| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 88,208 | A→T | 100% | T61S (ACA→TCA) | cra → | transcriptional repressor‑activator for carbon metabolism |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 88,208 | 0 | A | T | 98.8% | 363.9 / ‑4.3 | 118 | T61S (ACA→TCA) | cra | transcriptional repressor‑activator for carbon metabolism |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base T (50/65); total (51/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
CGTGTGAGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATC > NC_000913/88112‑88304 | cGTGTGAGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGctca < 1:1630695/99‑1 (MQ=255) gtgtGAGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACg < 1:2504649/100‑1 (MQ=255) taaGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATAGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTc < 2:2653291/98‑1 (MQ=255) gAGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCt > 1:1037971/1‑100 (MQ=255) aGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTa > 1:1816798/1‑100 (MQ=255) aGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTa > 1:1769732/1‑100 (MQ=255) gCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTAt < 1:2726138/100‑1 (MQ=255) gCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTAGCAGAAGGGCATCGTGCTGGACGCTCACGTTc > 1:898769/1‑97 (MQ=255) cGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTTGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTAtt < 2:2432120/100‑1 (MQ=255) gACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTAGCAACTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTg > 1:2753156/1‑100 (MQ=255) cAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGt > 2:735624/1‑100 (MQ=255) aaaCCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTc > 2:427592/1‑99 (MQ=255) aaaCCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCt < 2:1968547/100‑1 (MQ=255) aCCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTtg < 1:357993/100‑1 (MQ=255) aCCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTtg < 1:1892110/100‑1 (MQ=255) aCCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGCGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGCCGCTCACGTTCTATTGGTCttn < 2:2255651/100‑2 (MQ=255) ccGTTGAAAACGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCATCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTtgt < 2:1998113/100‑1 (MQ=255) ccGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCTCCCGAATGCGGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTtgt < 1:140038/100‑1 (MQ=255) ccGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTtgt < 2:2376934/100‑1 (MQ=255) ccGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTtgt < 1:2951164/100‑1 (MQ=255) cGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGTATAATTACCACTCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTtgtg < 1:129419/100‑1 (MQ=255) cGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTtgtg > 2:2612553/1‑100 (MQ=255) gTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTtgtg < 1:1150056/99‑1 (MQ=255) tGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATc > 1:1761798/1‑100 (MQ=255) aaaaaGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACTCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATccc < 1:1915598/100‑1 (MQ=255) aaaaaGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATccc < 1:663959/100‑1 (MQ=255) aaaaaGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATccc < 1:355624/100‑1 (MQ=255) aaaGTCATGGCTTTGGTGCGTGAGCACAATTACCATCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTTGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATcccc < 1:1076601/99‑1 (MQ=255) aaaGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCg < 1:2687526/100‑1 (MQ=255) aaGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGa < 1:2612585/100‑1 (MQ=255) gTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATc > 1:1744152/1‑100 (MQ=255) tCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCt < 2:1873918/100‑1 (MQ=255) cATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCt > 1:2177743/1‑99 (MQ=255) cATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTg > 2:2875153/1‑100 (MQ=255) cATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTg > 1:2596377/1‑100 (MQ=255) aTGGCTGTGGTGCGTTAGCTCAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGTGCGTCGTGCTGGACGCGCACTTTCTATTTGTCTTGTGATCCCCGATCTgg < 2:2560062/100‑1 (MQ=255) aTGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTgg < 2:1895662/100‑1 (MQ=255) aTGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTgg < 2:2436135/100‑1 (MQ=255) tGGCTGTGGTGCGTGTGCACAATTACTTCCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGga < 1:2745727/100‑1 (MQ=255) tGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTgg > 2:167396/1‑99 (MQ=255) tGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGga < 1:2942953/100‑1 (MQ=255) ggCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGgag < 2:2488496/100‑1 (MQ=255) gttgtgGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGgag < 1:1405130/97‑1 (MQ=255) gCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGgaga < 1:1445628/100‑1 (MQ=255) gCTGTGGAGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATATGgaga > 2:776998/1‑100 (MQ=255) cTGTGGTGGGTGGGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGgag < 2:2488532/98‑1 (MQ=255) cTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGTCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTgg < 2:2126796/96‑1 (MQ=255) tgtgGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGATCGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAac < 1:1265798/100‑1 (MQ=255) gtggtgCGTCAGCACAATTACCACCCCAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACCTTATATTGGTCTTGTGATCACCGATCTGGAGAaca < 2:2422020/100‑1 (MQ=255) gtgCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCa > 2:323862/1‑100 (MQ=255) gtgCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCa > 2:2883299/1‑100 (MQ=255) gtgCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTATGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACAcc < 1:1220740/99‑1 (MQ=255) tgCGTGAGCATAATAAGTACCCGATCGACTTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATTTCTGATCTGGAGAACACCa < 2:2878343/99‑1 (MQ=255) tgCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACTAg < 2:198340/100‑1 (MQ=255) gCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTTTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGc < 2:1614857/100‑1 (MQ=255) gCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGc > 1:2455300/1‑100 (MQ=255) cGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGAACTATTAGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCt > 1:302035/1‑100 (MQ=255) tGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCtat < 1:1544549/100‑1 (MQ=255) aGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATAc < 1:3018569/100‑1 (MQ=255) aGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGAATTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATAc > 1:1646272/1‑100 (MQ=255) gCACAATTACCAGCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTTGTCTTGTGATCCTCGATCTGGAGAACACCAGCtata < 2:1094306/98‑1 (MQ=255) gCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGTAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATAcc > 1:878152/1‑100 (MQ=255) cacaATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATAccc > 2:1412787/1‑100 (MQ=255) cacaATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATAccc > 2:1732622/1‑100 (MQ=255) acaATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCg < 1:2614942/100‑1 (MQ=255) caATTACCACCCGAACGCCGTGGCCGCTGGGCTTCGTTCTGGACGCTCACGTTCTATTAGTCTTTTAATACAAGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGc > 1:936900/1‑100 (MQ=255) aTTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCAt > 2:1354406/1‑100 (MQ=255) ttACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATc < 2:2953018/100‑1 (MQ=255) ttACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATc < 1:1945088/100‑1 (MQ=255) tACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCg < 1:323865/100‑1 (MQ=255) tACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTCCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCACCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCg < 2:1816777/100‑1 (MQ=255) tACCACCCGAACGCAGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATATGGAGAACACCAGCTATACACGctt > 2:2948851/1‑96 (MQ=255) accaccCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGc > 1:2471828/1‑100 (MQ=255) accaccCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCATCGTGCTGGCCGCTCACGTGCTATTGGTCTTGTGATCCCCTATCTGGAGCACACCAGCTATACCCGCATCGc > 2:2407149/1‑100 (MQ=255) ccaccCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCt < 2:556651/100‑1 (MQ=255) ccaccCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCt < 2:533460/100‑1 (MQ=255) ccaccCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCt > 2:1755098/1‑100 (MQ=255) caccCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTa < 1:23150/100‑1 (MQ=255) accCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTa < 2:778692/99‑1 (MQ=255) ccGAACGTCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAAcn < 2:1622204/100‑2 (MQ=255) cGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTa < 2:1291132/100‑1 (MQ=255) aaCGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTAtn < 2:840304/100‑2 (MQ=255) cGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGTTCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCtt > 2:1145188/1‑100 (MQ=255) gTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAAc > 1:1647272/1‑100 (MQ=255) ggCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGc > 2:1735087/1‑100 (MQ=255) gCAGCTGGGCTTCGTGTTTGACGCTCACGTTTTATTTGTTTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGcc < 1:729378/100‑1 (MQ=255) gCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGcc < 2:652252/100‑1 (MQ=255) gCAGCTGGGCTTCGTGCCGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCTGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGcc > 1:2796523/1‑100 (MQ=255) gCTGGGCTTCTTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAgg < 1:260358/100‑1 (MQ=255) tGGGCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGgcg > 2:14434/1‑100 (MQ=255) gCTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCgg > 1:648337/1‑100 (MQ=255) cTTCGTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGCTCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGc < 2:1941293/100‑1 (MQ=255) gTGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACg > 1:972936/1‑100 (MQ=255) tGCTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACgg < 2:1803862/100‑1 (MQ=255) cTGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACgggg < 1:143203/100‑1 (MQ=255) tGGACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGt > 2:46698/1‑100 (MQ=255) ggACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGtt > 2:2681702/1‑100 (MQ=255) gACGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTa < 1:2713344/100‑1 (MQ=255) cGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGTTTTGTGATTTGTAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATc < 1:2582981/100‑1 (MQ=255) cGCTCACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATc > 1:1178505/1‑100 (MQ=255) | CGTGTGAGCGACAAAACCGTTGAAAAAGTCATGGCTGTGGTGCGTGAGCACAATTACCACCCGAACGCCGTGGCAGCTGGGCTTCGTGCTGGACGCACACGTTCTATTGGTCTTGTGATCCCCGATCTGGAGAACACCAGCTATACCCGCATCGCTAACTATCTTGAACGCCAGGCGCGGCAACGGGGTTATC > NC_000913/88112‑88304 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |