BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_000913	720,946	C→T	100%	intergenic (+106/+110)	ybfK → / ← kdpE	uncharacterized protein/response regulator in two‑component regulatory system with KdpD

Read alignment evidence...
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*	NC_000913	720,946	0	C	T	100.0%	431.8 / NA	130	intergenic (+106/+110)	ybfK/kdpE	uncharacterized protein/response regulator in two‑component regulatory system with KdpD
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (54/76); total (54/76)

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AAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGT  >  NC_000913/720849‑721041

aaGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAg                                                                                               <  1:867609/100‑1 (MQ=255)

  ggTGACGATCTTCTATCCAGAAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTa                                                                                             >  2:637246/1‑100 (MQ=255)

  ggTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTa                                                                                             >  1:1326019/1‑100 (MQ=255)

  ggTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTa                                                                                             <  2:1513593/100‑1 (MQ=255)

   gTGAAGATATTCTATCCGGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTaa                                                                                            >  2:2006891/1‑100 (MQ=255)

   gTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAAATAATAAAAAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTaa                                                                                            <  2:1590503/100‑1 (MQ=255)

    tGAAGATATTCTATCCATGAAATATGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAat                                                                                           <  2:1830760/100‑1 (MQ=255)

    agAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAat                                                                                           >  2:2150829/2‑100 (MQ=255)

       aGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAAtata                                                                                        >  2:586856/1‑100 (MQ=255)

       aGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAAtata                                                                                        >  2:581335/1‑100 (MQ=255)

       aGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAAtata                                                                                        >  1:1537996/1‑100 (MQ=255)

       aGATATTCTATCCAGGAAATACGGATGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAAtata                                                                                        >  2:224264/1‑100 (MQ=255)

          tatTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATaaaa                                                                                     >  1:772520/1‑100 (MQ=255)

           atTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAat                                                                                    >  1:949044/1‑100 (MQ=255)

               tATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTg                                                                                <  2:2996861/100‑1 (MQ=255)

                aTCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGa                                                                               >  2:1678992/1‑100 (MQ=255)

                   cAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAAtt                                                                            <  1:1501548/100‑1 (MQ=255)

                   cAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAAtt                                                                            >  2:1427994/1‑100 (MQ=255)

                   cAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAAtt                                                                            >  1:351327/1‑100 (MQ=255)

                    nggAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTTTTTTTTTTTATAAAATATTAAAtt                                                                            >  2:1139689/2‑99 (MQ=255)

                    aGGAAATACGGTTGAACTGTGAATGTGATCAATAAAAAATGATTAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTg                                                                           <  1:942153/100‑1 (MQ=255)

                    aGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATTAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTg                                                                           <  1:301048/100‑1 (MQ=255)

                    aGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTg                                                                           <  1:1096721/100‑1 (MQ=255)

                     ggAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGt                                                                          <  1:969218/100‑1 (MQ=255)

                      gAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGtt                                                                         <  1:1290170/100‑1 (MQ=255)

                        aaTACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTAt                                                                       >  1:392367/1‑100 (MQ=255)

                            ctgTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTAtttt                                                                    <  2:2166979/97‑1 (MQ=255)

                             ggTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTtg                                                                  <  2:2825514/100‑1 (MQ=255)

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                               ttGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTtgtg                                                                <  2:1177858/100‑1 (MQ=255)

                               ttGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTtgt                                                                 >  2:903839/1‑99 (MQ=255)

                                    cTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGtgttg                                                           >  2:2442129/1‑100 (MQ=255)

                                     tgtgAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGtgttgt                                                          <  1:1323066/100‑1 (MQ=255)

                                         aaGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTaa                                                      <  2:1258156/100‑1 (MQ=255)

                                         aaGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTaa                                                      <  1:1385629/100‑1 (MQ=255)

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                                           ggTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGa                                                    <  2:1903428/100‑1 (MQ=255)

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                                            gTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGTTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGAt                                                   <  1:1019421/100‑1 (MQ=255)

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                                             ttaTCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATa                                                  <  1:2979553/98‑1 (MQ=255)

                                             tGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGAt                                                   <  1:2171064/99‑1 (MQ=255)

                                             tGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATa                                                  <  2:1045765/100‑1 (MQ=255)

                                              gATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATaa                                                 >  1:2157221/1‑100 (MQ=255)

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                                                 cAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTAAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTAAAGATaaaaa                                              >  2:261934/1‑100 (MQ=255)

                                                  aaTAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAg                                             >  1:800414/1‑100 (MQ=255)

                                                   aTAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGc                                            >  1:352835/1‑100 (MQ=255)

                                                   aTAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATCATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGAt                                                   >  2:1541208/1‑93 (MQ=255)

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                                                     aaaaaaTGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCg                                          <  1:2328548/100‑1 (MQ=255)

                                                     aaaaaaTGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCg                                          >  2:766660/1‑100 (MQ=255)

                                                     aaaaaaTGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCg                                          <  2:158047/100‑1 (MQ=255)

                                                      aaaaaTGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGt                                         <  1:586620/100‑1 (MQ=255)

                                                            gATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGAGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGtatttat                                   >  1:1627684/1‑100 (MQ=255)

                                                             aTCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGtatttatt                                  <  2:849014/100‑1 (MQ=255)

                                                               cAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATttattat                                <  2:1504505/100‑1 (MQ=255)

                                                               cAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATttattat                                >  2:1690220/1‑100 (MQ=255)

                                                                aaTCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATttattatt                               >  1:2097125/1‑100 (MQ=255)

                                                                   cTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGCGTGTTCTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACg                            >  2:2051386/1‑100 (MQ=255)

                                                                     tAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGc                          >  2:465613/1‑100 (MQ=255)

                                                                       atttatttAATGATGAGTTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCtt                        <  1:2167006/100‑1 (MQ=255)

                                                                         ttatttaATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTAATAATAAATACGGCtttt                      <  2:2319608/100‑2 (MQ=38)

                                                                         ttatttaATGAGAAGCTGTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTATTATTTTTGTGTTTTGTTTAAGATAAAATGCCGTATTTATTATTACGGCTtta                      <  2:301708/100‑1 (MQ=255)

                                                                          tatttaATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTttaa                     <  1:2982409/100‑1 (MQ=255)

                                                                           atttaATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTttaat                    >  1:1810516/1‑100 (MQ=255)

                                                                           atttaATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTttaat                    <  1:2529014/100‑1 (MQ=255)

                                                                            tttaATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTttaatt                   <  1:1558931/100‑1 (MQ=255)

                                                                            tttaATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTttaatt                   <  1:2496208/100‑1 (MQ=255)

                                                                            tttaATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTttaatt                   <  1:264650/100‑1 (MQ=255)

                                                                             ttaATGCTGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGGTGTTTCAGATAGAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTttaatt                   >  2:2047246/1‑99 (MQ=255)

                                                                             ttaATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTttaatta                  <  1:37673/100‑1 (MQ=255)

                                                                             ttaATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTACTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTttaatta                  <  2:2745866/100‑1 (MQ=255)

                                                                              taATGATGGGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTTAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTttaattan                 <  1:1246747/100‑2 (MQ=255)

                                                                               aaTGATGAGCTTTTTATTTAGTAATATAAAATAGTGAAGTGTTATTTTTATGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTAATAATAAATACGGCtttttatcgt                <  2:1290602/100‑8 (MQ=21)

                                                                               aaTGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTtaattaat                <  2:3032608/100‑1 (MQ=255)

                                                                               aaTGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTtaattaat                <  2:444741/100‑1 (MQ=255)

                                                                               aaTGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTtaattaat                <  1:529539/100‑1 (MQ=255)

                                                                                atgatgATCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATtaata               <  1:2828749/100‑1 (MQ=255)

                                                                                atgatgAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATtaata               <  1:2062624/100‑1 (MQ=255)

                                                                                atgatgAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATtaata               <  1:211800/100‑1 (MQ=255)

                                                                                atgatgAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATtaata               <  2:1887207/100‑1 (MQ=255)

                                                                                   atgaGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGACTTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAAATAAAAAGCCGAATTTATTATTACGGCTTTAATTAATaaa             >  2:1817683/1‑99 (MQ=255)

                                                                                    tgaGCTTTTTACTTAGTAATATTAAATTTTGAATTGTTATTTTTTTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAag           <  1:185025/100‑1 (MQ=255)

                                                                                    tgaGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATaaaa            >  2:1557185/1‑99 (MQ=255)

                                                                                    tgaGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAag           <  1:2492355/100‑1 (MQ=255)

                                                                                    tgaGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTCATTATTACGGCTTTAATTAATAAAag           <  1:1839371/100‑1 (MQ=255)

                                                                                     gaGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAagg          <  1:1572633/100‑1 (MQ=255)

                                                                                       gCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggca        <  1:2834440/100‑1 (MQ=255)

                                                                                        cTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTTTTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggca        <  1:2442158/99‑1 (MQ=255)

                                                                                         tttttACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggcagg      >  1:625360/1‑100 (MQ=255)

                                                                                         tttttACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggcag       <  1:511348/99‑1 (MQ=255)

                                                                                          ttttACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggcaggc     >  1:122967/1‑100 (MQ=255)

                                                                                           tttACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCt    <  2:1153645/100‑1 (MQ=255)

                                                                                            ttACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTTTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTg   <  1:284360/100‑1 (MQ=255)

                                                                                             tACTTAGTAATATAAAATATAGAATAGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggcagcatgt  >  2:2409380/1‑95 (MQ=255)

AAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGT  >  NC_000913/720849‑721041

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 12 ≤` `ATCG/ATCG` `< 27 ≤` `ATCG/ATCG` `< 37 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`