| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,401,844 | A→G | 100% | I471T (ATC→ACC) | abgB ← | p‑aminobenzoyl‑glutamate hydrolase, B subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,401,844 | 0 | A | G | 98.6% | 288.6 / ‑5.8 | 90 | I471T (ATC→ACC) | abgB | p‑aminobenzoyl‑glutamate hydrolase, B subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); major base G (42/44); minor base T (2/1); total (45/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.16e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GACGACGGTATGGATGACATACTCATGGGCATTCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGATAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAGCCCTGAATCAAGGAAGAGATTGACTGTGGTTG > NC_000913/1401748‑1401940 | gacgacGGTATGGATGACATACTCATGGGCATTCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAg < 2:1896257/100‑1 (MQ=255) gacgGTATGGATGACATACTCATGGGCATTCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGc < 2:910502/100‑1 (MQ=255) gacgGTATGGATGACATACTCATGGGCATTCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGc < 1:101259/100‑1 (MQ=255) gacgGTATGGATGACATACTCATGGGCATTCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGc < 1:2742772/100‑1 (MQ=255) gacgGTATGGATGACATACTCATGGGCATTCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGc < 1:1673978/100‑1 (MQ=255) cgGTATGGATGACATACTCATGGGCATTCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAg < 1:52774/100‑1 (MQ=255) ggTATGGATGACATACTCATGGGCATTCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGt > 1:16747/1‑100 (MQ=255) gTATGGATGACATACTCATGGGCATTTCTTGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAg < 1:475035/98‑1 (MQ=255) gTATGGATGACATACTCATGGGCATTCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGt < 1:2078178/99‑1 (MQ=255) gTATGGATGACATACTCATGGGCATTCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTg > 1:1474665/1‑100 (MQ=255) tATGGATGACATACTCATGGGCATTCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGa < 2:1474650/100‑1 (MQ=255) tGGATGACATACTCATGGGCATTCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATGTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGATAGGGCAGTGATa > 2:1939353/1‑100 (MQ=255) ggATGACATACTCATGGGCATTCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATAc > 2:1096423/1‑100 (MQ=255) ggATGACATACTCATGGGCATTCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATAc > 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cTCATGGGCATTCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCgtgt > 1:2179732/1‑100 (MQ=255) cTCATGGGCATTCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCgtgt > 2:1931848/1‑100 (MQ=255) tCATGGGTATTCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGTGCAGTGATACGGTTGCGTGTc < 2:479268/100‑1 (MQ=255) cATGGGCATTCGTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGGTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTTACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCgtgtgc > 2:1349367/1‑98 (MQ=255) cATGGGCATTCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTcc > 2:1673943/1‑100 (MQ=255) cATGGGCATTCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTcc > 1:323985/1‑100 (MQ=255) gCATTCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCATGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTAc < 2:48705/100‑1 (MQ=255) aTTCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACtt < 1:1516155/100‑1 (MQ=255) ttCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTg > 1:2317695/1‑100 (MQ=255) ccTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCt > 2:144284/1‑100 (MQ=255) cTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTg < 2:1475146/100‑1 (MQ=255) cTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTg > 1:1044512/1‑100 (MQ=255) tCGGTCTTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTTATGGTGACTGTGTCACGTTTTTCGGTGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTgn < 2:1373974/100‑2 (MQ=255) cGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTTGTTTTAGTGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGAt > 2:1391328/1‑100 (MQ=255) tgtgTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCttg > 1:686001/1‑100 (MQ=255) tgtTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCttgtt > 1:2163189/1‑100 (MQ=255) tgtTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCttgtt > 1:2075669/1‑100 (MQ=255) gtTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCTGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGAGTGTTCGTTACTTGCTGATGCTgttgtt > 2:3032227/1‑99 (MQ=255) ttttCGTTGTTTTTGTTATTTTAAAGGTTTCGGTGTCACTTTTTTCTGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTgg < 1:124270/100‑1 (MQ=255) tttGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGTTTGCGTGTCTGTTACTTGCTGATGCTCttgttgn < 2:616931/100‑2 (MQ=255) ttGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGc < 2:2986348/100‑1 (MQ=255) tGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCa > 2:1663889/1‑100 (MQ=255) gCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCAt < 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tgttgttATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCa < 2:174307/100‑1 (MQ=255) tgttgttATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCa > 2:2460261/1‑100 (MQ=255) ttgttATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAAt > 1:2203750/1‑100 (MQ=255) tgttATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATa > 1:496315/1‑100 (MQ=255) tgttATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATa > 2:2242037/1‑100 (MQ=255) gttATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAg > 1:1512418/1‑100 (MQ=255) gttATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAg > 1:1247974/1‑100 (MQ=255) gttATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGGTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAg > 1:2902247/1‑100 (MQ=255) ttATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAGc > 1:2593611/1‑100 (MQ=255) atgttAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAGccc < 2:2528332/97‑1 (MQ=255) tttAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAGCCCTg < 2:1605869/100‑1 (MQ=255) tttAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAGCCCTg < 1:1119316/100‑1 (MQ=255) ttAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGTCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAGCCCTg < 2:472501/99‑1 (MQ=255) tAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCTGGGTAGTGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAGCCCTGaa < 1:2803001/100‑1 (MQ=255) tAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAGCCCTGaa > 2:1696677/1‑100 (MQ=255) aaaGGTGACGGTGTCACGATTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAGCACTGAAt > 2:1481976/1‑100 (MQ=255) aaGGTGACTGTGTCACGTTTTTCGTGGTCGGGCAGTCATACTGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATTCTCTTGTTGGCATTCTTGAAATAGCCCTGaa < 2:2622711/98‑1 (MQ=255) aaGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGTTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAGCCCTGAATc < 1:829766/100‑1 (MQ=255) aaGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAGCCCTGAATc < 1:1608440/100‑1 (MQ=255) aaGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAGCCCTGAATc < 1:1935206/100‑1 (MQ=255) aGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAGCCCTGAATCa < 1:2314472/100‑1 (MQ=255) ggTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAGCCCTGAATCaa > 2:2599509/1‑100 (MQ=255) ggTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAGCCCTGAATCaa > 2:611924/1‑100 (MQ=255) ggTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAGCCCTGAATCaa > 2:2598777/1‑100 (MQ=255) gTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAGCCCTGAATCAAg < 1:1805296/100‑1 (MQ=255) gTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAGCCATGAATCAAg > 1:2162582/1‑100 (MQ=255) tGACGGTGTTACGTTTTTCGGGGTATGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTAGTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAGCCCTGAATCAAgg < 1:197857/100‑1 (MQ=255) tGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAGCCCTGAATCAAgg < 1:2768291/100‑1 (MQ=255) tGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAGCCCTGAATCAAgg < 1:735376/100‑1 (MQ=255) tGACGGTGTCACGTTTTTCGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAGCCCTGAATCAAgg < 2:1317902/100‑1 (MQ=255) 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2:1990172/1‑100 (MQ=255) cGGGGTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAGCCCTGAATCAAGGAAGAGATTGAATGTGGtt > 1:2149151/1‑100 (MQ=255) ggggTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAGCCCTGAATCAAGGAAGAGATTGACTGTGGTtg > 1:2779711/1‑100 (MQ=255) ggggTAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCCGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGAAATAGCCCTGAATCAAGGAAGAGATTGACTGTGGTtg < 2:2738514/100‑1 (MQ=255) | GACGACGGTATGGATGACATACTCATGGGCATTCCTCGGTTGTTGTGTTTGCGTTGTTGTTGTTATTTTAAAGGTGACGGTGTCACGTTTTTCGGGATAGGGCAGTGATACGGTTGCGTGTCCGTTACTTGCTGATGCTCTTGTTGGCATTCTTGCAATAGCCCTGAATCAAGGAAGAGATTGACTGTGGTTG > NC_000913/1401748‑1401940 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |