| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 178,902 | C→T | 100% | L84L (TTG→TTA) | mtn ← | 5'‑methylthioadenosine/S‑adenosylhomocysteine nucleosidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 178,902 | 0 | C | T | 98.7% | 254.9 / ‑4.6 | 79 | L84L (TTG→TTA) | mtn | 5'‑methylthioadenosine/S‑adenosylhomocysteine nucleosidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (38/39); total (39/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.67e-01 | |||||||||||
CCGGACAGCCTGGTAACTGACCGTATTCATAACCAAATGCCGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTCAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACAGCAAAGTGGCACCCAGCGCCGCAGCGAC > NC_000913/178805‑178997 | ccGGACAGCCTGGTAACTGACCGTATTCATAACCAAATGCCGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTaa > 2:1615874/1‑100 (MQ=255) cGGACAGCCTGGTAACTGACCGTATTCATAACCAAATGCCGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAAc < 1:1028394/100‑1 (MQ=255) ggACAGCCTGGTAACTGACCGTATTCATAACCAAATGCCGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACg > 2:183902/1‑100 (MQ=255) cAGCCTGGTAACTGACCGTATTCATAACCAAATGCCGTGACATCCGCTTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGt > 2:696486/1‑98 (MQ=255) ccTGGTAACTGACCGTATTCATAACCAAATGCCGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTg < 1:382675/100‑1 (MQ=255) ccTGGTAACTGACCGTATTCATAACCAAATGCCGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTg > 2:2049999/1‑100 (MQ=255) ccTGGTAACTGACCGTATTCATAACCAAATGCCGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTg < 2:1002495/100‑1 (MQ=255) cTGGTAACTGACCGTATTCATAACCAAATGCCGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGc > 2:2242934/1‑100 (MQ=255) ggTAACTGACCGTATTCATAACCAAATGCCGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCa > 2:2089112/1‑100 (MQ=255) gTAACTGACCGTATTCATAACCAAATGCCGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAg < 1:1151098/100‑1 (MQ=255) tAACTGACCGTATTCATAACCAAATGCCGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGTCAgg < 1:183904/100‑1 (MQ=255) tAACTGACCGTATTCATAACCAAATGCCGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAgg < 1:1677538/100‑1 (MQ=255) aCTGACCGTATTCATAACCAAATGCCGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTCTAACGTTGGTGCCAGGcc > 2:2053576/1‑100 (MQ=255) ccGTATTCATAACCAAATGCCGTGACATCCGCGTCGTAATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGcccccggcagga > 2:1369665/1‑90 (MQ=255) cGTATTCATAACCAAATGCCGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGc < 1:1346259/100‑1 (MQ=255) gTATTCATAACCAAATGCCGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCa < 1:352455/100‑1 (MQ=255) tATTCATAACCAAATGCCGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAg < 1:2227731/100‑1 (MQ=255) ttCATAACCAAATGCCGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGaa < 2:151428/100‑1 (MQ=255) tCATAACCAAATGCCGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAAc < 1:448013/100‑1 (MQ=255) aTAACCAAATGCCGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAAcc > 2:1827527/1‑99 (MQ=255) aTAACCAAATGCCGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCg < 1:2180581/100‑1 (MQ=255) aaCCAAATGCCGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGgt < 1:534591/100‑1 (MQ=255) aCCAAATGCCGTGACATCCGCGTCGTGATCACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTACCGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGgtg > 2:1940983/1‑100 (MQ=255) cAAATGCCGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGtt < 1:2409797/100‑1 (MQ=255) aaaTGCCGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTta > 1:1357015/1‑100 (MQ=255) aaaTGCCGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTta > 1:1356386/1‑100 (MQ=255) gCCGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTtaata < 2:1169837/99‑1 (MQ=255) ccGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTaataat < 1:2303778/100‑1 (MQ=255) ccGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTaataat > 2:901801/1‑100 (MQ=255) cGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATc < 1:961185/100‑1 (MQ=255) cGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATc > 1:432878/1‑100 (MQ=255) gttaCATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATca < 2:2104982/97‑1 (MQ=255) gTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATca < 1:738178/100‑1 (MQ=255) gTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATca < 1:1132879/100‑1 (MQ=255) gTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATca > 1:1046629/1‑100 (MQ=255) tGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTCCGTGCCAGGCCACCTGCAGAACCGGTGTTACTAATcac > 2:972516/1‑100 (MQ=255) gACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATcaca < 1:219901/100‑1 (MQ=255) cATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGGCCGAGACAACGATCTCTCCCACTTTTCACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCTGACCCGGTGTTAATAATcac > 2:888351/1‑97 (MQ=255) ccGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTgg > 1:2039697/1‑100 (MQ=255) ccGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTgg < 1:921383/100‑1 (MQ=255) ccGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTgg > 2:827292/1‑100 (MQ=255) tcgtGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGc < 2:2039683/100‑1 (MQ=255) gtGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAg > 1:1113941/1‑100 (MQ=255) gtGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAg < 2:742744/100‑1 (MQ=255) aTAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAgtgt > 1:1652849/1‑100 (MQ=255) aaCGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTCAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTc < 2:124974/100‑1 (MQ=255) aCGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTcc > 1:975240/1‑100 (MQ=255) cGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCa < 1:719886/100‑1 (MQ=255) gTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCaa < 1:1197589/100‑1 (MQ=255) gTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCa < 2:1545155/99‑1 (MQ=255) tGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTACCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAAc < 1:836863/100‑1 (MQ=255) tcTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGACCAACGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGCTCCAACa > 2:1716560/2‑100 (MQ=255) ccgatctCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACa < 2:539760/94‑1 (MQ=255) cTTTGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATGACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACAg < 1:1558046/100‑1 (MQ=255) cTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACAg > 2:1974164/1‑100 (MQ=255) ttCGTCCGAGACAACGATATCGCCCAGTTTGAACGTTGGTGCCAGGCCAGCGGCAGAACCGGTGTTGATAATCGCATCTGGGTTGCAGAGTTCAAACAg > 2:1291642/1‑99 (MQ=255) ttCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACAGc > 1:1566835/1‑100 (MQ=255) ccGAGACAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACaagatcgg > 1:539767/1‑93 (MQ=255) gagaCAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACAGCAAAGTgg < 2:563866/100‑1 (MQ=255) gagaCAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACAGCAAAGTgg < 1:1789956/100‑1 (MQ=255) gagaCAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACAGCAAAGTgg < 2:1199080/100‑1 (MQ=255) gaCAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCTTCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACAGCAAAGTGGCa > 2:1769596/1‑100 (MQ=255) cAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGTCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACAGCAAAGTg > 2:1069694/1‑95 (MQ=255) cAACGATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACAGCAAAGTGGCAcc > 1:854770/1‑100 (MQ=255) aCGATAGCGCCCACTTTTAACGTGGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGCTGTTAATAATTGCCTCTGGCTTTCAGTGTTCTCACAGCaagctcg > 2:2161096/1‑89 (MQ=255) gATATCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACAGCAAAGTGGCACCCAgc < 1:2164198/100‑1 (MQ=255) atCGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACAGCAAAGTGGCACCCAGcgcc > 1:1297321/1‑100 (MQ=255) cGCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAACCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACAGCAAAGTGGCACCCAGcgccgc > 2:1130267/1‑100 (MQ=255) tcccACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACAGCAAAGTGGCACCCAGCGCCGCa > 2:893082/2‑100 (MQ=255) gCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACAGCAAAGTGGCACCCAGcgccgta < 1:1735717/100‑3 (MQ=255) gCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACAGCAAAGTGGCACCCAGCGCCGCa > 2:892889/1‑100 (MQ=255) gCCCACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACAGCAAAGTGGCACCCAGCGCCGCa > 1:2504759/1‑100 (MQ=255) cccACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGTTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACAGCAAAGTGGCACCCAGCGCCGCAg > 2:2341470/1‑100 (MQ=255) cccACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACAGCAAAGTGGCACCCAGCGCCGCAg < 1:1841116/100‑1 (MQ=255) cccACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACAGCAAAGTGGCACCCAGCGCCGCAg < 1:334239/100‑1 (MQ=255) cccACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACAGCAAAGTGGCACCCAGCGCCGCAg > 1:2101654/1‑100 (MQ=255) ccACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACAGCAAAGTGGCACCCAGCGCCGCAGc < 2:752405/100‑1 (MQ=255) ccACTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACAGCAAAGTGGCACCCAGCGCCGCAGc < 1:1977343/100‑1 (MQ=255) cTTTTAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACAGCAAAGTGGCACCCAGCGCCGCAGCGAc > 2:1970772/1‑100 (MQ=255) ttttAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACAGCAAAGTGGCACCCAGCGCCGCAGCGAc < 1:1096889/99‑1 (MQ=255) | CCGGACAGCCTGGTAACTGACCGTATTCATAACCAAATGCCGTGACATCCGCGTCGTGATAACGTGCTTCGTCCGAGACAACGATATCGCCCACTTTCAACGTTGGTGCCAGGCCACCGGCAGAACCGGTGTTAATAATCACATCTGGCTTGCAGTGTTCCAACAGCAAAGTGGCACCCAGCGCCGCAGCGAC > NC_000913/178805‑178997 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |