Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,022,987 | G→T | A84A (GCG→GCT) | tatC → | TatABCE protein translocation system subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,022,987 | 0 | G | T | 84.8% | 238.6 / 37.7 | 92 | A84A (GCG→GCT) | tatC | TatABCE protein translocation system subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (7/7); new base T (36/42); total (43/49) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.13e-01 |
AGTTGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGCTCTCTGCT > NC_000913/4022890‑4023085 | aGTTGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTcc < 2:1586829/100‑1 (MQ=255) gTTGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCg < 1:1148781/100‑1 (MQ=255) ttGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCgg < 2:1067784/100‑1 (MQ=255) tGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGt < 1:686459/100‑1 (MQ=255) tGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGt < 2:1797982/100‑1 (MQ=255) tGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGt < 2:445718/100‑1 (MQ=255) tGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGt < 2:1672543/100‑1 (MQ=255) cGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGAt > 1:100445/1‑100 (MQ=255) cGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGAt < 2:594813/100‑1 (MQ=255) gCAAGGTTCAACGATGATCGCCAGCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTAAGCTCCGGTGAtt < 1:178849/100‑1 (MQ=255) aaGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATtct > 2:1424020/1‑100 (MQ=255) aGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATtctc < 2:300271/100‑1 (MQ=255) ggTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTGTGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTctct > 2:1852397/1‑100 (MQ=255) gTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTa > 1:1462531/1‑100 (MQ=255) gTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTa > 1:706624/1‑100 (MQ=255) gTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTa > 2:275099/1‑100 (MQ=255) gTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTa > 1:1375083/1‑100 (MQ=255) tCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATc > 1:698156/1‑100 (MQ=255) tCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATc > 1:634258/1‑100 (MQ=255) cAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCa < 2:396810/100‑1 (MQ=255) aCGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAgg > 2:10289/1‑100 (MQ=255) tgatCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGtgtg < 1:260907/100‑1 (MQ=255) tccgatctccGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTgg < 1:1702487/92‑1 (MQ=255) gatCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTgg < 2:31808/100‑1 (MQ=255) gatCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTgg > 1:53387/1‑100 (MQ=255) tCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGc < 1:1856182/100‑1 (MQ=255) cGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCa < 2:1793246/100‑1 (MQ=255) cGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCa < 2:1730506/100‑1 (MQ=255) gCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCAt > 1:850869/1‑100 (MQ=255) gCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCAt > 1:850885/1‑100 (MQ=255) ccACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCAtt > 1:1539739/1‑100 (MQ=255) aCCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTa < 2:1080052/100‑1 (MQ=255) aCCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCCTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTa > 1:1752638/1‑100 (MQ=255) ccGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTggagatcgga > 2:1702498/1‑92 (MQ=255) cGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTAt < 1:932960/99‑1 (MQ=255) cGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATc < 1:1191397/100‑1 (MQ=255) gTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGccc < 1:1417641/100‑1 (MQ=255) tGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGcccc < 2:312519/100‑1 (MQ=255) tGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGcccc < 1:1727242/100‑1 (MQ=255) ccTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAgc > 2:649172/1‑100 (MQ=255) cTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAgcg > 1:274207/1‑100 (MQ=255) cGCCGTGCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATTGTGTCGCTGATTCGGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAgcgc < 2:354274/99‑1 (MQ=255) cGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGta > 1:1308432/1‑100 (MQ=255) cTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAg < 2:952233/100‑1 (MQ=255) cTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAg < 2:1347612/100‑1 (MQ=255) tttACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGc > 2:1582331/1‑100 (MQ=255) ttACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCa < 2:169179/100‑1 (MQ=255) ncGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATg > 1:89094/2‑100 (MQ=255) aCGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATg < 2:1901104/100‑1 (MQ=255) cGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGa > 1:792976/1‑100 (MQ=255) cGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGa > 1:1356395/1‑100 (MQ=255) cGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGa < 1:1814598/100‑1 (MQ=255) cGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGa < 1:1738552/100‑1 (MQ=255) gCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGaa > 1:565199/1‑100 (MQ=255) cGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACg > 1:403647/1‑100 (MQ=255) cGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACg < 2:1164009/100‑1 (MQ=255) cGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACg > 1:1004955/1‑100 (MQ=255) cGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACg > 2:1401224/1‑100 (MQ=255) aTCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTc > 2:221941/1‑100 (MQ=255) aTCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTc < 1:963843/100‑1 (MQ=255) cAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGc > 1:1596458/1‑100 (MQ=255) aaGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGGATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGcc < 1:1195387/100‑1 (MQ=255) aGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCt < 2:1422532/100‑1 (MQ=255) aGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCt > 1:1401353/1‑100 (MQ=255) aGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCt < 2:1462539/100‑1 (MQ=255) cTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCtgg > 1:1886873/1‑100 (MQ=255) ngACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATACGCATGAACGTCGCCtggt > 2:734970/2‑100 (MQ=255) gACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCtggtg < 1:1148074/100‑1 (MQ=255) gACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCtggtg > 2:1832413/1‑100 (MQ=255) aCCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCtggtgg < 1:1794321/100‑1 (MQ=255) ccTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTCTCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTggtggt < 2:479/100‑1 (MQ=255) ccTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTggtggt < 2:1191409/100‑1 (MQ=255) ccTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTggtggt > 1:330196/1‑100 (MQ=255) tttATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGc > 1:504959/1‑100 (MQ=255) ttATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGcc < 2:739331/100‑1 (MQ=255) ttATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGcc < 2:672285/100‑1 (MQ=255) ttATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGcc < 1:1557494/100‑1 (MQ=255) ttATGGTGTCGCTGATGCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATGTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGcc < 2:1541026/100‑1 (MQ=255) tGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCgct < 2:1226222/100‑1 (MQ=255) tGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCgct > 2:1284815/1‑100 (MQ=255) ggTGTCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCgctg > 2:365300/1‑100 (MQ=255) ggTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCgctg > 1:675169/1‑100 (MQ=255) gtgtCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCgctgc < 1:1209017/100‑1 (MQ=255) tCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTgg < 1:1521596/100‑1 (MQ=255) tCGCTGATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTgg < 1:1424012/100‑1 (MQ=255) gATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTcc < 2:330198/100‑1 (MQ=255) gATTCTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTcc > 2:350454/1‑100 (MQ=255) cTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGct > 2:1489614/1‑100 (MQ=255) cTGTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGc > 1:1692358/1‑99 (MQ=255) gTCAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGCCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGctc > 2:1936389/1‑99 (MQ=255) tCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGctctc > 1:917655/1‑100 (MQ=255) cAGCTCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGctctct < 1:365298/100‑1 (MQ=255) cgcCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGCTCTctgct > 1:19277/1‑100 (MQ=255) | AGTTGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGCTCTCTGCT > NC_000913/4022890‑4023085 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |