| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 931,952 | C→T | 28.9% | V33V (GTG→GTA) | trxB ← | thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)‑binding |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 931,952 | 0 | C | T | 28.9% | 130.4 / 55.0 | 85 | V33V (GTG→GTA) | trxB | thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (28/32); new base T (8/17); total (36/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.38e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.81e-01 | |||||||||||
ATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCA > NC_000913/931854‑932049 | aTTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGc < 2:1408020/99‑1 (MQ=255) ttAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGtac > 2:716601/1‑100 (MQ=255) taataaCGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGtacn < 2:510275/100‑2 (MQ=255) aataaCGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCAcag > 2:49250/1‑100 (MQ=255) aCGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCAcaggttg > 2:609273/1‑100 (MQ=255) cGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCTAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCAcaggttgc < 1:677559/100‑1 (MQ=255) cGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcaggttgc < 2:1137095/100‑1 (MQ=255) gACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCAcaggttgcag > 1:463738/1‑100 (MQ=255) aCCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCAcaggttgcagg < 1:680472/100‑1 (MQ=255) ccGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcaggttgcaggt > 1:474193/1‑100 (MQ=255) cGGTCAGATCGTTTGGATCTCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCAcaggttgcaggtt < 2:2319388/100‑1 (MQ=255) cGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCAcaggttgcaggtt > 2:679364/1‑100 (MQ=255) gTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTgg < 1:906174/100‑1 (MQ=255) gTCAGATCGTATGGACCCCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTCGTCGTCCGCTGGCCTCCTTTTTCCATGCCGGTTATCAGTAcaggtagcaggttt < 2:1148107/99‑2 (MQ=255) tCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGgc < 2:1176318/100‑1 (MQ=255) gATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGgcgcg > 1:1186809/1‑100 (MQ=255) gATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGgcgcg > 1:818410/1‑100 (MQ=255) gATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCAATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGgcgcg > 1:1921174/1‑100 (MQ=255) aTCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGgcgcgc > 1:2337694/1‑100 (MQ=255) tagTTTGGATCACCAGGCCAGTTTTCCAATTCCGGGGTAGTGATAAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCTGATAATCAGTACAGGTTGCAGGTTAgcgcgcg < 2:1035855/98‑1 (MQ=255) tCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGgcgcgcg < 1:1864436/100‑1 (MQ=255) tCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGgcgcgcg < 2:1790658/100‑1 (MQ=255) gttCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTa < 1:736230/98‑1 (MQ=255) gATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCTCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCATa < 2:1351350/100‑1 (MQ=255) gATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTa > 2:671648/1‑100 (MQ=255) gATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTa > 2:2954/1‑100 (MQ=255) gATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGGCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTa < 1:1686630/100‑1 (MQ=255) tCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTa < 1:525119/98‑1 (MQ=255) cGCCAGGCTAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCACGCCGCGTAGAc < 2:219586/100‑1 (MQ=255) cGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTTGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGAc < 1:697464/100‑1 (MQ=255) cGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGAc < 2:1540403/100‑1 (MQ=255) cGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGAc < 2:1621851/100‑1 (MQ=255) gccaggccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGTTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGTTTGCAGTTTGGCGCGCGCCGCGTAGAc < 2:533008/99‑1 (MQ=255) gccaggccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGAca > 2:2218771/1‑100 (MQ=255) gccaggccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGAca > 1:2112812/1‑100 (MQ=255) gccaggccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGAca > 2:705476/1‑100 (MQ=255) gccaggccagTTTTACACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGTCGCCTTTTTCCATGACGGTAATCAGTACAGGTTTTAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGAca < 2:1667554/100‑1 (MQ=255) ggccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGAcagcag > 1:1554818/1‑100 (MQ=255) gccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACagcagc < 1:1360538/100‑1 (MQ=255) gTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGgtg > 1:1188149/1‑100 (MQ=255) ttttCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCgg < 1:626784/97‑1 (MQ=255) ttCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTAt > 1:1732359/1‑100 (MQ=255) ttCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTAt > 1:1635392/1‑100 (MQ=255) ttCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTAt < 1:1343837/100‑1 (MQ=255) cTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCccgc > 1:994906/1‑100 (MQ=255) tggtggtggTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGcc < 1:1921733/100‑1 (MQ=255) ggtggtggtCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCt < 2:1732338/100‑1 (MQ=255) ggtggtggtCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCt < 2:1635372/100‑1 (MQ=255) gtggtggtCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTg < 1:492913/100‑1 (MQ=255) tggtggtCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGa < 1:1611821/100‑1 (MQ=255) ggtggtCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGaa < 1:1660108/100‑1 (MQ=255) gtggtCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCTGGGCCTGaa > 2:1576397/1‑99 (MQ=255) tggtCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAAcc < 1:554492/100‑1 (MQ=255) tggtCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAAcc < 1:309851/100‑1 (MQ=255) tggtCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAAcc < 1:679372/100‑1 (MQ=255) ggtCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAAccc > 2:919261/1‑100 (MQ=255) ggtCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGATTGCAGATTGGCGAGCGCTGCGTGAACCGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGACTg > 2:410271/1‑95 (MQ=255) tCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAg > 1:1715512/1‑100 (MQ=255) tCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAg < 2:996743/100‑1 (MQ=255) cAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAgg > 2:494072/1‑100 (MQ=255) cAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAgg < 2:489696/100‑1 (MQ=255) ggCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAg > 1:1392424/1‑100 (MQ=255) gccgccTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGc > 1:734668/1‑100 (MQ=255) gccgccTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGc > 2:2386099/1‑100 (MQ=255) ccgccTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCa > 1:1494678/1‑100 (MQ=255) cgccTTTTTCTTTGTCTTTAATCAGCACAGGATGCAGGTTGGCTCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAg > 2:1722921/1‑100 (MQ=255) cTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGttt < 2:1788609/100‑1 (MQ=255) ttttCCATGTCGGTAATCATCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGTCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTAc < 2:671043/100‑1 (MQ=255) ttCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACtg < 2:889975/100‑1 (MQ=255) tCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACtgt < 2:1625215/100‑1 (MQ=255) tCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACtgt < 1:1706728/100‑1 (MQ=255) ccATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACtgtg < 1:51287/100‑1 (MQ=255) cATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTgtgt > 1:189656/1‑100 (MQ=255) cATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTgtgt < 1:2386127/100‑1 (MQ=255) aTGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTGGGCGCGCGCCGCGTAGACAGGAGCGGGGTATTCCGCCGGGCCTGAACCCAGGTTAAGCAGTTTACTGTGtt < 2:466978/100‑1 (MQ=255) tGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGttt < 1:563889/100‑1 (MQ=255) tGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGttt > 1:1770060/1‑100 (MQ=255) ccGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTgg > 2:1288963/1‑100 (MQ=255) ccGGTAAGCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCTGGTAGACAGGAGAGGTTTATCCCGCCGGGCCTGTACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGttt < 2:227258/98‑1 (MQ=255) cGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGt < 1:1345039/100‑1 (MQ=255) ggTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGGGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTc < 2:2085734/100‑1 (MQ=255) gTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCg < 1:727421/100‑1 (MQ=255) aaTCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTg < 1:49251/100‑1 (MQ=255) tCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGcc > 1:654706/1‑100 (MQ=255) tCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGcc > 2:7908/1‑100 (MQ=255) tCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGcc < 2:1715492/100‑1 (MQ=255) tCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGcc > 1:714964/1‑100 (MQ=255) aGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCa > 1:2180467/1‑100 (MQ=255) | ATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCA > NC_000913/931854‑932049 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |