| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,111,377 | A→G | 100% | D172G (GAT→GGT) | opgH → | OPG biosynthetic ACP‑dependent transmembrane UDP‑glucose beta‑1,2 glycosyltransferase; nutrient‑dependent cell size regulator, FtsZ assembly antagonist |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,111,377 | 0 | A | G | 98.2% | 384.8 / ‑3.0 | 121 | D172G (GAT→GGT) | opgH | OPG biosynthetic ACP‑dependent transmembrane UDP‑glucose beta‑1,2 glycosyltransferase; nutrient‑dependent cell size regulator, FtsZ assembly antagonist |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (3/0); new base G (57/60); total (61/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.44e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
TCTGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTG > NC_000913/1111282‑1111473 | tCTGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGATCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtg < 1:394470/100‑1 (MQ=255)tCTGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtg < 2:868813/100‑1 (MQ=255)tCTGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtg > 1:2800058/1‑100 (MQ=255) tGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtggt < 1:2656078/100‑1 (MQ=255) gTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGAGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtggtt > 1:613585/1‑100 (MQ=255) tGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtggttgg < 1:2500721/100‑1 (MQ=255) tGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGACGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtggttgg > 2:405458/1‑100 (MQ=255) gATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtggttggt < 1:362330/100‑1 (MQ=255) gATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtggttggt > 1:1306315/1‑100 (MQ=255) gATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtggttggt > 2:2791251/1‑100 (MQ=255) gATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtggttggt < 2:167921/100‑1 (MQ=255) ccTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAg < 1:2581944/100‑1 (MQ=255) tGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGa > 1:902581/1‑100 (MQ=255) gCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTtg < 2:1286383/100‑1 (MQ=255) tCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATGTGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTtgtg < 1:2261693/100‑1 (MQ=255) tCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTtgtg < 2:901880/100‑1 (MQ=255) cgcgCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTgg > 2:2637771/1‑100 (MQ=255) cgcgCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTgg > 2:2955209/1‑100 (MQ=255) cgcgCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTgg > 1:2481192/1‑100 (MQ=255) cgcgCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTgg > 2:636284/1‑100 (MQ=255) gcgcAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTggg > 1:979779/1‑100 (MQ=255) gcgcAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTggg < 1:1149666/100‑1 (MQ=255) gcgcAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTgg < 2:1097491/99‑1 (MQ=255) aaCTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTcc > 1:575083/1‑100 (MQ=255) aaCTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTcc > 2:921344/1‑100 (MQ=255) aCTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCt < 2:1406015/100‑1 (MQ=255) cTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCtt < 2:1085891/100‑1 (MQ=255) cTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCtt < 2:2874478/100‑1 (MQ=255) gtcgtcGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTa > 2:2186071/1‑100 (MQ=255) tcgtcgCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTAt < 2:2172752/100‑1 (MQ=255) gtcgCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGc < 2:3003623/100‑1 (MQ=255) gtcgCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGAGGGTTTCCTTTATGc > 1:3003656/1‑100 (MQ=255) cgACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCt > 1:454676/1‑100 (MQ=255) cgACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCt > 1:222349/1‑100 (MQ=255) gACCTGGTATATGAAGACCATTCTTTCTTATCAGTGTTGGGCGTTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCtt < 1:1716656/100‑1 (MQ=255) aCCTTGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGTTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGTATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTc < 2:1828624/100‑1 (MQ=255) aCCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTc > 1:2174248/1‑100 (MQ=255) aCCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTc > 1:1028670/1‑100 (MQ=255) cTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTg < 1:2709318/100‑1 (MQ=255) tGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGc > 2:1928065/1‑100 (MQ=255) tGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGc > 1:1326288/1‑100 (MQ=255) atatGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTta < 1:1958469/100‑1 (MQ=255) tatGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCCTCTGCCTtat > 2:2463719/1‑100 (MQ=255) tatGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTAGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGAAGCTTCTGCCTtat > 1:2578186/1‑100 (MQ=255) tGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTatat > 1:422185/1‑100 (MQ=255) tGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTatat > 2:1449606/1‑100 (MQ=255) aGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtgct < 2:1193585/100‑1 (MQ=255) gACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtgctg < 1:395443/100‑1 (MQ=255) gACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtgctg < 1:1066256/100‑1 (MQ=255) gACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGCTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtgctg < 1:2887350/100‑1 (MQ=255) aCCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATGCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtgctgc < 1:2130406/100‑1 (MQ=255) aCCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtgctgc < 1:1191822/100‑1 (MQ=255) ccATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGTTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCa < 2:2268972/100‑1 (MQ=255) ccATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtgctgc > 2:7019/1‑99 (MQ=255) naTTCTTCCTTATCAGGGTTGGACGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTACTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCa > 2:645363/2‑99 (MQ=255) cATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCaa > 2:2508911/1‑100 (MQ=255) cATGCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGTTGATTAATACTATAGGTATGGTTGATGAGGATTGGTGGGTTTGCTTTCTACAGCTTGTGCTTTATAtgct > 2:1809284/1‑96 (MQ=255) aTTCTTCTTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtgctgc < 1:536568/97‑1 (MQ=255) aTTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCaaa > 2:2773857/1‑100 (MQ=255) aTTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCaaa > 1:2248001/1‑100 (MQ=255) tcttcCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATTCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAAcc < 1:1817369/100‑1 (MQ=255) tcttcCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAAcc > 2:2714692/1‑100 (MQ=255) tcttcCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAAcc < 1:2752063/100‑1 (MQ=255) cttcCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCg > 2:2788800/1‑100 (MQ=255) ttgcTTATCAGGGTTGGGCGGTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCgg < 2:1576026/97‑1 (MQ=255) ttcCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGTGTTTCCTGTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCgg < 2:616355/100‑1 (MQ=255) ttcCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCgg < 2:1789070/100‑1 (MQ=255) ttcCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCgg < 2:2526385/100‑1 (MQ=255) tcCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGATTCCTTTATGCAAATTCTACCTTATATGCTGCAAACCGGt > 1:1043859/1‑100 (MQ=255) tcCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATGAATTCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGTTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCgg < 2:612349/99‑1 (MQ=255) ccTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTa < 1:2132776/100‑1 (MQ=255) cTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTAt > 2:2658558/1‑100 (MQ=255) ttATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATc > 2:1247646/1‑100 (MQ=255) tATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATcc > 1:9738/1‑100 (MQ=255) tATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATcc > 1:2497037/1‑100 (MQ=255) tCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTAATATGCTGCAAACCGGTATCCTg > 1:981404/1‑100 (MQ=255) aGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGAt < 2:2817559/100‑1 (MQ=255) ggTTGGGCGGTGAGTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCGTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATcc < 2:2641071/100‑1 (MQ=255) ggTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATcc < 2:1037166/100‑1 (MQ=255) ggTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGCATCCTGATcc > 2:2640556/1‑100 (MQ=255) agcgcTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGAGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCttt > 2:538282/2‑100 (MQ=255) gcgcTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGTGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTg < 1:1002250/100‑1 (MQ=255) gcgcTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCttt > 2:1587942/1‑99 (MQ=255) gcgcTGATTAATCCTATGGGGATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTg < 1:1002897/100‑1 (MQ=255) cgcTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGc < 2:2225492/100‑1 (MQ=255) ttAATCCTATGGTTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTAct > 2:3002974/1‑100 (MQ=255) tAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActg > 1:1814540/1‑100 (MQ=255) tAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActg < 2:1043852/100‑1 (MQ=255) tAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTAct > 2:2236386/1‑99 (MQ=255) tCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCATACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttc < 2:1815434/100‑1 (MQ=255) tCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttc < 2:2469448/100‑1 (MQ=255) tCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttc < 2:1323579/100‑1 (MQ=255) tCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttc > 1:1861326/1‑100 (MQ=255) ccTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTACTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAAGCGGTATCATGCTCCTCTTTGCGGTActattc > 2:848537/1‑99 (MQ=255) ccTATGGGTATGGTTGGTCAGGATCTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCTGTATCCTGTTCCTCTTTGCGGTActgttc < 2:1000600/99‑1 (MQ=255) cTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCTGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttc < 2:1274428/98‑1 (MQ=255) tATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttctgt < 1:2463748/100‑1 (MQ=255) naTGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttctgt > 1:2138984/2‑100 (MQ=255) aTGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCATCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCAGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttctgtt > 1:1176082/1‑100 (MQ=255) tGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTg < 1:1817855/100‑1 (MQ=255) | TCTGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTG > NC_000913/1111282‑1111473 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |