| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 343971 = | 91 (0.840) | 16 (0.170) | 11/158 | NT | 17.1% | intergenic (+38/‑205) | yahK/yahL | broad specificity NADPH‑dependent aldehyde reductase, Zn‑containing/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | 344009 = | 74 (0.770) | intergenic (+76/‑167) | yahK/yahL | broad specificity NADPH‑dependent aldehyde reductase, Zn‑containing/uncharacterized protein | |||||
GTACTGGAGGGCGTTAATTTAACAATTTAAATTTACGTTATAGGTTTTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/344075‑343971‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggagagcgaa‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTATGAGCGATT > NC_000913/344009‑344106 GTACTGGAGGGCGTTAATTTAACAATTTAAATTTACGTTATAGGTTTTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGA > 2:2863243/1‑100 TACTGGAGGGCGTTAATTTAACAATTTAAATTTACGTTATAGGTTTTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAG < 1:1704747/100‑1 CTGGAGGGCGTTAATTTAACAATTTAAATTTACGTTATAGGTTTTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCG > 2:959861/1‑100 CTGGAGGGCGTTAATTTAACAATTTAAATTTACGTTATAGGTTTTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCG < 1:2260807/100‑1 TGGAGGGCGTTAATTTAACAATTTAAATTTACGTTATAGGTTTTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGA < 1:1403652/100‑1 GGAGGGCGTTAATTTAACAATTTAAATTTACGTTATAGGTTTTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA > 1:2018847/1‑100 GGAGGGCGTTAATTTAACAATTTAAATTTACGTTATAGGTTTTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA > 2:436431/1‑100 CTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAAGTTAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAA > 2:441098/1‑100 TGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTA > 1:712647/1‑100 GATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAA > 1:1123771/1‑100 TATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCC > 1:1430307/1‑100 TTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑ATAATATAAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTC > 1:127414/1‑100 TTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAAATTAAATTGTTAAATTAACGACCTC > 1:640524/1‑99 TCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAAGTTAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCC > 2:2687274/1‑100 TCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCA > 1:2600399/1‑100 TCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCA > 1:1601594/1‑100 TCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCA > 1:2190492/1‑100 TCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCA > 1:2328950/1‑100 CGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAG > 2:1735461/1‑100 GCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAAGTTAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAG > 1:1096386/1‑100 GCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGT > 1:105679/1‑100 CCTTAACTAAAAAGTTAA‑‑GGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAAAGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCTTCCAGTACACA > 2:1804418/1‑98 AACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATAC < 2:1430293/100‑1 GGAGAGCGAAGTTAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATGTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTA < 2:1096379/100‑1 GCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTATGAGCG > 1:211553/1‑100 GCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTATGAGCG > 1:332610/1‑100 GCGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTATGAGCG > 2:90371/1‑100 CGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAACTTGTTAAATTCACTCCCTCCTGTACTCAACACTTCACACGTTAGTTATCAGCGA > 2:1901949/1‑100 CGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTATGAGCGA > 2:950135/1‑100 CGAA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTATGAGCGA > 1:2588263/1‑100 GAA‑ATAATATCAAATTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTATGAGCGAT < 2:2838214/100‑1 AA‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTATGAGTGATT > 2:2616100/1‑100 GTACTGGAGGGCGTTAATTTAACAATTTAAATTTACGTTATAGGTTTTACTGCTACTTTGATATTATTTCGCTCTCCTTAACTAAAAAGTTAAGTGGAGAGCGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/344075‑343971‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggagagcgaa‑ATAATATCAAAGTAGCAGTAAAACCTATAACGTAAATTTAAATTGTTAAATTAACGCCCTCCAGTACACAATACTTCACACGTTAGTTATGAGCGATT > NC_000913/344009‑344106 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |