| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 228219 = | NA (NA) | 9 (0.090) | 5/166 | NT | NA | noncoding (2461/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon |
| ? | NC_000913 | 228248 = | NA (NA) | noncoding (2490/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon | |||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
TTAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/228323‑228219‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcggtGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGGTTTAG > NC_000913/228248‑228346 TTAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGG > 1:1917770/1‑100TTAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGAACTACTTCAACCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGG > 2:2869169/1‑100 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG > 2:794695/1‑100 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG > 1:1270339/1‑100 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG > 1:2190787/1‑100 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG < 2:2103522/100‑1 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG < 2:1607436/100‑1 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG < 1:2422185/100‑1 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG > 1:51087/1‑100 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACGTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG < 1:1266878/100‑1 AAATTGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCATGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGC < 2:1032578/100‑1 AAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGC < 1:2596992/100‑1 AAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGC < 1:2203423/100‑1 AAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGC < 2:2118655/100‑1 AAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGC < 2:2422377/100‑1 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG > 2:2506875/1‑100 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG > 2:774897/1‑100 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG > 2:2166706/1‑100 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG < 2:95157/100‑1 atggctgttcGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG > 1:1768635/11‑100 ATGGCGAACATCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGTCAGACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 2:1990451/100‑1 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 1:2908263/100‑1 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG > 1:511668/1‑100 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 2:2701558/100‑1 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 1:860941/100‑1 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 1:1828537/100‑1 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 2:1363414/100‑1 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCAGTCGATATGAACTCTTGGGCGG > 1:614573/1‑100 ATGGCGAACAGCCATACACTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGACCTCTTGGGC > 2:1415955/1‑98 TGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGT > 2:130819/1‑100 TGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGT > 1:677336/1‑100 TGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGT < 2:2372774/100‑1 TGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGT < 2:2143743/100‑1 TGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGT < 1:2801903/100‑1 TGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG > 2:289964/1‑99 TGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACAGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGT > 2:1305668/1‑100 GCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCGTCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTTCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 2:1336712/97‑1 TGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGC > 1:325112/1‑99 CAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTT > 1:1973328/1‑100 CAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGATCATCACATACTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGT > 1:251116/1‑99 CAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGATGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTTGGGCTGAAGTAAGTCCCAAGGGTATGGCTGTT > 1:2889960/1‑100 CAAACACCGCCGTCGATATGAAATCTTGGGCGGTGTTCGGCACCTCGATGTCGACTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTAAGGCTGTT > 2:1617110/1‑100 AAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGAGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCAATACATCCTGGGGCTGAAGAAGGTCCCAAGGGTATGGCTGT > 2:1881880/1‑98 AACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCACGGGTATCACTGTTC > 2:1376682/1‑99 AACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCG > 1:1365044/1‑100 ACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGC > 1:2754494/1‑100 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATTACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 1:279699/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCATGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:1651619/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 1:123438/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:1160361/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:2485865/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:1104676/100‑1 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CGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGGTT < 2:8618/100‑1 CGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTACGCAATTTAAAGTGGTACGTGAGCTGG > 1:1057962/1‑97 GGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATTACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGGTTT < 1:127601/100‑1 GGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACTTCCTGTGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGGTTT < 1:647100/100‑1 GGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGTGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGGTTT < 1:2500604/100‑1 GGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGTGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGGTTT < 2:1104686/100‑1 GGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGTTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGCGGTACGCGAGCTGGGTTT > 2:682244/1‑100 GGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGGTTT < 2:383990/100‑1 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TTAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/228323‑228219‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcggtGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGGTTTAG > NC_000913/228248‑228346 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |