| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 750,896 | Δ1 bp | 100% | coding (1274/2448 nt) | ybgQ ← | putative outer membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 750,893 | 0 | C | . | 97.6% | 372.5 / 0.7 | 84 | coding (1277/2448 nt) | ybgQ | putative outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base . (43/39); total (44/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AGCTGTGAAAATGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGCCCGATACCCAT > NC_000913/750795‑750987 | aGCTGTGAAAATGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGcc < 1:1326973/100‑1 (MQ=255) gCTGTGAAAATGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGccc > 1:2358381/1‑100 (MQ=255) gCTGTGAAAATGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGccc > 2:1159539/1‑100 (MQ=255) tgtgAAAATGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGcccgc < 1:2231576/100‑3 (MQ=255) tgtgAAAATGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGcccgc > 1:1906137/1‑98 (MQ=255) tgtgAAAATGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGcccgc < 2:2390462/100‑3 (MQ=255) gtgAAAATGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGcccgct > 2:1843583/1‑97 (MQ=255) gtgAAAATGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGcccgct > 2:2471810/1‑97 (MQ=255) tgAAAATGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGcccgctc > 1:448405/1‑96 (MQ=255) tgAAAATGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGcccgctc < 1:955030/100‑5 (MQ=255) gAAAATGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCg < 1:176990/100‑1 (MQ=255) aaaaTGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGcccgctc > 2:662488/1‑94 (MQ=255) aaaaCGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGt < 2:369020/100‑1 (MQ=255) aaTGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTcc < 2:1898594/100‑1 (MQ=255) aTGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTcc < 2:2237739/99‑1 (MQ=255) gACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCctgc < 2:197694/100‑1 (MQ=255) gACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCctgc < 1:782711/100‑1 (MQ=255) atctaTCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCctgc < 1:847826/96‑1 (MQ=255) aCGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCctgct < 1:1155729/100‑1 (MQ=255) cGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTGTGCTGTACCTAACACGGGAGCTTAA‑CCCCGCTCGTc > 2:2427180/1‑94 (MQ=255) gATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGa > 1:1218281/1‑100 (MQ=255) gATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGa > 2:134143/1‑100 (MQ=255) aTCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCctgcagat > 2:847819/1‑96 (MQ=255) aTCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAg > 2:1275504/1‑100 (MQ=255) aTCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAg > 2:987649/1‑100 (MQ=255) aTCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAg > 1:1550472/1‑100 (MQ=255) tCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGt > 1:2207850/1‑100 (MQ=255) tCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGt > 2:1099248/1‑100 (MQ=255) cTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTa > 2:443945/1‑100 (MQ=255) tGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTAt > 2:996764/1‑100 (MQ=255) gagaAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATc > 1:176455/1‑100 (MQ=255) gaAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCaa < 1:434488/100‑1 (MQ=255) gaAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCaa < 1:1661730/100‑1 (MQ=255) gaAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCaa > 1:677441/1‑100 (MQ=255) gCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAAt > 1:925095/1‑100 (MQ=255) cGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATg > 2:823765/1‑100 (MQ=255) cGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATg > 1:1474570/1‑100 (MQ=255) gATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATgg < 1:749570/100‑1 (MQ=255) aTAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGc < 1:1050215/100‑1 (MQ=255) aTAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGc < 1:470653/100‑1 (MQ=255) aTAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGc < 1:1868153/100‑1 (MQ=255) tAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCt > 2:1105404/1‑100 (MQ=255) tAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAAAGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCt > 2:1797170/1‑100 (MQ=255) aaGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTa < 1:277770/100‑1 (MQ=255) aGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTAc > 2:2410895/1‑100 (MQ=255) gcggcgAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACt > 2:774582/1‑100 (MQ=255) gcggcgAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACt > 1:434138/1‑100 (MQ=255) cggcgAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTg > 1:331033/1‑100 (MQ=255) gcgaAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCa > 2:2031582/1‑99 (MQ=255) gcgaAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAg > 2:1191182/1‑100 (MQ=255) gaAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGt > 1:2365665/1‑100 (MQ=255) gaAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGt > 1:1406886/1‑100 (MQ=255) aaaTCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGt < 2:751374/99‑1 (MQ=255) tCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACa < 2:1640548/100‑1 (MQ=255) tCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACa < 2:1530207/100‑1 (MQ=255) gTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATc < 1:507830/100‑1 (MQ=255) gTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATc < 2:469062/100‑1 (MQ=255) tGCTGTTGTTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACa < 2:952822/98‑1 (MQ=255) gCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCaa < 1:1199724/100‑1 (MQ=255) cTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCaaa > 1:2072638/1‑100 (MQ=255) tGTTGGTGGGATCCACTTTTTTGCTGTAATTAAAACGGAAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCATGCTGAGTATCAAAATGGCTACTTGCCCAGGTGACATCAAAg < 2:634018/100‑1 (MQ=255) tggtggCATTTACTTGTTTGCTCTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCCTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGAc < 2:922109/100‑1 (MQ=255) tggtggCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGAc < 2:419072/100‑1 (MQ=255) tggtggCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTAGCAGAATGGCGACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGAc < 1:2427194/100‑1 (MQ=255) ggtggCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACa > 1:25582/1‑100 (MQ=255) ggtggCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACa > 2:1944982/1‑100 (MQ=255) ggCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGt > 2:2053934/1‑99 (MQ=255) tCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGcc < 1:2471824/100‑1 (MQ=255) ccACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCa > 1:666939/1‑100 (MQ=255) cACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCaa > 2:2367088/1‑100 (MQ=255) cACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCaa > 2:1292993/1‑100 (MQ=255) ttGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGcc < 1:1835845/100‑1 (MQ=255) ttGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGcc < 1:1835812/100‑1 (MQ=255) tGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCca > 1:1408764/1‑100 (MQ=255) tttGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCcaca < 1:1159547/100‑1 (MQ=255) ttGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAg < 2:1576764/100‑1 (MQ=255) ttGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAg > 1:1450895/1‑100 (MQ=255) tGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGc < 2:752650/100‑1 (MQ=255) cTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCat < 1:42033/100‑1 (MQ=255) tGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCata > 2:2363483/1‑100 (MQ=255) gTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCatat > 1:772015/1‑100 (MQ=255) tAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATAtt < 2:1589356/100‑1 (MQ=255) tAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATAtt > 1:573440/1‑100 (MQ=255) aaTTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATAttt < 1:630869/100‑1 (MQ=255) aTTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAACGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATAtttt < 2:2365650/100‑1 (MQ=255) aTTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATAtttt > 2:764008/1‑100 (MQ=255) aTTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATAtttt > 1:871910/1‑100 (MQ=255) aTTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATAtttt > 1:161314/1‑100 (MQ=255) tAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGc < 1:1843597/100‑1 (MQ=255) aaaaCGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGcc < 2:682268/100‑1 (MQ=255) aaCGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGCCCg < 2:2258271/100‑1 (MQ=255) gTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGCCCGATAc < 1:1511266/100‑1 (MQ=255) gCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGCCCGATACCCa > 2:914069/1‑100 (MQ=255) gCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGCCCGATACCCa > 1:2457121/1‑100 (MQ=255) cTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGCCCGATACCCAt > 2:877125/1‑100 (MQ=255) | AGCTGTGAAAATGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGCCCGATACCCAT > NC_000913/750795‑750987 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |