| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,547,319 | C→A | 100% | R742S (CGT→AGT) | fimD → | fimbrial usher outer membrane porin protein; FimCD chaperone‑usher |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,547,319 | 0 | C | A | 96.8% | 329.1 / 0.2 | 105 | R742S (CGT→AGT) | fimD | fimbrial usher outer membrane porin protein; FimCD chaperone‑usher |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/1); new base A (47/54); total (50/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.45e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
CTGGGGCAGCCGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACG > NC_000913/4547223‑4547415 | cTGGGGCAGCCGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTg > 2:1779058/1‑100 (MQ=255) ggggCAGCCGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGt < 1:1939961/100‑1 (MQ=255) ggggCAGCCGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGt < 2:2174127/100‑1 (MQ=255) ggggCAGCCGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGt < 1:938013/100‑1 (MQ=255) gggCAGCCGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGtt > 1:13355/1‑100 (MQ=255) ggCAGCCGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTa < 1:460348/100‑1 (MQ=255) gCAGCCGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGGAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTAt < 1:1413648/100‑1 (MQ=255) cAGCCGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATg > 2:1530467/1‑100 (MQ=255) gCCGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGcc > 1:1881082/1‑100 (MQ=255) cGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGt > 1:1745068/1‑100 (MQ=255) gTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGtg < 2:1731130/100‑1 (MQ=255) gTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGtg > 2:243164/1‑100 (MQ=255) ttAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGtgc < 2:2397050/100‑1 (MQ=255) atgATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGtgctgc < 1:2075231/97‑1 (MQ=255) aCGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGtgctgca < 2:2563447/100‑2 (MQ=255) aCGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGcc < 1:1759407/100‑1 (MQ=255) gATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCtt > 2:1030463/1‑100 (MQ=255) aTACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTa < 1:996157/100‑1 (MQ=255) aTACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTa > 1:2004798/1‑100 (MQ=255) aTACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTa < 1:1602584/100‑1 (MQ=255) tACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTAt > 1:1768948/1‑100 (MQ=255) aCGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATg < 2:673228/100‑1 (MQ=255) aCGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCCCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATg < 2:646087/100‑1 (MQ=255) cGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGc > 1:2002188/1‑100 (MQ=255) cGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGc > 1:2211747/1‑100 (MQ=255) ggtggtGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGcc < 1:641035/100‑1 (MQ=255) ggtggtGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGcc > 2:64905/1‑100 (MQ=255) gtggtgCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCa > 2:882892/1‑100 (MQ=255) gtgCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTg < 2:3031792/100‑1 (MQ=255) gtgCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTg < 1:243167/100‑1 (MQ=255) tgCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGa > 2:2986447/1‑100 (MQ=255) gCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGaa < 2:1920605/100‑1 (MQ=255) gCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGaa < 2:915021/100‑1 (MQ=255) gCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGaa < 1:2472819/100‑1 (MQ=255) gCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGaa > 1:1987706/1‑100 (MQ=255) cTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATG‑CACTGAata < 2:2470484/100‑1 (MQ=255) ttGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAata < 2:432010/100‑1 (MQ=255) ttGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAat < 1:1167270/99‑1 (MQ=255) tGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAatat > 1:181676/1‑100 (MQ=255) ngTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAAATGCAAAAGTCGAAAACAAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCAGTGCTGCCTTATGCCACTGAatat > 2:1791522/2‑100 (MQ=255) ttAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCg < 2:2779234/100‑1 (MQ=255) tAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCgg < 1:280662/100‑1 (MQ=255) tAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCgg < 1:1855189/100‑1 (MQ=255) aaGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGa > 1:1607881/1‑100 (MQ=255) aaGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGa > 1:1608794/1‑100 (MQ=255) aGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGaa < 2:1738555/100‑1 (MQ=255) aGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGaa > 1:2914289/1‑100 (MQ=255) aGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGaa > 2:1073617/1‑100 (MQ=255) cgcCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGaaaa < 2:2764669/100‑1 (MQ=255) ccTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATa > 1:2011572/1‑100 (MQ=255) ccTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATa < 2:2651411/100‑1 (MQ=255) tGGCGTAAAAGCTGCCAACGTCGAAAAACAGACGGGGGTGCGTATCGAATGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGGCAGTGTATATCTGGAAAATagg < 2:556175/100‑2 (MQ=255) ggCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATagag > 2:2033769/1‑100 (MQ=255) ggCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATagag < 2:1685554/100‑1 (MQ=255) cgcAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATACCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTg > 1:2399606/1‑100 (MQ=255) cAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGgc > 2:1693313/1‑100 (MQ=255) aaaaGATTGAAAAGTAGAAAACGAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCGGTGGTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAGAATAGAGTg < 2:127100/97‑1 (MQ=255) aGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGAGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGgcgc > 2:2061651/1‑98 (MQ=255) aGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACAGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATGTCGGGAAAATAGAGTGGCGCTg > 2:650125/1‑100 (MQ=255) tGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGAt > 2:2487291/1‑100 (MQ=255) tGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGAt > 1:1433633/1‑100 (MQ=255) gCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGTGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATa < 1:2847707/100‑1 (MQ=255) gCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATa > 1:657501/1‑100 (MQ=255) gCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATa < 2:2613033/100‑1 (MQ=255) aataGTTGAAAAAAAGACGAGAGTTTGTATTGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGACTTATGACACTGTATTTTTGGTAAATAGAGTGGCGATGGa < 2:552649/93‑1 (MQ=255) aaaaGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATAcc < 1:2016162/100‑1 (MQ=255) aaaaGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATAcc < 2:2157761/100‑1 (MQ=255) aaaGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCa < 2:1361859/100‑1 (MQ=255) cGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATAcc > 2:649254/1‑100 (MQ=255) cGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATAcc > 2:2830227/1‑100 (MQ=255) cGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATAcc > 2:838952/1‑100 (MQ=255) cGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTAGCGCTGGATACCAATAcc > 1:1967979/1‑100 (MQ=255) gAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATAccc > 1:1418162/1‑100 (MQ=255) gAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATAccc > 1:576824/1‑100 (MQ=255) gAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATAccc > 1:2874016/1‑100 (MQ=255) gAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTAGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGCAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATAccc > 2:1823376/1‑100 (MQ=255) aaaCCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTg < 1:431668/100‑1 (MQ=255) aaCCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTgg < 1:1311658/100‑1 (MQ=255) actacccGGGGGTGCGTACCGACAGGAATGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATTTCGGGAAAATAAAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGc > 2:1122441/7‑100 (MQ=255) aCCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGc < 2:1654329/100‑1 (MQ=255) cAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTg < 2:2166397/100‑1 (MQ=255) cAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTg < 2:2621950/100‑1 (MQ=255) aGACGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCGTGGCTGa > 2:632431/1‑100 (MQ=255) aCGGGGGTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATa < 1:2525246/100‑1 (MQ=255) gggggTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATaa < 2:1733026/99‑1 (MQ=255) ggggTGCGTACCAACTGGAGAGGTGATGACGAGCTGCCTTATGAAACTGAATATCGGGAAAATAGACTGAAACTGGATACCAAAAccat > 2:2520668/1‑87 (MQ=255) ggggTGCGTACAGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGACACTGAATATCGGGAAAATAGAGTCGCGCTGGATACCAATAACATGGCTGATAACg > 2:2381957/1‑100 (MQ=255) ggTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTc < 1:1782156/100‑1 (MQ=255) ggTGCGTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTc > 2:2359004/1‑100 (MQ=255) gTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGAttt > 1:1132213/1‑100 (MQ=255) gTACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGAttt < 1:1132931/100‑1 (MQ=255) gTACCGACTGGAGTGGTTATGCCATGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGAttt > 1:1880219/1‑100 (MQ=255) tACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTa < 1:64905/100‑1 (MQ=255) tACCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTa < 2:1924996/100‑1 (MQ=255) aCCGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAAGATCAGGAAAATAGAGTGGCGCTGAATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAg > 2:560061/1‑100 (MQ=255) ccGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGa < 1:2830259/100‑1 (MQ=255) ccGACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGa < 2:165908/100‑1 (MQ=255) gACTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTGAGATa < 2:425829/100‑1 (MQ=255) aCTGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAATGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATaa > 1:908026/1‑100 (MQ=255) tGGAGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAAcg > 1:1672845/1‑100 (MQ=255) | CTGGGGCAGCCGTTAAACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACTGAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACG > NC_000913/4547223‑4547415 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |