| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,058,585 | C→T | 30.4% | intergenic (‑175/+81) | serA ← / ← rpiA | D‑3‑phosphoglycerate dehydrogenase/ribose 5‑phosphate isomerase, constitutive |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,058,585 | 0 | C | T | 30.4% | 163.6 / 88.5 | 122 | intergenic (‑175/+81) | serA/rpiA | D‑3‑phosphoglycerate dehydrogenase/ribose 5‑phosphate isomerase, constitutive |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (46/37); new base T (24/13); total (72/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.23e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.56e-01 | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
GGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTT > NC_000913/3058486‑3058683 | ggCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGAc < 2:1285771/100‑1 (MQ=255) gCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACa < 2:1913296/100‑1 (MQ=255) tatGAACGTTTGCGTCGCGATGGTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTg < 2:1716364/100‑1 (MQ=255) atGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGc > 2:891265/1‑100 (MQ=255) tGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATAACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATACGGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAAttcc > 2:1351393/1‑97 (MQ=255) gAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCt < 1:140644/100‑1 (MQ=255) aaCGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTg < 2:2423249/100‑1 (MQ=255) cGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGt > 1:1597916/1‑100 (MQ=255) gTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTa < 2:216613/100‑1 (MQ=255) tGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTaaaa > 2:1029477/1‑100 (MQ=255) tGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTaaaa > 2:2363532/1‑100 (MQ=255) gCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAg < 1:1100447/100‑1 (MQ=255) cgcgATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTg < 2:1921725/100‑1 (MQ=255) cgcgATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTg < 2:104254/100‑1 (MQ=255) gcgATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGa > 1:2187203/1‑100 (MQ=255) cgATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGac < 2:2141125/100‑1 (MQ=255) cgATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGac < 1:1208355/100‑1 (MQ=255) gATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGaca < 2:1558422/100‑1 (MQ=255) gATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGaca > 2:2955543/1‑100 (MQ=255) tGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGAcaca > 1:2162710/1‑100 (MQ=255) gTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATGTGCTGGATTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGAAAATTGCCTGGTAAAAGCGTGAcaca > 2:2555474/1‑99 (MQ=255) ttGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATg < 1:1414294/100‑1 (MQ=255) tGAGGAAATATCACGCAACGGTAATTATTGGATGAATATGCTGGTTTATAGGATATATTTAGAGGAATCGACAATTGCGTGGTAAAAGCGTGAAACATg > 2:700293/1‑99 (MQ=255) tGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGTTGACTCTGTTGTTATAAAGGAAAAATTTAGAAAAATCGACAATTGCCTTGTAAAAGCGTGACACATGt > 1:62501/1‑100 (MQ=255) tGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGt > 2:1928973/1‑100 (MQ=255) tGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGt > 1:758536/1‑100 (MQ=255) tGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGt > 2:767048/1‑100 (MQ=255) gAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATg > 1:2847308/1‑98 (MQ=255) ggAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGTAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACAAATGTCAc > 1:982334/1‑100 (MQ=255) ggAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCAc > 1:2357368/1‑100 (MQ=255) cACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCAGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTa > 1:454801/1‑100 (MQ=255) gCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATTGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTaa < 1:2295673/98‑1 (MQ=255) gCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATg < 2:395568/100‑1 (MQ=255) gCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATg < 2:1281535/100‑1 (MQ=255) gCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATg < 2:1718238/100‑1 (MQ=255) gCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGAAAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTa > 2:745049/1‑97 (MQ=255) cAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGa > 2:2289306/1‑100 (MQ=255) ggTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAagag > 1:1747701/1‑100 (MQ=255) aTTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAAtt > 2:349928/1‑100 (MQ=255) tCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTAATTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAAtttt > 1:2891211/1‑100 (MQ=255) cTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAAttttt < 1:894335/100‑1 (MQ=255) cTTGGATGAATATGCTGGATTAGAGGATTAATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAAtttt > 2:1471498/1‑99 (MQ=255) ttGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAAtttttn < 1:2369443/100‑2 (MQ=255) ttGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAAtttttt < 2:2955693/100‑1 (MQ=255) ccgatctaaTATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAAtttttt < 2:375718/93‑1 (MQ=255) ggATGAATATGCTGGTTTAGAGGAGTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCATGGTAAAAGCGTGACACATGTAACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTa > 2:1422852/1‑100 (MQ=255) gATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTaa > 2:798607/1‑100 (MQ=255) aTGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAAc > 1:2220883/1‑100 (MQ=255) aTGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATATTTTTAAc > 1:1547999/1‑100 (MQ=255) tGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAAc < 1:2521511/99‑1 (MQ=255) tGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACg > 2:1642204/1‑100 (MQ=255) gAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACgg < 1:2104955/100‑1 (MQ=255) aaTATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACggg > 1:1750942/1‑100 (MQ=255) tatGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACggggg > 1:1425744/1‑100 (MQ=255) tatGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACg > 1:515303/1‑96 (MQ=255) atGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGa > 1:1466605/1‑100 (MQ=255) tGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAg > 2:1897588/1‑100 (MQ=255) gCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACTGGGGa > 2:806678/1‑98 (MQ=255) gCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAg > 1:470247/1‑99 (MQ=255) gCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAgg > 2:1568236/1‑100 (MQ=255) cTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAgg > 1:2782384/1‑99 (MQ=255) tagTTTAGAGGATTTACTTAGAGCAATCGACAATTGCCTCGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAAGt < 2:2121137/97‑1 (MQ=255) tGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGaacct < 1:2174973/100‑5 (MQ=255) ttAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTcccc < 1:479031/100‑1 (MQ=255) tAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTccc > 1:2587346/1‑98 (MQ=255) tAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTccccc < 2:2043824/100‑1 (MQ=255) agagGATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCg < 1:1159208/100‑1 (MQ=255) agagGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCg < 1:1133242/100‑1 (MQ=255) agagGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAAAAATTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCg > 1:1204902/1‑100 (MQ=255) gagGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGt > 1:2601733/1‑100 (MQ=255) agGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTc < 2:674030/100‑1 (MQ=255) ggATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAACCTCCCCCGtta < 2:1273452/100‑3 (MQ=255) ggATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCa > 1:2971734/1‑100 (MQ=255) ggATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCa > 2:1468390/1‑100 (MQ=255) gATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAg < 2:1637418/100‑1 (MQ=255) gATTTATTTAGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAg < 2:2061921/100‑1 (MQ=255) gATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAg > 1:104212/1‑100 (MQ=255) gATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAg > 1:1555354/1‑100 (MQ=255) tttatttaGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGAt > 2:406975/1‑100 (MQ=255) atttaGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGAGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAAAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCACCAGTCAGATCAt > 1:2889262/1‑100 (MQ=255) atttaGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCAt > 2:287397/1‑100 (MQ=255) tttaGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAATCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTGAACGGGGGAACCTCCCCCGttaaaaaaat < 1:1255467/100‑10 (MQ=37) tttaGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCAtn < 2:1819685/100‑2 (MQ=255) taGAGCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTc > 2:1067984/1‑100 (MQ=255) taGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTc < 1:2759667/100‑1 (MQ=255) taGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTc < 2:2891179/100‑1 (MQ=255) agagCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTca < 1:1592796/100‑1 (MQ=255) agagCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTca > 1:2567732/1‑100 (MQ=255) agagCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTca < 2:1419983/100‑1 (MQ=255) gagCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTcac < 2:1709232/100‑1 (MQ=255) gCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACaa > 2:2156279/1‑100 (MQ=255) gCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCACCGTCAGATCATTTCACaa > 1:1240492/1‑100 (MQ=255) gCAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGAGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACaa > 2:2156331/1‑100 (MQ=255) gCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACaa > 1:2450334/1‑100 (MQ=255) cAATCGATAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGAGGAGGTTCCCCAGTCAGATCATTTCACAAt > 1:2400833/1‑100 (MQ=255) cAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAAt < 2:104211/100‑1 (MQ=255) gACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGttt < 2:2357341/100‑1 (MQ=255) gACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGttt > 1:2468624/1‑100 (MQ=255) cAATTGCCTGGTAATAGCGTGACACATGTTACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGtttt < 1:1862234/99‑1 (MQ=255) cAATTGCCTGGTAAAAGCGTGAAACATATCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGtttt > 2:710158/1‑99 (MQ=255) | GGCAATATGAACGTTTGCGTCGCGATGTTGAGGAAATATCACGCAAAGGTAATTCTTGGATGAATATGCTGGTTTAGAGGATTTATTTAGAGCAATCGACAATTGCCTGGTAAAAGCGTGACACATGTCACCAAATTTAATGAAGAGAATTTTTTTAACGGGGGAGGTTCCCCCGTCAGATCATTTCACAATGGTTTT > NC_000913/3058486‑3058683 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |