| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,407,859 | A→G | 100% | intergenic (‑64/‑191) | ydaM ← / → ydaN | diguanylate cyclase, csgD regulator/putative Zn(II) transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,407,859 | 0 | A | G | 98.3% | 381.4 / ‑3.3 | 115 | intergenic (‑64/‑191) | ydaM/ydaN | diguanylate cyclase, csgD regulator/putative Zn(II) transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base G (62/51); total (63/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.01e-01 | |||||||||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GTAAGTCCAGGGTATTGAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGATCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCATTTTGCTTTTTGTATTCAATTTAGACAGA > NC_000913/1407762‑1407952 | gTAAGTCCAGGGTATTTAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTTTTTTTATTAATTTTTGTTGCTATCCGTTCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTc < 2:1146039/100‑1 (MQ=255) tAAGTCCAGGGTATTGAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCa < 1:2305652/100‑1 (MQ=255) aGTCCAGGGTATTGAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGa > 1:820334/1‑100 (MQ=255) gTCCAGGGTATTGAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGAt > 1:2863425/1‑100 (MQ=255) gTCCAGGGTATTGAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGAt < 1:1726779/100‑1 (MQ=255) tCCAGGGTATTGAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGa > 2:2270853/1‑98 (MQ=255) cAGGGTATTGAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAAt < 1:484428/100‑1 (MQ=255) cAGGGTATTGAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAAt > 2:2354219/1‑100 (MQ=255) cAGGGTATTGAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAAt > 2:1124527/1‑100 (MQ=255) ngggTATTGAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAAt > 2:1407738/2‑99 (MQ=255) gggTATTGAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATAAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTc < 1:996797/100‑1 (MQ=255) ggTATTGAAGTTGTGCGTAATCATTGAGTTCTCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCt < 1:894779/100‑1 (MQ=255) gTATTGAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCt < 2:131157/99‑1 (MQ=255) gTATTGAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTg < 1:2722711/100‑1 (MQ=255) gTATTGAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTg < 1:1246038/100‑1 (MQ=255) gTATTGAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGATCAGATAATTCTg < 2:1403188/100‑1 (MQ=255) aTTGAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGAt < 1:458052/100‑1 (MQ=255) aTTGAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGAt > 1:953108/1‑100 (MQ=255) gAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAAt > 2:2669896/1‑100 (MQ=255) gAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAAt > 2:225438/1‑100 (MQ=255) aGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGa < 2:2853612/100‑1 (MQ=255) tgtgCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAg < 2:629951/100‑1 (MQ=255) tgtgCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAg > 2:1864369/1‑100 (MQ=255) tgCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGAc > 2:2476693/1‑100 (MQ=255) tAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTa > 1:2159917/1‑100 (MQ=255) tAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTa > 1:178671/1‑100 (MQ=255) tAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTa > 2:605995/1‑100 (MQ=255) naaTCATTGAGATCCCGTTATTTTTTTTTTTTTTTTTTGATATCCGATCGCAAAAAATCTATGTTATATGGTCAGATAATTCTTATATTGATTGAc > 2:1310882/2‑96 (MQ=255) tCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTAttt < 2:431535/100‑1 (MQ=255) tCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTAttt < 2:1688142/100‑1 (MQ=255) tCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTAttt > 2:43913/1‑100 (MQ=255) cATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTATGTTGCTATCCGATAGCAAAAAAGCCAAGTCATATAGTCAGATAATTCTGATAAAGATAGACGCTATTTa > 2:2267096/1‑100 (MQ=255) aTTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTaa > 2:1684433/1‑100 (MQ=255) gaTCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACtt > 1:537671/1‑100 (MQ=255) gaTCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACtt > 1:2611741/1‑100 (MQ=255) aTCCTGTTATTTTTATCAATTTTTGTTTCTCTCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCATATAATTCTGATATTTATAGTCGCTATTTAACACTTc < 2:1924931/100‑1 (MQ=255) aTCCCTTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTc < 2:379849/100‑1 (MQ=255) cttccgatcttttATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTca < 2:814321/91‑1 (MQ=255) cccGTTATTTTTATCAATTTTTTTTTCTTTTCTATCGCAAAAAAGCAACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTcac > 2:1674275/1‑100 (MQ=255) ccGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTcaca > 2:2769089/1‑100 (MQ=255) gTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCacac < 1:2841523/99‑1 (MQ=255) gTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACg > 1:2061614/1‑100 (MQ=255) tATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGt > 1:1320909/1‑100 (MQ=255) tATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGt > 1:2156910/1‑100 (MQ=255) aTTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGtt > 1:794797/1‑100 (MQ=255) tttttATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGttt > 1:1613944/1‑100 (MQ=255) ttttATCAATTTTTTTTTTTATTCGTTCGTAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTg < 1:1028537/100‑1 (MQ=255) ttttATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTg > 2:1924364/1‑100 (MQ=255) tttATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCATGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGt < 2:2276903/100‑1 (MQ=255) tttATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTcaagatcggaag > 1:814325/1‑90 (MQ=255) tttATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGt > 1:453907/1‑100 (MQ=255) ttATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGATGCTATTTAACACTTCGCACGGTTTgga < 2:1588004/100‑3 (MQ=255) ttATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGta < 1:1600745/100‑1 (MQ=255) ttATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGta < 1:1272744/100‑1 (MQ=255) tATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTAACACGGTTTGtat > 2:876298/1‑100 (MQ=255) aTCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGtata > 2:1607193/1‑100 (MQ=255) tCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATAc < 1:1060636/100‑1 (MQ=255) cAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATAc > 1:354386/1‑99 (MQ=255) cAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACg > 2:2518259/1‑100 (MQ=255) aaTTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACgg < 2:453904/100‑1 (MQ=255) aaTTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACgg > 1:2662106/1‑100 (MQ=255) aaTTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACgg > 1:971155/1‑100 (MQ=255) aaTTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACgg < 1:2427154/100‑1 (MQ=255) tttGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGaaa < 2:1244129/99‑1 (MQ=255) ttgttgCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAg < 2:1480830/100‑1 (MQ=255) ttgttgCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAg < 2:1988739/100‑1 (MQ=255) gttgCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCa > 2:2008205/1‑100 (MQ=255) ttgCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCAt > 1:921019/1‑100 (MQ=255) tgCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATACTGATAGACGCTATTTACAACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCAt > 2:2787106/1‑99 (MQ=255) tgCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCAtt > 2:3018744/1‑100 (MQ=255) tgCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCAtt > 1:1112622/1‑100 (MQ=255) ctcTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCAtt < 2:2008810/98‑1 (MQ=255) gCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCAttt < 2:1730611/100‑1 (MQ=255) gCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCAttt < 2:1112612/100‑1 (MQ=255) gCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCAttt > 1:1036738/1‑100 (MQ=255) cTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCAtttt > 1:2314740/1‑100 (MQ=255) cTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCAttag > 1:2008833/1‑98 (MQ=255) tATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCATTTTg < 2:2176647/100‑1 (MQ=255) agctgATAGCAAAAAAGCTAAGTCAAATTGTCAGATAATTCTGATAATGATATACGCTCTTTAGCACTTCTCACGGTTTGTATACGGAAAAGCAttta < 2:261923/94‑2 (MQ=255) tCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCATTTTGCt > 1:2143129/1‑100 (MQ=255) tCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCATTTTGCt > 1:845552/1‑100 (MQ=255) ccGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCATTTTGCtt < 1:2496143/100‑1 (MQ=255) ccGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCATTTTGCtt < 1:1877996/100‑1 (MQ=255) ccGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCATTTTGCtn < 1:1877867/100‑2 (MQ=255) cGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCATTTTGCttt > 2:1910772/1‑100 (MQ=255) tCGCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACAGAAAAGCAAAATGCttttc < 2:86602/99‑2 (MQ=255) cGCAAAAAAGCCCCGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATATACGCTATTTAACACTTCACACGTTTTGTATACGGAAAAGCAAAATGCttttccg < 2:1503611/100‑4 (MQ=255) gCAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCATTTTGCTTTTTGTa > 2:209193/1‑100 (MQ=255) cAAAAAAGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCATTTTGCTTTTTGTAt > 2:487544/1‑100 (MQ=255) aaaaaaGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCAAAATGCttttccg < 1:227301/97‑4 (MQ=255) aaGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCATTTTGCTTTTTGTATTCAAt < 2:1720557/100‑1 (MQ=255) aGCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCATTTTGCTTTTTGTATTCAAtt < 2:1968217/100‑1 (MQ=255) gCCACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCATTTTGCTTTTTGTATTCAAttt < 1:2493864/100‑1 (MQ=255) cACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCATTTTGCTTTTTGTATTCAATTTAg < 1:2911254/100‑1 (MQ=255) cACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCATTTTGCTTTTTGTATTCAATTTAg < 1:1779179/100‑1 (MQ=255) cACGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCATTATGCTTTTTGTATTCAATTTAg > 1:2558027/1‑100 (MQ=255) aCGTCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCATTTTGCTTTTTGTATTCAATTTAGa < 1:2076596/100‑1 (MQ=255) tCATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCATTTTGCTTTTTGTATTCAATTTAGACa > 1:611322/1‑99 (MQ=255) cATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTCTACGGACAAGCATTTTGCTTTTTGTATTCAATTTAGACAg > 2:1433684/1‑99 (MQ=255) cATATGGTCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCATTTTGCTTTTTGTATTCAATTTAGACAGa > 2:385582/1‑100 (MQ=255) | GTAAGTCCAGGGTATTGAAGTTGTGCGTAATCATTGAGATCCCGTTATTTTTATCAATTTTTGTTGCTATCCGATCGCAAAAAAGCCACGTCATATGATCAGATAATTCTGATAATGATAGACGCTATTTAACACTTCACACGGTTTGTATACGGAAAAGCATTTTGCTTTTTGTATTCAATTTAGACAGA > NC_000913/1407762‑1407952 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |