| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,278,298 | C→T | 100% | intergenic (‑61/+272) | yejG ← / ← bcr | uncharacterized protein/bicyclomycin/cysteine/sulfonamide efflux transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,278,298 | 0 | C | T | 96.9% | 300.5 / 0.2 | 97 | intergenic (‑61/+272) | yejG/bcr | uncharacterized protein/bicyclomycin/cysteine/sulfonamide efflux transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/3); new base T (46/48); total (46/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.44e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.10e-01 | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GCAGTCGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATCAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTGGTCAC > NC_000913/2278201‑2278391 | ttccgatctGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATtaa < 2:108153/92‑1 (MQ=255) cAGTCGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATtaac > 2:438869/1‑100 (MQ=255) cAGTCGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTCCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATtaac < 2:2479137/100‑1 (MQ=255) aGTCGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTTACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATtaaca < 1:851731/100‑1 (MQ=255) gTCGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATtaacaa > 1:64072/1‑100 (MQ=255) cGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATc < 1:1871252/100‑1 (MQ=255) cGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATc > 2:174516/1‑100 (MQ=255) cGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATc > 1:797260/1‑100 (MQ=255) cGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATc > 1:3021393/1‑100 (MQ=255) gATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATcc < 1:818152/100‑1 (MQ=255) tGGAAGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGt > 2:563050/1‑100 (MQ=255) gACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCt < 2:2723920/100‑1 (MQ=255) aCGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTCTTTTCCCCGGAAGTACATTCACTTCACAATTTGTTTGCATCAATTTTAACATTTCATTAACAAGCCGTCtt < 2:1103960/100‑1 (MQ=255) gATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTta < 2:2939155/100‑1 (MQ=255) gATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTta < 1:999171/100‑1 (MQ=255) aTTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGTACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTtat < 1:221697/100‑1 (MQ=255) tGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATAc < 2:2280437/100‑1 (MQ=255) gagaGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACa > 1:1643009/1‑100 (MQ=255) gagaGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACa > 2:566820/1‑100 (MQ=255) gagaGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATCAACAATCCGTCTTTATACa < 1:866521/100‑1 (MQ=255) agagTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAg > 2:485731/1‑100 (MQ=255) agagTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAg < 2:2862777/100‑1 (MQ=255) gTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATc > 1:1640032/1‑100 (MQ=255) ttGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCg < 1:344273/100‑1 (MQ=255) tttAATGATGTCACTTATTGTCCCCAGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCg < 1:555083/97‑1 (MQ=255) tGTAATGAAGTTACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTTACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCg < 1:1766753/99‑1 (MQ=255) gTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTa > 2:2613709/1‑100 (MQ=255) tAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTaa > 1:1543104/1‑100 (MQ=255) tAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCAGTCTTTATACAGATCGTaa > 1:2538854/1‑100 (MQ=255) gAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGAt > 1:871809/1‑100 (MQ=255) aaatCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGAtt < 2:2957756/97‑1 (MQ=255) gTCACTTATTTTCCCCGGAAGTACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGa < 1:586598/100‑1 (MQ=255) ttaCTTTTTTTCCCCTGAAGCGCATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAATACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGAtt < 2:237364/95‑1 (MQ=255) tCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGa < 1:216327/99‑1 (MQ=255) cACTTATTTTCCCCGTAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATg < 1:1232937/100‑1 (MQ=255) aCTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCTCAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGc < 2:709915/100‑1 (MQ=255) aCTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCAAAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGAtaa > 2:2722912/1‑98 (MQ=255) cTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGcc > 2:2434089/1‑100 (MQ=255) tATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTc > 2:472905/1‑100 (MQ=255) tATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTc > 1:1617234/1‑100 (MQ=255) aTTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATCAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCg < 2:345884/100‑1 (MQ=255) aTTTTCCCCGGAACCACATTCACTACACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCg > 2:1023405/1‑100 (MQ=255) tttCCGCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGCTTACATCAATTTTAACACATTATTAACAATCTGTCTTTATACAGTTCGTAAAGATTGATGCCTc < 2:1206645/97‑1 (MQ=255) tttCCCCTGAAGCACATTCACTTCAAAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGcc < 2:642287/100‑1 (MQ=255) tttCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGcc < 2:1462535/100‑1 (MQ=255) ttCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCt > 1:801166/1‑100 (MQ=255) tCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCta < 1:2125798/100‑2 (MQ=255) cccGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGcagatcggaag > 1:1969948/1‑90 (MQ=255) cGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTg < 1:1947221/100‑1 (MQ=255) cGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTg < 2:1594542/100‑1 (MQ=255) ggAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTgg < 1:731476/100‑1 (MQ=255) gAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAAGCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTgg < 2:2708284/99‑1 (MQ=255) gAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTAACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCTGACTTTATACAGATCATCAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTg > 2:465800/1‑98 (MQ=255) aaGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGcc < 1:7735/100‑1 (MQ=255) aGCACATTCCCTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAAATCGTAAAGATTAAAGCCTCGCCTGCGTgg > 2:1114186/1‑97 (MQ=255) gCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCctc < 1:1329882/100‑1 (MQ=255) gCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCctc < 1:163568/100‑1 (MQ=255) acaTTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTa > 2:2668220/1‑100 (MQ=255) caTTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTAt > 2:2397801/1‑100 (MQ=255) caTTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTAt > 1:279212/1‑100 (MQ=255) aTTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATTCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATg < 1:783532/100‑1 (MQ=255) tcacttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGc < 1:2594476/100‑1 (MQ=255) tcacttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGc < 2:1736458/100‑1 (MQ=255) gcttcacACTTTGTTTACATCAATTATAACACATCATTCACAATCCGTCTTTATACAGGTCGTCAAGATTGATGCATCACCTGCTTGGCCTCTATGGc > 2:2910109/2‑98 (MQ=255) ttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTg < 1:2598601/100‑1 (MQ=255) cacaATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATCAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGAt < 2:262806/100‑1 (MQ=255) acaATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCCTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCCCTGAt > 1:1549404/1‑99 (MQ=255) aaTTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTa > 1:1570468/1‑100 (MQ=255) tttGTTTACATCAATTTTAACACATTATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAg < 2:2022902/100‑1 (MQ=255) tttGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAg < 2:801162/100‑1 (MQ=255) ttGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGt < 1:1975342/100‑1 (MQ=255) tGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTa < 1:726285/100‑1 (MQ=255) tACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAatat > 2:1536001/1‑100 (MQ=255) aCATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATc < 2:2931744/100‑1 (MQ=255) cATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCt > 1:1014897/1‑100 (MQ=255) cATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCt > 1:2401156/1‑100 (MQ=255) cATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGACTGCGTGGCTTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCt > 2:565781/1‑100 (MQ=255) cATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATACCTCGCCTGAGTAGCCTATATGTCTCTGATATAAGTAatatat > 1:477870/1‑98 (MQ=255) aTCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTg > 1:1540762/1‑100 (MQ=255) tCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTCATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGACACAGAACAAAATAATATCt > 1:745000/1‑98 (MQ=255) cAATTTTAACACATCATTATCAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCg < 2:220420/100‑1 (MQ=255) cAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCg < 1:933023/100‑1 (MQ=255) aaTTTTAACACATCATTAACAATCCGTTTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCgg < 1:1812820/100‑1 (MQ=255) aaTTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCgg < 1:1952386/100‑1 (MQ=255) aaTTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCACCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCgg > 2:2136987/1‑100 (MQ=255) aTTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCggg < 2:1243139/100‑1 (MQ=255) ttttAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGTTCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGc < 1:2325629/100‑1 (MQ=255) ttAACACATCATTGACAATCCGTTTTTATACAGATTGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGt < 1:474193/100‑1 (MQ=255) ttAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGCTCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGt > 2:1813730/1‑100 (MQ=255) ttAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGt < 1:1536019/100‑1 (MQ=255) aaCACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCATCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTgg > 1:20838/1‑100 (MQ=255) acacATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTGGt > 2:476180/1‑100 (MQ=255) cacaTCCTTACCAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGAGTGGCCTCTATCGCGCTGATTTAAGTAATATCTGCAGGCGt > 2:2682987/1‑96 (MQ=255) cacaTCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTgg > 2:659049/1‑98 (MQ=255) cacaTCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTGGTc < 1:1561677/100‑1 (MQ=255) cacaTCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTAGCCTGCGTGGCCTCAATGGCTCTGATTTAAGAAATATCTGCGGGCGTGGTc > 1:918713/1‑100 (MQ=255) acaTCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTGGTCa > 1:977412/1‑100 (MQ=255) acaTCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTGGTCa > 2:2118527/1‑100 (MQ=255) catcatTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTGGTCAc > 1:1341594/1‑100 (MQ=255) cattaACAGTCCGTATTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTGGTCAc < 2:2271215/97‑1 (MQ=255) | GCAGTCGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATCAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTGGTCAC > NC_000913/2278201‑2278391 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |