| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 228022 | NA (NA) | 32 (0.320) | 8/164 | NT | NA | noncoding (2264/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon |
| ? | NC_000913 | = 228033 | NA (NA) | noncoding (2275/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon | |||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/227917‑228022‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctcctccGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGG < NC_000913/228033‑227935 GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑C < 2:801778/100‑1GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑C > 1:226788/1‑100GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑C < 1:551416/100‑1GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑C > 1:1131377/1‑100GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑C > 1:1840429/1‑100GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑C < 2:2029319/100‑1GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑C > 2:2503842/1‑100 ccgccaTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATTTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTTGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑C < 2:149833/93‑1 CCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CT > 1:551186/1‑100 CCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CT < 2:1452046/100‑1 CCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CT < 2:219503/100‑1 CGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTC > 1:2500992/1‑100 CGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTC > 2:2162145/1‑100 CGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTC > 2:2051912/1‑100 CGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CT < 2:2766041/99‑1 CGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCAGGGTTGAGGAAAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTC > 1:1072106/1‑100 CGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCATAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CT > 1:2532736/1‑99 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGCTGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCC < 2:725865/100‑1 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCC > 1:2780004/1‑100 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCC < 1:2875204/100‑1 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCC < 2:185522/100‑1 ACCTTGAGATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCT < 2:1946888/100‑1 ACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACTCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCT < 1:881528/100‑1 ACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGTGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCn < 2:1877933/100‑2 ACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCT < 1:1646895/100‑1 ACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCT > 2:2393001/1‑100 CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTC > 1:794543/1‑100 CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTC > 1:794926/1‑100 CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTC > 1:2151211/1‑100 CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTC > 2:3019443/1‑100 CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTC > 1:1707252/1‑100 CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCAGATTGCGGACAGTATCTGGTGGGAAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTC > 1:1036976/1‑100 CTTGAAATACCTCCCTTTTATTTTTTATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCC < 1:432219/100‑1 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGTCCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCC < 1:2426120/100‑1 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCC < 1:1036405/100‑1 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCC < 1:302291/100‑1 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCC < 2:1178508/100‑1 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCC < 2:1230254/100‑1 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCC < 2:190982/100‑1 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCC < 2:1995460/100‑1 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCC < 2:2928473/100‑1 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCC > 2:630106/1‑100 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCC > 1:2869201/1‑100 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGT‑‑‑CTCCTCC < 1:265500/100‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |