| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,971,690 | A→C | 100% | Q144P (CAG→CCG) | wecC → | UDP‑N‑acetyl‑D‑mannosaminuronic acid dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,971,690 | 0 | A | C | 98.2% | 364.7 / ‑3.2 | 110 | Q144P (CAG→CCG) | wecC | UDP‑N‑acetyl‑D‑mannosaminuronic acid dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base C (48/59); total (49/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.79e-01 | |||||||||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
GCGCGCTGGTGATCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCAGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACGATCGCG > NC_000913/3971594‑3971785 | gcgcgcTGGTGATCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCgccgca < 2:2201642/100‑1 (MQ=255) cgcgcTGGTGATCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGccgcag > 2:609846/1‑100 (MQ=255) gcgcTGGTGATCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAgg < 2:491605/100‑1 (MQ=255) cgcTGGTGATCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCgccgca > 2:1571803/1‑97 (MQ=255) cgcTGGTGATCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGt > 1:1605275/1‑100 (MQ=255) cTGGTGATCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCCGAATGGGTGGCAGAGATGCGTGCGGATCTCACTTTCCcgccgc > 2:1402115/1‑94 (MQ=255) gTGATCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCg < 1:2093135/100‑1 (MQ=255) gATCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAg > 1:1779827/1‑100 (MQ=255) aTCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGc < 1:947093/100‑1 (MQ=255) tCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCa < 1:848464/100‑1 (MQ=255) ccTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAg > 1:966372/1‑100 (MQ=255) cTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAgg > 1:1570817/1‑100 (MQ=255) cTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAg > 1:796081/1‑99 (MQ=255) ttGAATCCTCCTTGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGc < 1:1207204/100‑1 (MQ=255) gattCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGACGGCAGAATCGTGCGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGCGCAGGCgg < 2:2288154/97‑1 (MQ=255) gAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCgg < 2:1780056/100‑1 (MQ=255) gAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCACACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCgg > 2:82585/1‑100 (MQ=255) aTCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAgatcggaag > 2:1524130/1‑91 (MQ=255) ccACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGCACGGTTAGCAGAGCTGCGTCCGGAACTCACTTTCCCGCCGCAGGCGGGAGAGCAGGCCGAc > 2:678539/1‑98 (MQ=255) cACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTc > 1:2101086/1‑100 (MQ=255) aCCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCa > 1:954571/1‑100 (MQ=255) aCCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCa < 2:2054031/100‑1 (MQ=255) aCCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCa < 1:2025765/100‑1 (MQ=255) ccTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCaa > 1:220694/1‑100 (MQ=255) cTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAAc > 1:922898/1‑100 (MQ=255) cTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAAc > 2:1800762/1‑100 (MQ=255) tCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACa < 2:556017/100‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAAc < 1:276080/98‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACAt > 2:1637359/1‑100 (MQ=255) ccGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTGATCATTg > 2:745014/1‑100 (MQ=255) ccGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTg > 1:184370/1‑100 (MQ=255) gTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCtt < 1:671288/100‑1 (MQ=255) gTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCtt < 1:2105086/100‑1 (MQ=255) ggggTCAACCGAGAAAATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTAc < 2:553648/100‑1 (MQ=255) gggTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACt > 1:1234596/1‑100 (MQ=255) ggTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGAGGGCGAGCAAGCGGACGTCAACATTGCTTACTg > 2:2057755/1‑100 (MQ=255) tCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGATATCCCTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGAGCGATCCGGCGGCCGTCAACATTGCTTACTg > 2:1764886/1‑98 (MQ=255) cAACCGAGATGATTGCAGAATGTTTAGCATAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGccc < 2:1521708/100‑1 (MQ=255) cAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCCTCCGGATATCACATTCCCGCCGCAGGTGTGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGccc > 2:1488981/1‑100 (MQ=255) aaCCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCg > 2:2195489/1‑100 (MQ=255) aCCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCgg > 1:1846998/1‑100 (MQ=255) gagaAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCgg < 1:1366928/97‑1 (MQ=255) gagaAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAAc > 2:1734342/1‑100 (MQ=255) aagaTGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAATATTGCTTACTGCCCGGAAcgcg < 2:1391716/100‑1 (MQ=255) aagaTGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAAcgcg < 1:2373917/100‑1 (MQ=255) aagaTGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAAcgcg < 1:1637379/100‑1 (MQ=255) agaTGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAAcgcg < 1:1896/99‑1 (MQ=255) gaTGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCgtg < 2:1265246/100‑1 (MQ=255) gaTGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCgtg < 2:2306037/100‑1 (MQ=255) gaTGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCgt > 1:1831014/1‑99 (MQ=255) tGGCAGAATGGTTAGTAGCGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCgtg < 1:1501741/98‑1 (MQ=255) tGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGtt < 2:1942156/100‑1 (MQ=255) tGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGtt < 2:1241593/100‑1 (MQ=255) tGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGtt > 1:694302/1‑100 (MQ=255) tGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGtt > 2:1088513/1‑100 (MQ=255) ggCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTTACTGTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTa < 2:694294/100‑1 (MQ=255) ggCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTa < 2:1163640/100‑1 (MQ=255) ggCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTa > 1:1671005/1‑100 (MQ=255) gCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAAAATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTa > 2:1721192/1‑99 (MQ=255) cAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTAcc < 2:1447680/100‑1 (MQ=255) cAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCAGGATCTCACTTTCCAGCAGCAGGTAGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTa > 2:1295622/1‑98 (MQ=255) cAGAATGGTTAGAAGAGATGCGTCCGGATCTGACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGGGAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTAcc > 2:793548/1‑100 (MQ=255) gAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAg > 1:1463187/1‑100 (MQ=255) gAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAg < 2:1846977/100‑1 (MQ=255) gTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAg < 2:647416/100‑1 (MQ=255) ttAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTTCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAgg > 1:306556/1‑100 (MQ=255) tatccgcgaTGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTTCCCGGATCGCGTGTTACCAGGACAGGt < 2:1466223/93‑1 (MQ=255) tAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGt > 1:1575137/1‑100 (MQ=255) cAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTGACCAGGACAGGTAAt < 2:384626/100‑1 (MQ=255) agcgaTGCGTCCGGATCTCACTGGCCCGCGGCGGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAAt < 2:2383060/96‑1 (MQ=255) agagATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATg > 1:1173645/1‑100 (MQ=255) gagaTGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATgg < 1:733139/100‑1 (MQ=255) agaTGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGATCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGt < 2:954717/100‑1 (MQ=255) gttGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGTTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGt < 2:806298/97‑1 (MQ=255) gaTGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCTGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGt < 2:408115/99‑1 (MQ=255) gaTGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTc > 2:1312097/1‑100 (MQ=255) tGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGa < 1:45212/100‑1 (MQ=255) tCCGGATCTCACTTTCCCGCAGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTCACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTg < 1:50186/100‑1 (MQ=255) cGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGAt > 2:1526564/1‑100 (MQ=255) ggATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGGGAGCAGGGGGACGTCAACATTGGTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGAt < 2:2272033/99‑1 (MQ=255) ggATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGAtt < 2:410407/100‑1 (MQ=255) gATCTCCCTTTCCCTCCGCAGTTTGGCGAGCAGGCGGATGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCt < 2:1894787/95‑1 (MQ=255) gATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTa < 2:2120794/100‑1 (MQ=255) aTCTCACTTTTCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATTGTCGAGCTGATTa > 2:164249/1‑99 (MQ=255) aTCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTaa < 2:1255225/100‑1 (MQ=255) aTCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTaa > 1:1801513/1‑100 (MQ=255) tctcACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGAtt < 2:1499168/97‑1 (MQ=255) tctcACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTaaa > 1:2264863/1‑100 (MQ=255) ctcACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTaaaa > 1:1552043/1‑100 (MQ=255) cACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAAc < 2:552178/100‑1 (MQ=255) cACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAAc < 2:1732920/100‑1 (MQ=255) aCTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGTCGTCAACATTGGTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAAc < 2:2177305/99‑1 (MQ=255) aCTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACg > 2:285138/1‑100 (MQ=255) cTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACCTTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACGa > 1:1193655/1‑100 (MQ=255) cTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACGa > 1:1737488/1‑100 (MQ=255) tttCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCGGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACGAt < 1:1887845/100‑1 (MQ=255) tttCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACGAt > 2:1445290/1‑100 (MQ=255) tCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACGATcg < 1:86187/100‑1 (MQ=255) ncgccgcAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACGATcgcg > 2:1283499/2‑100 (MQ=255) ccgccgCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCACCATTGCTTACTGCCCGGACCGCGTGATACCAGGACAGGCAATCGTCGAGCTGATTAAACCCGATcgcg > 2:2335424/1‑100 (MQ=255) | GCGCGCTGGTGATCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCAGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACGATCGCG > NC_000913/3971594‑3971785 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |