| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,022,987 | G→T | 33.0% | A84A (GCG→GCT) | tatC → | TatABCE protein translocation system subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,022,987 | 0 | G | T | 33.0% | 173.6 / 97.9 | 126 | A84A (GCG→GCT) | tatC | TatABCE protein translocation system subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (44/40); new base T (16/26); total (60/66) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.85e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
GCAGTTGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGCTCTCTGCTG > NC_000913/4022888‑4023086 | gCAGTTGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAgcg < 1:1597771/100‑1 (MQ=255) gTTGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCg > 2:2413125/1‑100 (MQ=255) ttGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCgg < 2:1409041/100‑1 (MQ=255) ttGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCgg < 1:1336144/100‑1 (MQ=255) tGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGt > 1:2714078/1‑100 (MQ=255) gCCGCTAGGTTCAACGATCATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTg > 2:1240293/1‑100 (MQ=255) gCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTg < 1:110852/100‑1 (MQ=255) gCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTg < 1:1125726/100‑1 (MQ=255) gCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAACGCCGGt > 1:417943/1‑99 (MQ=255) ccGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGa > 1:602092/1‑100 (MQ=255) cGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGAt > 2:1888583/1‑100 (MQ=255) gCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGAtt < 2:867225/100‑1 (MQ=255) cAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATtc < 1:492206/100‑1 (MQ=255) gTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTa < 2:609532/100‑1 (MQ=255) tCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCTTCGTCTTTCTTTATGCTGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATc < 1:1006850/100‑1 (MQ=255) tCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTTGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATc < 1:1440374/100‑1 (MQ=255) tCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATc < 2:2451024/100‑1 (MQ=255) tCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATc < 1:2227477/100‑1 (MQ=255) tCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATc > 1:492440/1‑100 (MQ=255) tCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATc > 1:1954540/1‑100 (MQ=255) tCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATc < 1:2235602/100‑1 (MQ=255) aaCGATGATCGCCACCGACGTGGGCTCACCGCACTTTACGCCAATCAAGCTGAACCAACTGCTGTCGCCGATTATGTCAGCGCCGGTGATTCACTa > 2:1632925/1‑96 (MQ=255) aaCGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAg < 2:18129/100‑1 (MQ=255) aCGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAgg < 1:301628/100‑1 (MQ=255) cGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGgt > 1:420946/1‑100 (MQ=255) cGATGATCGCCACCGACGTGACCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGgt > 2:1272403/1‑100 (MQ=255) gatgatCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGgtg < 1:2426274/100‑1 (MQ=255) gatgatCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCGTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCTGGTTATTCTCTATCAGgtg < 2:340352/100‑1 (MQ=255) tgatCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGtgtg > 1:617370/1‑100 (MQ=255) gatCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTgg > 1:93953/1‑100 (MQ=255) atCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTggg < 2:2714046/100‑1 (MQ=255) tCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCAGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGc > 1:1623354/1‑100 (MQ=255) cGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCa < 1:692297/100‑1 (MQ=255) cGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATc < 2:1893714/100‑1 (MQ=255) gACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCg < 1:607539/100‑1 (MQ=255) gACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCg < 2:1566762/100‑1 (MQ=255) gTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGccc < 1:1654502/100‑1 (MQ=255) tGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGcccc < 2:181544/100‑1 (MQ=255) ggCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCa > 1:1106958/1‑100 (MQ=255) ggCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCa > 1:1552960/1‑100 (MQ=255) gCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAg < 1:2589446/100‑1 (MQ=255) gCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAg > 1:2027393/1‑100 (MQ=255) tCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAgcgc < 2:1138862/100‑1 (MQ=255) cGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCt < 1:1600389/100‑1 (MQ=255) gCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTg < 1:2304720/100‑1 (MQ=255) accGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGCCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCGTTTATCGCCCCAGCGCTg > 1:2772489/2‑100 (MQ=255) ccGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGt < 1:693700/100‑1 (MQ=255) ccGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAgc > 2:2174808/1‑95 (MQ=255) ccGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGt > 1:1883009/1‑100 (MQ=255) ccGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATAAGGTATGGGCATTTAACGCCCCAgcgc > 1:1613833/1‑97 (MQ=255) cGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGta < 1:347030/100‑1 (MQ=255) gTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGtat < 1:2413154/100‑1 (MQ=255) gTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATAGTATCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATGCTCAATAAGGTGAGGGCatatataccccacgc > 2:2609376/1‑84 (MQ=255) ttCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGtata > 1:1610716/1‑100 (MQ=255) ttCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGtata < 2:2245554/100‑1 (MQ=255) ttCTTTACGCCGATCAAGCTGAACTTTATGGTGTCGTTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGtata < 1:129495/100‑1 (MQ=255) tCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATaa > 1:1291163/1‑100 (MQ=255) cTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGTGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAg < 2:2545894/100‑1 (MQ=255) cTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAg < 2:48231/100‑1 (MQ=255) cTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGCCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAAGTGTAGGCATTTATCACACCAGCGCTGTATAAg > 1:1207934/1‑100 (MQ=255) tttACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGc > 1:500490/1‑100 (MQ=255) tttACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGATTTTGGCATTTATCGCCCCAGCGCTATATaa > 1:1354488/1‑98 (MQ=255) ttACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCACAGCGCTGTATAAGCa > 2:38553/1‑100 (MQ=255) tACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCAt < 2:415973/100‑1 (MQ=255) cGCCGATCAAGCTGACCTTTATTTTTTCTCTTATTCTTTCAGCTCCTTTTATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATg < 1:2328370/99‑1 (MQ=255) cGCCGATCAAGCTGACCTATATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGa > 2:973495/1‑100 (MQ=255) gCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATAAGGTATGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGaa > 1:25077/1‑100 (MQ=255) gCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGaa < 2:642587/100‑1 (MQ=255) cGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCTCCAGCGCTGTATAAGCATGAACg < 2:143896/100‑1 (MQ=255) aTCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTc < 1:994738/100‑1 (MQ=255) tCAAGCTGACTTTTATGGTTTCGCTTATTCTGTCAGCGTCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCg < 1:2444272/100‑1 (MQ=255) aGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCt > 1:2261157/1‑100 (MQ=255) aGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCt > 1:123388/1‑100 (MQ=255) aCCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCtggtgg > 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ttATGGTGTCGCTGATACTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGcc < 2:1765566/100‑1 (MQ=255) tATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCg > 2:16789/1‑100 (MQ=255) aTGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCgc < 2:2410278/100‑1 (MQ=255) ggTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCgctg > 1:1032380/1‑100 (MQ=255) tgtCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCgctgct < 1:670841/100‑1 (MQ=255) tCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTTATTCTCTATCAGTTGTGGGCATTTATCGCGCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTgg < 1:404664/100‑1 (MQ=255) cGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGt > 1:2147926/1‑100 (MQ=255) gCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGtt < 1:2874715/100‑1 (MQ=255) gCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGtt < 2:157095/100‑1 (MQ=255) cTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGttt < 1:1577746/100‑1 (MQ=255) gATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTcc < 1:369743/100‑1 (MQ=255) cTGTCAGCTCCGTTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAg > 2:134220/1‑98 (MQ=255) tGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGctc < 2:2755966/100‑1 (MQ=255) tGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGctc < 2:865197/100‑1 (MQ=255) tGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGctc < 2:1363417/100‑1 (MQ=255) gTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGctct > 2:1552527/1‑100 (MQ=255) cAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGCGTGGGTATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGctttct > 2:2111973/1‑100 (MQ=255) aGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGCTCTctg > 2:1567998/1‑100 (MQ=255) gcCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGCTCTctgctg < 1:2242854/100‑1 (MQ=255) | GCAGTTGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGCTCTCTGCTG > NC_000913/4022888‑4023086 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |