| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,712,306 | (T)7→8 | intergenic (+148/‑463) | nth → / → dtpA | DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)/dipeptide and tripeptide permease A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,712,299 | 1 | . | T | 92.8% | 282.5 / 14.3 | 83 | intergenic (+141/‑470) | nth/dtpA | DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)/dipeptide and tripeptide permease A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (5/1); new base T (33/44); total (38/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.87e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.29e-01 | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
TTATCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑TTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCA > NC_000913/1712200‑1712390 | tATCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATACAGGTTAATTG‑t > 2:185684/1‑100 (MQ=255) ccTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑ttt‑t > 2:786847/1‑100 (MQ=255) ccTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑ttt‑t > 2:1608482/1‑100 (MQ=255) ctctTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑ttt‑tt > 2:1296463/1‑100 (MQ=255) ctctTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑ttt‑tt > 1:1719385/1‑100 (MQ=255) ctctTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑ttt‑tt > 1:1905740/1‑100 (MQ=255) ctctTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑ttt‑tt > 1:413296/1‑100 (MQ=255) ctctTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑ttt‑tt > 1:1458997/1‑100 (MQ=255) ctctTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑ttt‑tt > 1:934409/1‑100 (MQ=255) tctTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑ttt‑ttt > 1:1296706/1‑100 (MQ=255) tctTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑ttt‑tt < 2:1794233/99‑1 (MQ=255) ctTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑ttt‑tttt > 1:1871991/1‑100 (MQ=255) ttttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑ttt‑ttttt > 2:632098/1‑99 (MQ=255) tttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑ttt‑ttttta < 2:1288497/100‑3 (MQ=255) tttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTAACAGATAAACAAAAATGCAGGTTAATTG‑ttt‑ttttta < 1:1661316/100‑3 (MQ=255) ttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑ttt‑tttttaa > 2:951652/1‑97 (MQ=255) tAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑ttt‑tttttaat > 1:965270/1‑96 (MQ=255) aaaCATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGTTAATTCGTTTAAAAAAAAAAAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAg < 1:1716534/100‑1 (MQ=255) aaaCATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAg < 1:1865728/100‑1 (MQ=255) aaCATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGc > 2:1928929/1‑100 (MQ=255) aCATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCg < 2:1255170/100‑1 (MQ=255) aTCTTTTTAACGTCAATGATGCCAGTGCTTCACGTTATCATCCGTTAATCAGACTGCGGTTAACGCAAAATGTAAGATAAATA‑tta‑tttt > 1:1228762/1‑90 (MQ=255) cTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAAt > 2:554416/1‑100 (MQ=255) cTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑TTTATTTTAATAGCGAAAt > 2:1912273/1‑100 (MQ=255) ttAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTc < 2:1217467/100‑1 (MQ=255) tAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCt < 2:1197149/100‑1 (MQ=255) aCGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTat < 2:1513375/100‑1 (MQ=255) cGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTatt > 2:1402432/1‑100 (MQ=255) cGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTatt > 2:1392138/1‑100 (MQ=255) cGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTatt > 1:716385/1‑100 (MQ=255) gTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTattc > 1:1666881/1‑100 (MQ=255) cAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTattcat > 2:1838997/1‑100 (MQ=255) atgatgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTattcattc < 1:1504536/100‑1 (MQ=255) atgatgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑TTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCg > 1:131879/1‑100 (MQ=255) tgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGa < 2:245698/100‑1 (MQ=255) tcctttGCTTAGCTTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGt < 2:1536610/93‑1 (MQ=255) gCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGt < 1:1054983/97‑1 (MQ=255) ccATTGCTTAGCGTTATCATCAGTTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGAt < 1:40245/99‑1 (MQ=255) ccATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATc > 2:17800/1‑100 (MQ=255) ccATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATc > 1:470738/1‑100 (MQ=255) ccATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATc < 1:936419/100‑1 (MQ=255) cATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGAt > 2:1043773/1‑98 (MQ=255) cATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCa > 1:711135/1‑100 (MQ=255) aTTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCaa > 2:726636/1‑100 (MQ=255) ttGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGTGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCa < 1:1831484/98‑1 (MQ=255) ttGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAg < 2:726273/100‑1 (MQ=255) ttGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAg < 1:1183670/100‑1 (MQ=255) gCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGAt > 2:624348/1‑100 (MQ=255) gCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGAt > 2:1602057/1‑100 (MQ=255) cTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATc < 2:1049209/100‑1 (MQ=255) ttAGCGTTATCATCAGGTAATCTGTTTGTGGATAACGAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAg < 1:658659/96‑1 (MQ=255) ttAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCa < 2:887336/100‑1 (MQ=255) tAGCGTTATCATCAGTTAATCCGTTAAAAAAAAAAAAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCAc < 1:1436669/100‑1 (MQ=255) tAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCAc > 1:165870/1‑100 (MQ=255) gCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACg > 2:251788/1‑99 (MQ=255) gCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGa > 2:904945/1‑100 (MQ=255) gTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATg < 1:1418049/100‑1 (MQ=255) gTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATg < 2:1490807/100‑1 (MQ=255) ttATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGc < 2:1240541/100‑1 (MQ=255) ttATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGc < 1:900789/100‑1 (MQ=255) tATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCTTGATCACGaatg < 1:472752/99‑4 (MQ=255) atcatcAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCTTGATCACGaatgaa < 2:1456969/100‑6 (MQ=255) catcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTc > 1:1917641/1‑100 (MQ=255) catcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑TTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCg < 1:606999/100‑1 (MQ=255) catcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑TTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCg > 1:1656318/1‑100 (MQ=255) atcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCTTGATCACGaatgaatag < 1:840642/100‑9 (MQ=38) atcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCg > 1:508086/1‑100 (MQ=255) tcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGc < 2:934410/100‑1 (MQ=255) caGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATTAAGATTACGATGATGTc > 1:820015/1‑97 (MQ=255) caGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑TTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCaa > 1:1393404/1‑100 (MQ=255) ggTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTAATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAAt > 1:1339759/1‑100 (MQ=255) gTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATg < 1:958501/100‑1 (MQ=255) aaTCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTCATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAAATCACGATGCTTTCGCATTGt > 1:1079901/1‑99 (MQ=255) aaTCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTa < 1:1296456/100‑1 (MQ=255) aTCCTTTTGCGTATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTaa < 1:1129039/100‑1 (MQ=255) tCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTaaa < 1:1793005/100‑1 (MQ=255) gTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAAc < 2:1459005/100‑1 (MQ=255) gTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAAc < 2:1391615/100‑1 (MQ=255) cGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGc < 2:508088/100‑1 (MQ=255) gATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCaa < 2:1860863/100‑1 (MQ=255) aTAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAg < 1:554414/100‑1 (MQ=255) aTAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAg < 2:926972/100‑1 (MQ=255) aTAACCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGATGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAg < 1:1334822/100‑1 (MQ=255) aaacAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGa < 1:1378262/96‑1 (MQ=255) aCCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAAt > 2:10308/1‑100 (MQ=255) ccAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATc > 2:1404175/1‑100 (MQ=255) ccAAAAATGCAGGTTAATTG‑TTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCa > 1:225631/1‑100 (MQ=255) cAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCa > 2:1593531/1‑100 (MQ=255) cAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCa > 2:13793/1‑100 (MQ=255) cAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCa > 2:1089724/1‑100 (MQ=255) cAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCa > 1:1639344/1‑100 (MQ=255) cAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCa > 2:981243/1‑100 (MQ=255) aaaaaaTGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTTATATCGAAATTTTCTATTCATTCTTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGGAAGAACATTGCAAGAATc > 1:646248/2‑99 (MQ=255) aaaaTGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAgg > 2:271762/1‑100 (MQ=255) aaaTGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGt > 2:1496570/1‑100 (MQ=255) aaaTGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGt < 1:1402424/100‑1 (MQ=255) tGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTaa < 2:1627248/100‑1 (MQ=255) ggTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTaaaa < 2:965271/98‑1 (MQ=255) gTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCa < 2:754738/100‑1 (MQ=255) gTTAATTGTTTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCa < 1:1874718/100‑1 (MQ=255) | TTATCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑TTT‑TTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCA > NC_000913/1712200‑1712390 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |