55/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.62e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.34e-01 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CCACAGGGCGCTGCGGCGTCGTTTCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTGGTAACGGGCGGTTCTGGTCTGGCGATTG > NC_000913/2862819‑2863016 | ccACAGGGCGCTGCGGCGTCGTTTCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTa > 2:339968/1‑100 (MQ=255) cacaGGGCGCTGCGGCGTCGTTTCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTAc > 1:1272422/1‑100 (MQ=255) cacaGGGCGCTGCGGCGTCGTTTCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTAc > 1:313821/1‑100 (MQ=255) caGGGCGCTGCGGCGTCGTTTCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTAcgc < 1:1736839/100‑1 (MQ=255) gggCGCTGCGGCGTCGTTTCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTAcgcg < 1:373116/99‑1 (MQ=255) gggCGCTGCGGCGTCGTTTCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCgg < 1:529413/100‑1 (MQ=255) ggCGCTGCGGCGTCGTTTCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGt > 2:2268118/1‑100 (MQ=255) cgcTGCGGCGTCGTTTCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGc < 1:2302900/100‑1 (MQ=255) gcTGCGGCGTCGTTTCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACTCGGTGCt < 1:1258176/100‑1 (MQ=255) gcTGCGGCGTCGTTTCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCt > 1:560099/1‑100 (MQ=255) gcTGCGGCGTCGTTTCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCt < 1:799923/100‑1 (MQ=255) gcTGCGGCGTCGTTTCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCt > 2:667285/1‑100 (MQ=255) cTGCGGCGTCGTTTCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCtt > 2:1384519/1‑100 (MQ=255) tGCGGCGTCGTTTCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTg < 2:861422/100‑1 (MQ=255) gcggcgTCGTTTCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGa < 1:806371/100‑1 (MQ=255) cggcgTCGTTTCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGAt < 2:1210086/100‑1 (MQ=255) ggcgtTTCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATgcgc < 2:1455744/98‑1 (MQ=255) gtTTCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGa > 2:2045046/1‑100 (MQ=255) tttCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGAc > 1:2155933/1‑100 (MQ=255) tttCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCGACGCGGTGCTTGATGCGCTGAc < 1:2190015/100‑1 (MQ=255) ttCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGAcc < 1:2199734/100‑1 (MQ=255) ttCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCGACGCGGTGCTTGATGCGCTGAcc < 1:1767942/100‑1 (MQ=255) ttCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCGACGCGGTGCTTGATGCGCTGAcc < 2:1127388/100‑1 (MQ=255) tCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGAcc > 2:1995013/1‑99 (MQ=255) tCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCg < 2:572573/100‑1 (MQ=255) cGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTATCGCTAGGCGGTGCTTGATGCGCTGcccta > 2:1376957/1‑98 (MQ=255) ggCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCGACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGaa > 2:2162800/1‑100 (MQ=255) gCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAac < 2:102926/100‑1 (MQ=255) gCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCGATGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAac > 2:2373358/1‑100 (MQ=255) cacaTGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAaca < 2:1443770/100‑1 (MQ=255) cacaTGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAaca > 1:1946814/1‑100 (MQ=255) aTGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCGACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCa > 2:1464183/1‑100 (MQ=255) tGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCa > 2:1266884/1‑99 (MQ=255) gTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATc > 2:1201408/1‑100 (MQ=255) gTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAAAACCATc > 2:2085957/1‑100 (MQ=255) tttCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCGACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTg > 1:763056/1‑100 (MQ=255) ttCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTgg > 1:1974438/1‑100 (MQ=255) cGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGAACGAACACCATCTGGaa > 1:1034795/1‑100 (MQ=255) gAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGaaa < 1:1950034/100‑1 (MQ=255) gAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGaaa > 1:1660028/1‑100 (MQ=255) gAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCGACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGaaa > 2:1716482/1‑100 (MQ=255) aaCAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAAt < 1:2164089/100‑1 (MQ=255) aaCAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAAt < 2:392513/100‑1 (MQ=255) aGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCa > 1:1359306/1‑99 (MQ=255) aGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAg < 1:339971/100‑1 (MQ=255) aGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAg > 2:320456/1‑100 (MQ=255) ggTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAgg < 1:483804/100‑1 (MQ=255) ggTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAgg < 1:1263450/100‑1 (MQ=255) ggTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAgg < 1:1384533/100‑1 (MQ=255) ggTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCGACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAgg < 1:2380603/100‑1 (MQ=255) ggTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCGACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAgg < 1:642722/100‑1 (MQ=255) gtgtGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAggg < 1:2049857/100‑1 (MQ=255) tgtgGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCGATGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGga < 1:2373386/100‑1 (MQ=255) gtgGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGgag < 1:125299/100‑1 (MQ=255) ggATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCGACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGaa < 2:763047/100‑1 (MQ=255) gATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAg < 2:560096/100‑1 (MQ=255) gATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCGACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAg > 2:183815/1‑100 (MQ=255) aTGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGc > 1:1516215/1‑100 (MQ=255) tGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGcc > 2:1055454/1‑100 (MQ=255) cGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTg > 1:1365532/1‑100 (MQ=255) cGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGcgcg > 2:58830/1‑100 (MQ=255) cGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGcgcg < 1:1583641/100‑1 (MQ=255) tCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGAt > 2:1870375/1‑100 (MQ=255) cAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCGACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATg > 2:1360918/1‑100 (MQ=255) cAAGAGCTGGCTCGCTTACAGAAAGAGGGGTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGAACGAACACCTTATGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATg > 2:902784/1‑100 (MQ=255) aaGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTACGCGATGc > 2:1795548/1‑100 (MQ=255) agagCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGcc < 1:1814750/100‑1 (MQ=255) agagCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGcc < 1:393568/100‑1 (MQ=255) gagCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGccc > 1:1053932/1‑100 (MQ=255) gagCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCGACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGccc > 2:941247/1‑100 (MQ=255) gCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGTGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGcccc < 1:1332942/99‑1 (MQ=255) gCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCa < 2:100819/100‑1 (MQ=255) cTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCAc < 1:2378539/100‑1 (MQ=255) ggCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTg > 1:555350/1‑100 (MQ=255) ggCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCGACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTg < 1:1716502/100‑1 (MQ=255) ggCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCGACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGAAGCCCCACt > 1:203455/1‑99 (MQ=255) cTCGCTTACAGCAAGAGAAATACCGATACGCGATGCATGATGCGCTGAACGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACt > 2:509114/1‑97 (MQ=255) tCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTGGTa < 1:1379470/100‑1 (MQ=255) tCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTGGTa > 1:1945722/1‑100 (MQ=255) gCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTGGTAAc > 2:1238306/1‑100 (MQ=255) cTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTGGTAACg > 2:1762375/1‑100 (MQ=255) tACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTGGTAACggg < 1:908739/100‑1 (MQ=255) tACAGCAAGAGGGCTACCGCGACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTGGTAACggg > 1:1771877/1‑100 (MQ=255) cAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTGGTAACGGGCg > 2:340968/1‑100 (MQ=255) cAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACAATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTGGTAACGGGCg > 2:2104604/1‑100 (MQ=255) aGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTGGTAACGGGCgg > 2:454625/1‑100 (MQ=255) gCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTGGTAACGGGCgg > 2:1645387/1‑99 (MQ=255) gCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTGGTAACGGGCGGt < 1:628426/100‑1 (MQ=255) gCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTGGTAACGGGCGGt < 1:1394182/100‑1 (MQ=255) gCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTGGTAACGGGCGGt > 2:2289414/1‑100 (MQ=255) cAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTGGTAACGGGCGGtt > 1:1852158/1‑100 (MQ=255) agGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCGGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTGGTAACGGGCGGTtctgg < 1:2215411/100‑1 (MQ=255) gggCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTGGTAACGGGCGGTtctggt > 2:58483/1‑100 (MQ=255) gggCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTGGTAACGGGCGGTtctggt > 2:639574/1‑100 (MQ=255) ggCTACGGGTACGGGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTGGTAACGGGCGGTtctggtc < 1:1561997/100‑1 (MQ=255) aCCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTGGTAACGGGCGGTTCTGGTCTGGc < 1:1523837/100‑1 (MQ=255) aCCGCGACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTGGTAACGGGCGGTTCTGGTCTGGc > 2:1132094/1‑100 (MQ=255) ccGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTGGTAACGGGCGGTTCTGGTCTGGCg < 2:535496/100‑1 (MQ=255) cTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTGGTAACGGGCGGTTCTGGTCTGGCGAtt < 1:1875605/100‑1 (MQ=255) tACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTGGTAACGGGCGGTTCTGGTCTGGCGATtg < 1:135778/100‑1 (MQ=255) | CCACAGGGCGCTGCGGCGTCGTTTCGGCACATGTTTTCGAACAAGGTGTGGATGCCGTTCGTCAAGAGCTGGCTCGCTTACAGCAAGAGGGCTACCGCTACGCGGTGCTTGATGCGCTGACCGAACACCATCTGGAAATTCAGGGAGAAGCCTTGCGCGATGCCCCACTGGTAACGGGCGGTTCTGGTCTGGCGATTG > NC_000913/2862819‑2863016 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |