| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,524,413 | A→G | 100% | I515V (ATT→GTT) | mrcA → | penicillin‑binding protein 1a, murein transglycosylase and transpeptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,524,413 | 0 | A | G | 97.2% | 425.0 / ‑1.0 | 131 | I515V (ATT→GTT) | mrcA | penicillin‑binding protein 1a, murein transglycosylase and transpeptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (4/1); new base G (59/67); total (63/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.95e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
GCAAGTATGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGAATATCTGCA > NC_000913/3524317‑3524507 | gCAAGTATGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTc < 2:799588/100‑1 (MQ=255)gCAAGTATGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTc < 1:861977/100‑1 (MQ=255) aGTATGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCt < 1:340815/100‑1 (MQ=255) aGTATGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCt < 1:343280/100‑1 (MQ=255) tGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACg < 1:3039274/100‑1 (MQ=255) tGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACg < 1:1950816/100‑1 (MQ=255) tGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACg > 1:1817888/1‑100 (MQ=255) tGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACg > 2:1727843/1‑100 (MQ=255) tGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGACGCAGGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAAAACTCGCCGCCACAATATGCTGGTCCAATTCGCTTACg > 1:62325/1‑100 (MQ=255) gTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGTCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGACCAGTTCACTTAc > 1:573238/1‑98 (MQ=255) gTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGt > 2:2547766/1‑100 (MQ=255) tGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATTCAAGTGCCTGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCa < 1:258821/100‑1 (MQ=255) tGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCa < 1:257834/100‑1 (MQ=255) aaCGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAgg < 1:2301695/100‑1 (MQ=255) aCGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAggg > 1:2393072/1‑100 (MQ=255) aCGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAggg < 2:2199117/100‑1 (MQ=255) cGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAggg < 2:1913621/99‑1 (MQ=255) gATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGc > 2:53106/1‑100 (MQ=255) tgCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCTGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTggg < 1:880310/100‑1 (MQ=255) tgCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTggg > 1:652222/1‑100 (MQ=255) gCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGt > 2:1827006/1‑100 (MQ=255) gCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGt < 1:2587270/100‑1 (MQ=255) gCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGt < 1:1536862/100‑1 (MQ=255) gCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGGGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACGACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGt < 2:1565725/100‑1 (MQ=255) ccAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCTGAAGAAGTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTc < 1:510796/100‑1 (MQ=255) ccAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTc < 2:32040/100‑1 (MQ=255) ccAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTc < 2:1966887/100‑1 (MQ=255) cAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCa > 1:2445950/1‑100 (MQ=255) aaTTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAg > 2:105547/1‑100 (MQ=255) tttCTCGCTGGGATGCAAGTGGCGGTTCTCACTGGCAGCCGAAGACCTCACCACGGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTc < 2:1287279/100‑1 (MQ=255) tttCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTc < 2:1799439/100‑1 (MQ=255) ttCTCGCTGGGATTCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGt < 2:1010950/98‑1 (MQ=255) cGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGaaaa > 1:2091174/1‑100 (MQ=255) tGGGACGCAGGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAAAACTCGCCGCCACAATATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGACTGGGCCAGTCGAAAAACg > 2:811372/1‑100 (MQ=255) gggATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACgt > 2:2572981/1‑100 (MQ=255) gggATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACgt > 1:1081684/1‑100 (MQ=255) ggATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACgtg < 1:105548/100‑1 (MQ=255) ggATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACgtg < 2:2173628/100‑1 (MQ=255) gATGCAAGTGCCGTTTCTGAGTGGCAGCCGAAGATCTCACCACCGCAGTATGCTGGGCCAGTTGGCTTATGTCATGGGCTGGGTAAGTGGAAAAACgtgg < 2:1396646/100‑1 (MQ=255) gATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACgtgg < 1:68657/100‑1 (MQ=255) gATGCAAGTGCCGGTCCTCAGTGGCAGCCGAACAACTCTCCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGTTAAGTCGAAAAACgtgg < 2:3029871/100‑1 (MQ=255) aTGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACgtggt < 1:53106/100‑1 (MQ=255) tGCAATTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACgt > 2:1330778/1‑96 (MQ=255) tGCAAGGGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACgtgg < 2:2021159/98‑1 (MQ=255) tGCAAATGACGGTTCTGACTGGCAGCCAAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACgtggtg > 2:1924982/1‑100 (MQ=255) gCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGa > 1:2235010/1‑100 (MQ=255) cAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTAGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGAt > 2:1810846/1‑100 (MQ=255) aGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATgg < 1:1145745/100‑1 (MQ=255) aGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATgg < 2:643627/100‑1 (MQ=255) tGCCGGTTCTGTCTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTa < 1:412176/100‑1 (MQ=255) tGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTa > 2:2344441/1‑100 (MQ=255) ccGGTTCTGACTGACAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTAcg > 1:2710766/1‑100 (MQ=255) ggTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTAcgcg > 2:1426190/1‑100 (MQ=255) tCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCaa > 2:1094641/1‑100 (MQ=255) cTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAAt > 1:1168016/1‑100 (MQ=255) gACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGACAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGc < 1:1842466/100‑1 (MQ=255) gACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGc > 1:588431/1‑100 (MQ=255) cTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCg > 2:538435/1‑99 (MQ=255) tcgCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCggg < 2:321194/98‑1 (MQ=255) tGGCCGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCggg < 2:729194/100‑1 (MQ=255) ggCATCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATTCTTGTCCAGTTCTCTTACGTCAGGTGCTGGCTCAGTCGAAAAACGTGGTGATCGTACACGCAGTACggac > 2:1624016/1‑98 (MQ=255) ggCAGCCGAAGACCTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAATAACGTTGTGATGGTACGCGCAATGCGGGc < 2:1921087/100‑1 (MQ=255) ggCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGc > 2:2067036/1‑100 (MQ=255) ggCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGc > 1:29686/1‑100 (MQ=255) cAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGa > 1:1286744/1‑100 (MQ=255) aGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTAGCAAAACGTAGTGATGGTACGCGCAATGCGCGCGa > 1:1491223/1‑99 (MQ=255) ccGAAGAACTCACCACCGCAGTATTCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTAAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATgg < 1:1089201/100‑1 (MQ=255) ccGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTGCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATACGGGCGATgg > 2:1997900/1‑100 (MQ=255) cGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATggg > 2:1731781/1‑100 (MQ=255) cGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATggg < 2:1259199/100‑1 (MQ=255) cGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATggg < 1:1150752/100‑1 (MQ=255) cGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATggg > 1:275815/1‑100 (MQ=255) cGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATggg > 1:1777819/1‑100 (MQ=255) gaagaaCTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGc > 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tcgccacgGCAGTATGCTGATCCAGTTCGCTTACGTCAGTGTCGGGGTCAGTCTAAAAACGTGGTGATGTTACGCTCAATTCGGGCGATGGGCGTCGACt > 2:1004199/4‑100 (MQ=255) tCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACt < 2:1537944/100‑1 (MQ=255) caccacCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTa > 2:178016/1‑100 (MQ=255) caccacCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTa > 1:1931564/1‑100 (MQ=255) caccacCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTa > 1:2929892/1‑100 (MQ=255) accaccGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGTTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTAc < 1:2585756/100‑1 (MQ=255) accaccGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTAc < 2:2796497/100‑1 (MQ=255) ccaccGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACg < 1:178018/100‑1 (MQ=255) ccaccGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGAGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACg > 1:397380/1‑100 (MQ=255) caccGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATAGGCGTCGACTACGc > 1:1336272/1‑100 (MQ=255) cGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGc < 1:1286025/100‑1 (MQ=255) cAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAg < 2:29686/100‑1 (MQ=255) aGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAGACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGa < 2:1470782/100‑1 (MQ=255) aTGCTGGTGCAGGTCGGTTACGTGAGGGGTGGGGGCAGTCGAAAAACGTGGTGGTGGTACGCGTAATGCGGTCGATGGGCTTCGACTACGCTGCa < 2:2756091/95‑1 (MQ=255) aTGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGAata > 1:2760885/1‑100 (MQ=255) gCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGAATATc > 2:1190491/1‑100 (MQ=255) cTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCCGAATATc > 2:2875727/1‑99 (MQ=255) tGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGAATATCTg < 2:275812/100‑1 (MQ=255) gTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGAATATCTGCa > 1:1101899/1‑100 (MQ=255) | GCAAGTATGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGAATATCTGCA > NC_000913/3524317‑3524507 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |