Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,434,437 | T→A | 40.8% | W109R (TGG→AGG) | ytfH → | DUF24 family HxlR‑type putative transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,434,437 | 0 | T | A | 40.8% | 68.6 / 121.5 | 103 | W109R (TGG→AGG) | ytfH | DUF24 family HxlR‑type putative transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/30); new base A (17/25); total (48/55) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.22e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.28e-01 |
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
AACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATGGC > NC_000913/4434341‑4434534 | aaCCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCCGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGa > 2:1524847/1‑100 (MQ=255) aaCCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGa > 1:2160744/1‑100 (MQ=255) aCCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGAt < 2:1629183/100‑1 (MQ=255) ccGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGAtt < 1:1297484/100‑1 (MQ=255) cGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTg < 2:471966/100‑1 (MQ=255) cGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTAACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTg < 2:450574/100‑1 (MQ=255) cGTATCGCGTATCCGGTGGTGAAGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGAAAGGATTg > 2:472543/1‑100 (MQ=255) tATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAg < 1:515241/100‑1 (MQ=255) tATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAg < 1:1054814/100‑1 (MQ=255) aTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGt < 2:685194/100‑1 (MQ=255) cgcgTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTg < 1:503076/100‑1 (MQ=255) gcgTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGa > 2:2139197/1‑100 (MQ=255) gTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAAt < 2:2168815/100‑1 (MQ=255) tATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAAtt > 2:1770176/1‑100 (MQ=255) tATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAAtt < 1:522407/100‑1 (MQ=255) tATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAAtt < 1:1645722/100‑1 (MQ=255) tATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAAtt < 1:2118446/100‑1 (MQ=255) aTCCGGTGGTGCCGCCGCATGTTGAATATAGCTTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCTAATATGTTTCTTCACTGTTTGACTGGATTGAGTTGAAttt < 2:1049113/100‑1 (MQ=255) aTCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAAttt > 1:374892/1‑100 (MQ=255) tCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTg < 2:2237936/100‑1 (MQ=255) ccGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGc > 2:1849885/1‑100 (MQ=255) nggtggtGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGcc > 1:1915316/2‑100 (MQ=255) cGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAACAGGTTGCTGCCCTGGCGGACTGCATTGAGTTGAATTTGcc > 1:1107041/1‑100 (MQ=255) cGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGcc < 1:1499794/100‑1 (MQ=255) cGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGCTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGcc < 2:1283024/100‑1 (MQ=255) ggtgCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAg > 1:639136/1‑100 (MQ=255) ggtgCCACCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAg > 2:1568021/1‑100 (MQ=255) cgccgcATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGtt > 1:1262999/1‑100 (MQ=255) cgccgcATGTGAAGTATAGTCTCACGCCGCTCGGCCAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTCCACTGCCTGACTGGATTCAGTTGact < 2:2228248/86‑3 (MQ=255) gccgcATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTg > 1:373996/1‑100 (MQ=255) gccgcATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTAtt > 1:64631/1‑99 (MQ=255) gccgcATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTg > 1:1502663/1‑100 (MQ=255) gccgcATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTg < 2:1390788/100‑1 (MQ=255) ccgcATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTgg < 1:2012239/100‑1 (MQ=255) cgcATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGc > 1:1697000/1‑100 (MQ=255) cgcATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGc > 2:331147/1‑100 (MQ=255) cgcATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGc < 1:529963/100‑1 (MQ=255) cATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCgg < 2:1096482/100‑1 (MQ=255) aTGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGATTTGAATTTGTCCGAGGTGTTTGCgt < 2:331003/99‑2 (MQ=255) aTGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCG‑AAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTg < 2:734914/100‑1 (MQ=255) tgtgGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTATTAGCGGt > 1:692729/1‑99 (MQ=255) gtgGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGc > 2:516619/1‑100 (MQ=255) gtgGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGc > 2:689229/1‑100 (MQ=255) tgGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCg > 1:1144588/1‑100 (MQ=255) ggAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAACGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCgg > 1:896583/1‑100 (MQ=255) ggAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCgg > 2:387734/1‑100 (MQ=255) ggAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCgg < 1:1700376/100‑1 (MQ=255) gAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCggg < 2:1865557/100‑1 (MQ=255) aaTATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCggg < 2:2104709/99‑1 (MQ=255) aaTATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGa < 2:417276/100‑1 (MQ=255) atatAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGAt < 1:910519/100‑1 (MQ=255) agataGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGAt < 2:2298608/98‑1 (MQ=255) ataGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGAGTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGa < 2:2260950/100‑1 (MQ=255) ataGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGa < 2:1922228/100‑1 (MQ=255) gCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACg > 2:467643/1‑100 (MQ=255) gCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACg > 1:182564/1‑100 (MQ=255) gCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACg < 2:317205/100‑1 (MQ=255) cACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGTTTGAGTTGAATTTGCCCTATGTGTTGGTGGTGCGGGATGAACGTGc < 2:2134237/99‑1 (MQ=255) aCGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCg > 1:58744/1‑99 (MQ=255) cgccgcTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGGACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGc < 2:800996/100‑1 (MQ=255) ccgcTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCAt > 1:27617/1‑100 (MQ=255) ccgcTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCAt > 2:846951/1‑100 (MQ=255) ccgcTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCAt > 2:847387/1‑100 (MQ=255) ccgcTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTGGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCAt < 1:1928707/100‑1 (MQ=255) cgcTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATa < 2:799854/100‑1 (MQ=255) cgcTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATa > 1:1024137/1‑100 (MQ=255) gcTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGATGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATaa > 2:1784409/1‑100 (MQ=255) tGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTAGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAATGTGCGGCATAAc < 2:257698/99‑1 (MQ=255) gCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGATGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGTGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGc < 2:2027111/99‑1 (MQ=255) cGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCg < 1:1942876/100‑1 (MQ=255) cGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCg > 1:630702/1‑100 (MQ=255) cAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATg < 1:1352475/100‑1 (MQ=255) cAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATg > 2:1629626/1‑100 (MQ=255) aGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATgc > 2:2007994/1‑100 (MQ=255) aGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATgc < 2:391717/100‑1 (MQ=255) ggTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATgcg > 1:2121941/1‑100 (MQ=255) ggTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATgcg > 2:765232/1‑100 (MQ=255) ggTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATgcg > 2:1120628/1‑100 (MQ=255) gTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATgcgc < 1:1656941/100‑1 (MQ=255) tGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCt < 1:172345/100‑1 (MQ=255) gCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAg > 1:229066/1‑100 (MQ=255) cGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGc > 1:249/1‑100 (MQ=255) gAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCt < 2:1271662/100‑1 (MQ=255) gAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCt > 1:194004/1‑100 (MQ=255) gAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCt < 1:1731565/100‑1 (MQ=255) ggTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCt > 1:1935473/1‑100 (MQ=255) gTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTg < 2:2076337/100‑1 (MQ=255) ttGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTgg < 1:994677/100‑1 (MQ=255) gctgcACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTc > 2:2322981/1‑100 (MQ=255) gctgcACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTc < 1:1943248/100‑1 (MQ=255) ctgcACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCt > 2:115077/1‑100 (MQ=255) gcACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCTGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTAc > 1:712341/1‑100 (MQ=255) aCTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTTCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGTGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACgg < 2:1382737/100‑1 (MQ=255) aCTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACgg < 1:2156296/100‑1 (MQ=255) tGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAGCGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTg < 1:295343/100‑1 (MQ=255) ggCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGc < 1:1706134/100‑1 (MQ=255) ggCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGc > 1:1183684/1‑100 (MQ=255) ggACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATg > 1:504920/1‑100 (MQ=255) aCTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATGGc < 1:2309416/100‑1 (MQ=255) aCTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATGGc < 2:1584726/100‑1 (MQ=255) | AACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATGGC > NC_000913/4434341‑4434534 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |