| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 931,952 | C→T | 100% | V33V (GTG→GTA) | trxB ← | thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)‑binding |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 931,952 | 0 | C | T | 95.1% | 292.7 / 3.6 | 100 | V33V (GTG→GTA) | trxB | thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/2); new base T (46/49); total (49/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.14e-01 | |||||||||||
AATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCC > NC_000913/931857‑932047 | aataaCGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcag < 2:905456/100‑1 (MQ=255) ataaCGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcagg > 1:1570792/1‑100 (MQ=255) ataaCGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcagg > 2:1963354/1‑100 (MQ=255) aCGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcaggttg > 2:3010269/1‑100 (MQ=255) cGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcaggttgc < 1:2112212/100‑1 (MQ=255) gACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcaggttgca > 2:2556514/1‑99 (MQ=255) ccGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcaggttgcaggt < 2:2317438/100‑1 (MQ=255) ccGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCAcaggttgcaggt > 2:596600/1‑100 (MQ=255) ccGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCAcaggttgcaggt > 1:2245969/1‑100 (MQ=255) ccGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGACTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcaggttgcaggt > 1:1003831/1‑100 (MQ=255) ggTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTTGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcaggttgcaggttg > 1:755680/1‑100 (MQ=255) ggTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcaggttgcaggttg > 2:1309595/1‑100 (MQ=255) ggTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTACATGCCGGTAATCAGTAcaggttgaaggttg > 1:1264087/1‑100 (MQ=255) gTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTgg < 2:551333/100‑1 (MQ=255) gTCAGATCGTTTGGATAGAAACGCCAGTTTTCCACTTCAGTTGTGGTGATCAATTGTCCTCCTTTTTCCATTCCTTTAATCGGTACAGGTTGTAGGTTgg > 2:1763257/1‑100 (MQ=255) tCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTACGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGAAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGgc > 1:3022835/1‑100 (MQ=255) aTCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGgcgcgc > 1:1763344/1‑100 (MQ=255) gTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGcgcc > 1:881618/1‑100 (MQ=255) gTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGcgcc < 2:2298541/100‑1 (MQ=255) gTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGcgcc > 2:1096345/1‑100 (MQ=255) gTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGcgcc > 1:1461653/1‑100 (MQ=255) ggATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGt < 2:1554299/100‑1 (MQ=255) gATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTTGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGtn < 1:164674/100‑2 (MQ=255) gATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTa < 1:2317604/100‑1 (MQ=255) gATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTa < 1:2473681/100‑1 (MQ=255) aTCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCTTTTTTCCATGCCGGTAATCATTACAGGTTTCAGGTTGGCGTGCGGCGCTTAg < 2:1763324/100‑1 (MQ=255) aTCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGTTAATCAGTACAGGTTGCAGTTTGGCGCGCGCCGCGTAg > 1:399575/1‑100 (MQ=255) tCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGa < 1:1247385/100‑1 (MQ=255) ccaggccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGACGCGCGCCGCGTAGAcag > 1:2723235/1‑100 (MQ=255) caggccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGAcagc < 1:2253481/100‑1 (MQ=255) caggccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGAcagc < 1:179270/100‑1 (MQ=255) ggccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGAcagcag > 2:1151036/1‑100 (MQ=255) ggccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGAcagcag > 2:1729065/1‑100 (MQ=255) ggccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGAcagcag > 1:2636912/1‑100 (MQ=255) gccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTTTTTTTTTTTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACagcagc > 2:2389046/1‑100 (MQ=255) gccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACagcagc < 2:2037910/100‑1 (MQ=255) gccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACagcagc < 2:725919/100‑1 (MQ=255) cagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCgg < 1:92950/100‑1 (MQ=255) cagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCgg < 2:1819370/100‑1 (MQ=255) gTTTTCCACTTCCTTGGTGGTGTTTATTTGGCCGCATTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGgtg < 1:1792071/100‑1 (MQ=255) gTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTTCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGgtg < 1:811253/100‑1 (MQ=255) gTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATTCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAAGTTAGAGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGgtg > 1:2507146/1‑100 (MQ=255) gTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGgtg < 1:2211772/100‑1 (MQ=255) gTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGgtg < 1:1377931/100‑1 (MQ=255) gTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGgtg > 2:2908675/1‑100 (MQ=255) gTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGgtg < 2:2628305/100‑1 (MQ=255) gTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGgtg < 2:2697299/100‑1 (MQ=255) tttCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTa > 2:918094/1‑100 (MQ=255) ttCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTTTATTTTTTTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTAt > 2:697258/1‑100 (MQ=255) ttCCACTACCGCGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTAt > 2:1582251/1‑100 (MQ=255) ccACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCTATGTTGTTCATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCTCGTAGACAGCAGCGGTGTa > 2:1478319/1‑97 (MQ=255) ccACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTACTCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATcc > 1:1087747/1‑100 (MQ=255) cACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATccc > 2:1691323/1‑100 (MQ=255) aCTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCccg > 1:3006661/1‑100 (MQ=255) cTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATccc < 2:755676/98‑1 (MQ=255) ttCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCccgcc < 2:900065/100‑1 (MQ=255) tccggtggggtggtCAGTTGGCCGCCGGTTTCCATGCCGGTAATCAGTACATGTTGCAGGTTGGCTCGCGCCTCGTAGACAGCAGCGGTGTACAccgc < 2:2413384/90‑1 (MQ=255) tCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGACGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCccgccg < 1:2111832/100‑1 (MQ=255) ccGTGGTGGTGGTCAGTTGGTCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCgg < 1:2913668/100‑1 (MQ=255) cGTGGTGTTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCggg < 1:1317107/100‑1 (MQ=255) gtggtggtCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGAAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTg < 2:3022802/100‑1 (MQ=255) tggtCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAAc > 2:484283/1‑99 (MQ=255) ggtCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAAccc > 2:1605970/1‑100 (MQ=255) ggtCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGATGCTGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCAGGGCCTGAAccc > 2:864648/1‑100 (MQ=255) tCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAg < 1:1729085/100‑1 (MQ=255) cAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCTGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAgg < 1:640349/100‑1 (MQ=255) cAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAgg < 2:399572/100‑1 (MQ=255) cAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAgg > 2:1918598/1‑100 (MQ=255) cAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAgg < 2:2245946/100‑1 (MQ=255) aGTTGGCCGCCTTTTTCCTTGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGTGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGa < 1:204755/100‑1 (MQ=255) tGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGATGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATaa > 1:1539971/1‑100 (MQ=255) ggCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAg < 1:353341/100‑1 (MQ=255) ggCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAg > 2:2574044/1‑100 (MQ=255) ggCCGCCTTTTTACATACCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTAGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAg > 2:1819223/1‑100 (MQ=255) gccgccTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCACGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGc > 2:1094224/1‑100 (MQ=255) gccgccTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGGTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGAAAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAg > 2:1564113/1‑99 (MQ=255) cgccTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAg < 1:1720263/100‑1 (MQ=255) cgccTTTTTCCATGCCGGTAAACAGTACAGGTTTGAGGTTGGCGCGCGCCGCGTGGAGAGCAGCGGTGTATCCCGACGGGCCTGAACTGAGGATaagaag > 2:600208/1‑100 (MQ=255) ccTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCTGGTTGGCGCGCGCTGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGtt < 1:2307900/100‑1 (MQ=255) cTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGc < 2:147621/95‑1 (MQ=255) cTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGATTGCAGGTTGGCGCGCACCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGAGCCTGAACTCAGGATAAGCAGttt > 2:1628274/1‑100 (MQ=255) ttttCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTAc < 1:2908707/100‑1 (MQ=255) tttCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACt < 1:280549/100‑1 (MQ=255) ttCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACtg < 2:1052346/100‑1 (MQ=255) cctGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGACGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTgtgt > 2:334143/3‑100 (MQ=255) cATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTgtgt > 2:2168276/1‑100 (MQ=255) aTGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCTCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGtt < 1:1811834/100‑1 (MQ=255) tGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGttt < 2:1464082/100‑1 (MQ=255) ccGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTgg < 1:1414054/100‑1 (MQ=255) ccGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTg < 2:2474213/99‑1 (MQ=255) ggTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTc > 2:2556712/1‑100 (MQ=255) ggTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTc < 1:402007/100‑1 (MQ=255) gTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCg > 2:510373/1‑100 (MQ=255) aaTCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGACTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTg > 1:2759952/1‑100 (MQ=255) aTCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGc > 1:2231081/1‑100 (MQ=255) aTCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGc < 2:1073471/100‑1 (MQ=255) aTCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGc < 2:1095491/100‑1 (MQ=255) tCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGTGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGcc < 1:1272670/100‑1 (MQ=255) tCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGcc > 1:877525/1‑100 (MQ=255) tCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGcc < 1:596604/100‑1 (MQ=255) | AATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCC > NC_000913/931857‑932047 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |