| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,161,946 | A→G | 100% | A161A (GCA→GCG) | iceT → | putative citrate/iron‑citrate/zinc‑citrate efflux transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,161,946 | 0 | A | G | 98.1% | 333.3 / ‑2.9 | 102 | A161A (GCA→GCG) | iceT | putative citrate/iron‑citrate/zinc‑citrate efflux transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/0); new base G (46/54); total (48/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.19e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.92e-01 | |||||||||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
CGCGAGCAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCG > NC_000913/2161848‑2162041 | cgcgAGCAATATATGGCGGCGATGACC‑TTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTc < 1:1887196/100‑1 (MQ=255) gcgAGCAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACTTTACCCGGTCAGGTCTGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTc < 1:2543023/100‑1 (MQ=255) gCAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTgg > 2:44556/1‑100 (MQ=255) cAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGc < 1:2021197/100‑1 (MQ=255) cAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTAACCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGACGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTgg > 2:1824721/1‑99 (MQ=255) atatatGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGTTCGGCGGTCTGCTTGTGGTGTACGCGTCGTGGCAc < 2:1453420/100‑1 (MQ=255) atatatGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTgg < 1:705455/97‑1 (MQ=255) atatatGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCAc > 2:2718214/1‑100 (MQ=255) tatctGGCGGCGGTGACCTTTTTCACGATTCCCGGTCGTGTCGGTCGGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTTGTGGAGTACGCGTCGTGGCACt < 2:1668643/100‑1 (MQ=255) tatatGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTAGGTCCGCTGCTCGGTACGGCGCTTGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCAc > 1:2987231/1‑99 (MQ=255) atatGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTg < 2:2810573/100‑1 (MQ=255) atGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGa > 2:643514/1‑100 (MQ=255) atGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGa > 2:1332758/1‑100 (MQ=255) tGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGa < 2:279195/99‑1 (MQ=255) tGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGAt < 1:1054865/100‑1 (MQ=255) ggcggcGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATc > 1:1590134/1‑100 (MQ=255) ggcggcGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATc > 1:2187410/1‑100 (MQ=255) ggcggcGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATc > 2:2228858/1‑100 (MQ=255) ggcggcGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATc > 2:1754811/1‑100 (MQ=255) gcggcgATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATc > 1:2615204/1‑99 (MQ=255) gcggcgATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCt > 1:2413938/1‑100 (MQ=255) tgcgATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCttt > 2:1195453/2‑100 (MQ=255) ggcgATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCttt < 2:1007405/100‑1 (MQ=255) gcgATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCtttt < 1:1908629/100‑1 (MQ=255) aTGTCCCTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGTTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTg < 2:2615172/99‑1 (MQ=255) tgtccTTTGTCAGGTGAGCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTTGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGa < 2:2821339/96‑1 (MQ=255) tGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGAt > 2:522945/1‑100 (MQ=255) tGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGAt > 1:2514207/1‑100 (MQ=255) aCCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATc < 2:2514178/99‑1 (MQ=255) ccTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCaa > 2:2479904/1‑100 (MQ=255) ccTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCaa > 2:1103657/1‑100 (MQ=255) ccTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCaa > 1:690051/1‑100 (MQ=255) ccTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCaa < 1:856576/100‑1 (MQ=255) ccTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCaa < 1:1535438/100‑1 (MQ=255) ccTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCaa < 2:2030706/100‑1 (MQ=255) ccTTTGTCACGTTACCCGGACAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGTGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCa > 2:1015656/1‑99 (MQ=255) tttGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTTCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACa < 1:848590/100‑1 (MQ=255) tttGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACa < 2:2360038/100‑1 (MQ=255) tCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTcc > 1:3022067/1‑100 (MQ=255) cACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTcc < 2:1132810/99‑1 (MQ=255) cACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCg > 2:474965/1‑100 (MQ=255) cACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACACGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCg > 1:707243/1‑100 (MQ=255) aCGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTTCGGCGTTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCgg < 1:301426/100‑1 (MQ=255) cGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGt > 1:2989835/1‑100 (MQ=255) tACCCGGTCAGGTTGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTggg < 1:2076407/100‑1 (MQ=255) tACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTggg < 1:283820/100‑1 (MQ=255) aCCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGTGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTgggg > 2:1225411/1‑100 (MQ=255) aCCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTgggg > 2:2267299/1‑100 (MQ=255) cccGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCTCTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGa < 1:2888653/100‑1 (MQ=255) cGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCTGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGTAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATGCCGGTgggg < 2:2413909/97‑1 (MQ=255) cGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCTTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGAtt < 2:752239/100‑1 (MQ=255) cGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGAtt > 1:2144137/1‑100 (MQ=255) cGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGAt > 2:2601560/1‑99 (MQ=255) tCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATc < 1:1904192/100‑1 (MQ=255) aGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCgg < 1:1195464/100‑1 (MQ=255) ggtcggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGt > 1:2254116/1‑100 (MQ=255) ggtcggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGt > 2:1141412/1‑100 (MQ=255) ggtcggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGAGTAATGGCACTGGATCTTTTTGATAAAAATTCCGGAGGGGATTATCg > 1:2417762/1‑98 (MQ=255) gtcggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTg < 2:2914786/100‑1 (MQ=255) gtcggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTg < 1:2479933/100‑1 (MQ=255) tcggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGTGATTATCGGTGc < 1:1994634/100‑1 (MQ=255) tcggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGc < 1:2331450/100‑1 (MQ=255) tcggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGc < 1:1812173/100‑1 (MQ=255) tcggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGc < 1:2474834/100‑1 (MQ=255) cggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGATCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTg > 2:21101/1‑98 (MQ=255) gtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGa > 2:229949/1‑99 (MQ=255) gtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGAt > 1:2738317/1‑100 (MQ=255) gtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGAt > 1:1430223/1‑100 (MQ=255) ccGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCg < 1:1008783/100‑1 (MQ=255) ccGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAAAATTCCGGTGGGGATTATCGGAGCAATc > 1:2374183/1‑99 (MQ=255) cGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGc > 1:160815/1‑100 (MQ=255) gctgctCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTCGATCACCATTCCGGCGGGGATTATCGGTGCGATCGcc > 2:2043438/1‑100 (MQ=255) cGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGGGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGTGATTATCGGTGCGATCGCCACAt < 2:2957244/98‑1 (MQ=255) ccGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGTACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGt < 1:815975/100‑1 (MQ=255) ggCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTa < 2:2376807/100‑1 (MQ=255) ggCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTa > 2:2719057/1‑100 (MQ=255) ggCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGAGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTa > 1:686175/1‑100 (MQ=255) gcgcTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTaa > 2:1561325/1‑100 (MQ=255) gcTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAAt < 2:707184/99‑1 (MQ=255) cTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGc > 1:816254/1‑100 (MQ=255) cTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGc < 1:5000/100‑1 (MQ=255) cggcggTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCg < 1:2013913/100‑1 (MQ=255) ggcggTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGa > 1:2911586/1‑100 (MQ=255) ggcggTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGa < 1:2186201/100‑1 (MQ=255) cggTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAAc < 2:1590115/100‑1 (MQ=255) cggTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAAc < 2:218914/100‑1 (MQ=255) cggTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAAc < 1:1735472/100‑1 (MQ=255) ggTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACt < 1:1588783/100‑1 (MQ=255) tCTGCTGGTTGAGTACGCGTTTTTTTTTTGGATCTTTTTGTTTTATATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTac < 1:913056/100‑1 (MQ=255) ctgctgGTGGAGTACGCGTCGTGGTACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTaca < 1:425281/100‑1 (MQ=255) gctgGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACAcc < 1:726245/100‑1 (MQ=255) ctgGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCAGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCa > 2:1676698/1‑100 (MQ=255) ggtggAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATACCGAACTACACCATg > 1:94729/1‑100 (MQ=255) ggtggAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCATAGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATg > 1:1578240/1‑100 (MQ=255) ggtgaAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATg > 2:2740697/1‑100 (MQ=255) gtggAGTACGCGTCTTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGc < 2:2821945/100‑1 (MQ=255) gtggAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGc < 1:2228881/100‑1 (MQ=255) aGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCa > 2:1634209/1‑97 (MQ=255) tACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGAcgc < 1:1667092/100‑1 (MQ=255) aCGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGAcgcg < 1:1958157/100‑1 (MQ=255) | CGCGAGCAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCG > NC_000913/2161848‑2162041 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |