| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 315991 = | NA (NA) | 16 (0.180) | 8/170 | NT | NA | noncoding (763/1255 nt) | IS3 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 316014 = | NA (NA) | noncoding (786/1255 nt) | IS3 | repeat region | |||||
CGTCATGCGTGGCGACATTGACCAGCCAATAACGGCACGTGACCACAGGTCAATGACCACTGCCAGATACAGCCAGCCTTCATCTGTACGTAAGTACGTGATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/316093‑315991‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gatgAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCGATG > NC_000913/316014‑316112 CGTCATGCGTGGCGACATTGACCAGCCAATAACGGCACGTGACCACAGGTCAATGACCACTGCCAGATACAGCCAGCCTTCATCTGTACGTAAGTACGTG > 1:390589/1‑100CGTCATGCGTGGCGACATTGACCAGCCAATAACGGCACGTGACCACAGGTCAATGACCACTGCCAGATACAGCCAGCCTTCATCTGTACGTAAGTACGTG < 1:113281/100‑1CGTCATGCGTGGCGACATTGACCAGCCAATAACGGCACGTGACCACAGGTCAATGACCACTGCCAGATACAGCCAGCCTTCATCTGTACGTAAGTACGTG < 2:2231879/100‑1CGTCATGCGTGGCGACATTGACCAGCCAATAACGGCACGTGACCACAGGTCAATGACCACTGCCAGATACAGCCAGCCTTCATCTGTACGTAAGTACGTG > 2:2140775/1‑100 GTCATGCGTGGCGACATTGACCAGCCAATAACGGCACGTGACCACAGGTCAATGACCACTGCCAGATACAGCCAGCCTTCATCTGTACGTAAGTACGTGA < 1:95682/100‑1 GTCATGCGTGGCGACATTGACCAGCCAATAACGGCACGTGACCACAGGTCAATGACCACTGCCAGATACAGCCAGCCTTCATCTGTACGTAAGTACGTGA < 1:2104470/100‑1 GTCATGCGTGGCGACATTGACCAGCCAATAACGGCACGTGACCACAGGTCAATGACCACTGCCAGATACAGCCAGCCTTCATCTGTACGTAAGTACGTG < 2:121934/99‑1 TCATGCGTGGCGACATTGACCAGCCAATAACGGCACGTGACCACAGGTCAATGACCACTGCCAGATACAGCCAGCCTTCATCTGTACGTAAGTACGTGAT < 1:1155738/100‑1 TCATGCGTGGCGACATTGACCAGCCAATAACGGCACGTGACCACAGGTCAATGACCACTGCCAGATACAGCCAGCCTTCATCTGTACGTAAGTACGTGAT < 1:1672153/100‑1 CATGCGTGGCGACATTGACCAGCAAATAACGGCACGTGACCACAGGTCAATGACCACTGCCAGATACAGCCAGCCTTCATCTGTACGTAAGTACGTGATG < 2:160561/100‑1 GTGGCGACATTGACCAGCCAATAACGGCACGTGACCACAGGTCAATGACCACTGCCAGATACAGCCAGCCTTCATCTGTACTTACGTAC‑AGATGAAGGCT < 1:341656/100‑1 CCAGCCTTCATCTGTACGTAAGTACGTGATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGC > 1:853483/1‑100 CAGCCTTCATCTGTACGTAAGTACGTGATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCC > 1:2079466/1‑100 AGCCTTCATCTGTACGTAAGTACGTGATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCA > 2:381937/1‑100 AGCCTTCATCTGTACGTAAGTACGTGATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCA > 2:471211/1‑100 GCCTTCATCTGTACGTAAGTACGTGATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCAC > 1:47583/1‑100 CCTTCATCTGTACGTAAGTACGTGATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACG > 2:1705221/1‑100 CCTTCATCTGTACGTAAGTACGTGATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACG > 1:1628152/1‑100 CCTTCATCTGTACGTAAGTACGTGATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACG > 2:103007/1‑100 CCTTCATCTGTACGTAAGTACGTGATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACG > 1:412964/1‑100 CTTCATCTGTACGTAAGTACGTGATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGC > 1:806003/1‑100 ATCTGTACGTAAGTAC‑AGATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTTAATGTCGCCACCCATG > 2:66290/1‑98 ATCTGTACGTAAGTAC‑AGATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGAC > 1:2010369/1‑100 TCTGTACGTAAGTAC‑AGATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACG > 1:676841/1‑100 TCTGTACGTAAGTAC‑AGATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACG > 1:1828577/1‑100 TCTGTACGTAAGTAC‑AGATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACG > 1:1831668/1‑100 GATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCG > 2:936848/1‑100 GATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCG > 2:507739/1‑100 GATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCG > 1:1555263/1‑100 GATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCG < 1:1613000/100‑1 GATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCG > 1:1694349/1‑100 GATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCG > 2:189218/1‑100 GATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCG > 2:1875843/1‑100 GATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCG > 2:1335108/1‑100 GATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCG > 2:1257195/1‑100 GATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCG > 1:251387/1‑100 GATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCG > 1:2303263/1‑100 GATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGC > 2:826295/1‑99 GATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACCGCGCAACTGGCCTGCG > 1:659372/1‑100 GATGAAGGCTGGCTGTATCTGGAAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCAACGGATGACGGCGCAACTGGCCTGtg > 2:223544/1‑98 ATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCGA > 1:2371395/1‑100 ATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCGA < 1:1630102/100‑1 ATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCGA < 1:2331624/100‑1 ATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCGA < 2:1847455/100‑1 ATGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCGA > 1:2057846/1‑100 TGAAGGCTGGGTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCTCCACGAATGACGGCGGGACGGGGCTGCGAT < 2:1572287/100‑1 TGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCGAT < 2:2293999/100‑1 TGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCGAT > 1:1319335/1‑100 TGAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCGAT > 1:399516/1‑100 GAAGGCTGGTTTTATCGGGCAGTGGTCAATGACCTGTGGCCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCGATG < 2:280395/100‑1 GAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCGATG > 2:1933609/1‑100 GAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCGATG < 2:1283210/100‑1 GAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCGATG < 1:2026480/100‑1 GAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCGATG < 1:675792/100‑1 GAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAACGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCGATG > 2:1507750/1‑100 CGTCATGCGTGGCGACATTGACCAGCCAATAACGGCACGTGACCACAGGTCAATGACCACTGCCAGATACAGCCAGCCTTCATCTGTACGTAAGTACGTGATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/316093‑315991‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gatgAAGGCTGGCTGTATCTGGCAGTGGTCATTGACCTGTGGTCACGTGCCGTTATTGGCTGGTCAATGTCGCCACGCATGACGGCGCAACTGGCCTGCGATG > NC_000913/316014‑316112 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |