Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,165,015 | T→A | 18.7% | D320V (GAT→GTT) | parC ← | DNA topoisomerase IV, subunit A |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,165,015 | 0 | T | A | 18.7% | 223.7 / 43.5 | 98 | D320V (GAT→GTT) | parC | DNA topoisomerase IV, subunit A |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/50); new base A (8/10); total (38/60) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.96e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.37e-01 |
ACCAGCCATTCGGAGAGGATTTCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCACCAGGCGGGTCGGGTTCTCGTGGTCAGATTCA > NC_000913/3164919‑3165113 | acCAGCCATTCGGAGAGGATTTCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGAt > 2:890097/1‑97 (MQ=255) acCAGCCATTCGGAGAGGATTTCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCgg < 2:491440/100‑1 (MQ=255) cAGCCATTCGGAGAGGATTTCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCggt > 1:2033519/1‑99 (MQ=255) cAGCCATTCGGAGAGGATTTCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAAATCg > 2:338421/1‑97 (MQ=255) agacagtCGGAGAGTATTTCCAGCAGGTTTTGCAGCGCCGGACGACCATCCACACTGATCATATTAAGGTTAATATGATATCTCATTTCCAGATCggt < 2:184151/92‑1 (MQ=255) aGCCATTCGGAGAGGATTTCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCggtgg > 1:869308/1‑100 (MQ=255) aGCCATTCGGAGAGGATTTCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCgg > 1:1267374/1‑97 (MQ=255) aGCCATTCGGAGAGGATTTCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGAACggttg < 1:1626865/100‑3 (MQ=255) gCCATTCGGACAGGATTTCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGCCCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCggtggt < 2:2396561/100‑1 (MQ=255) ccATTCGGAGAGGATTTCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGAACggtggt < 1:459175/99‑1 (MQ=255) aTTCGGAGAGGATTTCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGAACGGTGGTAGc < 1:2031143/100‑1 (MQ=255) ttCGGAGAGGATTTCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCg < 2:596510/100‑1 (MQ=255) ggAGAGGATTTCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAag < 1:2108653/100‑1 (MQ=255) ggAGAGGATTTCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGAACGGGCGTAGCGa > 2:508807/1‑98 (MQ=255) gagaGGATTTCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAaga < 2:213488/100‑1 (MQ=255) gagaGGATTTCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAaga < 2:1269174/100‑1 (MQ=255) agagGATTTCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAagag < 2:1086487/100‑1 (MQ=255) agagGATTTCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAagag > 2:11229/1‑100 (MQ=255) agagGATTTCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAagag < 1:336708/100‑1 (MQ=255) gagGATTTCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGAACGGTGGTAGCGAagag > 1:1578104/1‑99 (MQ=255) gATTTCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAggtgg < 1:470250/100‑1 (MQ=255) aTTTCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAggtggt < 1:683094/100‑1 (MQ=255) aTTTCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAggtgg < 1:1353931/99‑1 (MQ=255) aTTTCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGAACGGTGGTAGCGAAGAggtggt < 2:929257/100‑1 (MQ=255) tttCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAggtggt > 2:1672242/1‑99 (MQ=255) tttCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGtt < 1:548452/100‑1 (MQ=255) ttCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTtc < 2:1630773/100‑1 (MQ=255) tCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTtc > 2:435157/1‑99 (MQ=255) cagcagGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTtcatn < 2:834536/100‑2 (MQ=255) cagcagGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGAACGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTtcatc < 1:1942666/100‑1 (MQ=255) agcagGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGAACGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTtcatca < 1:1985845/100‑1 (MQ=255) cagGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCAcc < 1:1050498/100‑1 (MQ=255) cagGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCAcc < 1:215529/100‑1 (MQ=255) cagGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCAcc < 1:11230/100‑1 (MQ=255) agGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCt < 2:2007560/100‑1 (MQ=255) ggTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTg < 1:1299328/100‑1 (MQ=255) tttCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATcc < 1:1030648/100‑1 (MQ=255) tttCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATcc < 2:129133/100‑1 (MQ=255) cACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCata < 2:2033497/100‑1 (MQ=255) cACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGAACGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCat > 1:1296497/1‑99 (MQ=255) cACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGAACGGTGGTAGCGAAGAGGAGGTTCATCACCTAATCCata > 1:1826015/1‑100 (MQ=255) aCCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCatat > 1:1488344/1‑100 (MQ=255) aCCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGACCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTgc > 2:836027/1‑92 (MQ=255) ccgccgGACTACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGAACGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATc < 2:1296483/100‑1 (MQ=255) ccgccgGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATc < 1:1774814/100‑1 (MQ=255) ccgccgGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATc < 2:1267419/100‑1 (MQ=255) cgccgGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATcc < 1:2199408/100‑1 (MQ=255) cgccgGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATcc < 2:2096791/100‑1 (MQ=255) gccgGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGAACGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCa > 2:1227594/1‑100 (MQ=255) ccgGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCa < 1:15887/99‑1 (MQ=255) gacgacCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCAcgcg > 2:1388596/1‑100 (MQ=255) cgacCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGt > 1:2168460/1‑100 (MQ=255) gacCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGtt < 1:685176/100‑1 (MQ=255) gacCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGt < 1:220003/99‑1 (MQ=255) tCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAAc > 2:209571/1‑100 (MQ=255) tCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAAc < 1:1854133/100‑1 (MQ=255) tCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGAACGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAAc > 2:1057215/1‑100 (MQ=255) cAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAAcgc < 2:859789/100‑1 (MQ=255) cAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAAcgc > 2:1932750/1‑100 (MQ=255) gACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCgg < 2:1007090/100‑1 (MQ=255) aCCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGAACGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGc < 2:2348043/100‑1 (MQ=255) ccGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGca < 1:495171/100‑1 (MQ=255) gATCATATTATGGTTAATATGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGGAGAGGTGGGTGATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGc < 1:701527/97‑1 (MQ=255) gATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcaca > 2:1210893/1‑100 (MQ=255) gATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcaca > 1:1864020/1‑100 (MQ=255) gATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCAGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATACACGCGGTTGGAACGCGGcaca > 2:212156/1‑100 (MQ=255) gATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGAACGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGcaca > 1:1294424/1‑100 (MQ=255) cATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATc > 1:1693841/1‑100 (MQ=255) cATATTAAGGTTAATACGATAACTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAAt > 2:1473978/1‑99 (MQ=255) atatTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCa < 1:2337081/100‑1 (MQ=255) atatTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCa < 2:661162/100‑1 (MQ=255) atatTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGAACGGTGGTCGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGAACCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATc > 2:1174833/1‑99 (MQ=255) tatTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCAc > 1:917993/1‑100 (MQ=255) atTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCAcc > 2:703830/1‑100 (MQ=255) ggTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGAACGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCACCAGGcg < 1:1025776/100‑1 (MQ=255) ttAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCACCAGGcggg < 2:1204661/100‑1 (MQ=255) tAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGATATGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATAACCAGGcggg > 2:2132642/1‑99 (MQ=255) aTACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCACCAGGcgggtcg > 1:1954840/1‑100 (MQ=255) tACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCACCAGGcgggtcgg > 1:1806353/1‑100 (MQ=255) tACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAAGCACCAGGcgggtcgg > 1:2370991/1‑100 (MQ=255) cGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCACCAGGcgggtcgggt > 1:1723267/1‑100 (MQ=255) cGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCACCAGGcgggtcgggt > 2:1098934/1‑100 (MQ=255) gATAGCTCTTTTCCAAATCGGTGGTAGCGAATAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCATATTCACCAGAcgggtcgggt < 2:318346/99‑1 (MQ=255) aGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCACCAGGCGGGTCGGGTtctc < 2:1336732/100‑1 (MQ=255) aGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCACCAGGCGGGTCGGGTtctc < 2:32349/100‑1 (MQ=255) aGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCACCAGGCGGGTCGGGTtct > 1:1012502/1‑99 (MQ=255) gCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACGTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCACCAGGCGGGTCGGGTTCTCg < 2:1682891/100‑1 (MQ=255) ctctTTTCCATATCGGTGGTAGCGAAAAGGTAGTTCATCACCTGATCCATATTCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCACAAGGCGGGACGGGATCTCGt > 2:905313/1‑100 (MQ=255) tctTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCACCAGGCGGGTCGGGTTCTCGTg < 2:2202504/100‑1 (MQ=255) ctTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCACCAGGCGGGTCGGGTTCTCGTgg > 1:826435/1‑100 (MQ=255) ttttCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAAGGCGGCACAATCACCAGGCGGGTCGGGTTCTCGTGGt < 1:1691688/100‑1 (MQ=255) ttttCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCACCAGGCGGGTCGGGTTCTCGTGGt < 1:34995/100‑1 (MQ=255) tCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCACCAGGCGGGTCGGGTTCTCGTGGTCAg < 1:2083510/100‑1 (MQ=255) tCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCACCAGGCGGGTCGGGTTCTCGTGGTCAg < 1:1847447/100‑1 (MQ=255) tCCAGAACGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCACCAGGCGGGTCGGGTTCTCGTGGTCAg < 1:767725/100‑1 (MQ=255) cAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCACCAGGCGGGTCGGGTTCTCGTGGTCAGAt < 2:1648022/100‑1 (MQ=255) cAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCACCAGGCGGGTCGGGTTCTCGTGGTCAGAt < 1:1458250/100‑1 (MQ=255) aGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATGTCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCACCAGGCGGGTCGGGTTCTCGTGGTCAGAt < 2:1728195/99‑1 (MQ=255) aTCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCACCAGGCGGGTCGGGTTCTCGTGGTCAGATTCa > 2:1052961/1‑100 (MQ=255) | ACCAGCCATTCGGAGAGGATTTCCAGCAGGTTTTTCACCGCCGGACGACCATCCAGACCGATCATATTAAGGTTAATACGATAGCTCTTTTCCAGATCGGTGGTAGCGAAGAGGTGGTTCATCACCTGATCCATATCCACGCGGTTGGAACGCGGCACAATCACCAGGCGGGTCGGGTTCTCGTGGTCAGATTCA > NC_000913/3164919‑3165113 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |