| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,089,854 | A→T | 17.4% | intergenic (‑141/‑142) | yefM ← / → hisL | antitoxin of the YoeB‑YefM toxin‑antitoxin system/his operon leader peptide |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,089,854 | 0 | A | T | 17.4% | 258.1 / 42.3 | 108 | intergenic (‑141/‑142) | yefM/hisL | antitoxin of the YoeB‑YefM toxin‑antitoxin system/his operon leader peptide |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (46/43); new base T (8/11); total (54/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.14e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.06e-01 | |||||||||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
GTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGAAAGTGGTTTA > NC_000913/2089756‑2089953 | gTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAg < 2:2487063/100‑1 (MQ=255) taaCTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCctct < 2:982927/100‑1 (MQ=255) taaCTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCctct > 1:811248/1‑100 (MQ=255) aaCTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCtt > 1:114371/1‑100 (MQ=255) aCTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTa > 2:1081912/1‑100 (MQ=255) cTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTGAGTGAGACGAAAATCTAGACTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCATCTTa > 2:1821585/1‑99 (MQ=255) tatttattAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGGGCCGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGc > 1:1208507/1‑100 (MQ=255) tatttattAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGCCACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACTGTCCTCTTAGc < 2:2487314/100‑1 (MQ=255) tatttattAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACTGTCCTCTTAGc < 1:688938/100‑1 (MQ=255) tatttattAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACTGTCCTCTTAGc < 1:1519575/100‑1 (MQ=255) tatttattAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACTGTCCTCTTAGc < 1:1521178/100‑1 (MQ=255) tatttattAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGc > 1:39801/1‑100 (MQ=255) atttattAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACTGTCCTCTTAGct < 1:1636508/100‑2 (MQ=255) atttattAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGcc < 1:1998/100‑1 (MQ=255) atttattAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGcc < 1:1960896/100‑1 (MQ=255) tttattAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACTGTCCTCTTAGctg < 1:315618/100‑3 (MQ=255) tttattAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACTGTCCTCTTAGctg < 1:905626/100‑3 (MQ=255) tttattAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACTGTCCTCTCAGctg < 1:1299985/100‑3 (MQ=255) ttattaATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGcccc < 1:1282631/100‑1 (MQ=255) tattaATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACTGTCCTCTTAGctgat < 1:1297010/100‑5 (MQ=255) tattaATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACTGTCCTCTTAGctgat < 1:1117130/100‑5 (MQ=255) tattaATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGccccc > 2:1543825/1‑100 (MQ=255) tattaATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGccccc < 1:641921/100‑1 (MQ=255) atctaattaGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACTGTCCTCTTAGctgat < 1:1055969/97‑5 (MQ=39) attaattaGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCcct > 2:1110155/1‑100 (MQ=255) attaattaGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCcct > 1:1949531/1‑100 (MQ=255) ttaattaGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCcctc < 1:1634859/100‑1 (MQ=255) taattaGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCcctcc > 1:1993645/1‑100 (MQ=255) aattaGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACTGTCCTCTTAGctgatagat > 2:1055961/1‑92 (MQ=39) attaGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCtt > 1:595006/1‑100 (MQ=255) attaGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCtt > 2:475497/1‑100 (MQ=255) attaGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCtt > 1:1823351/1‑100 (MQ=255) aGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTcc > 1:1219433/1‑100 (MQ=255) aGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTcc < 2:1823337/100‑1 (MQ=255) aGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTcc > 1:786730/1‑100 (MQ=255) gTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCt < 1:2098945/100‑1 (MQ=255) gTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCt < 1:2552809/100‑1 (MQ=255) gTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCt < 1:1677496/100‑1 (MQ=255) aGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTTTTGTTTTTTTCAACGAGGACAGTCCTATTAGCTCCCTCCTTTc > 2:1692439/1‑92 (MQ=255) aGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCtca < 1:1375443/100‑1 (MQ=255) gATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCtcat > 1:1090877/1‑100 (MQ=255) gATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCtcat > 1:1306372/1‑100 (MQ=255) gATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCtcat > 2:1973600/1‑100 (MQ=255) gATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCtcat > 1:1806215/1‑100 (MQ=255) tCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCtcattc > 1:1575663/1‑100 (MQ=255) ggTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTa < 1:20946/100‑1 (MQ=255) aTTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAAc < 1:443178/100‑1 (MQ=255) aTTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAAc > 2:977650/1‑100 (MQ=255) gTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCa > 2:2040049/1‑100 (MQ=255) gaCGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGc > 2:815254/1‑100 (MQ=255) gaCGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGc > 1:1421644/1‑100 (MQ=255) gaCGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGc < 2:1993631/100‑1 (MQ=255) gaCGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCGCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGc < 2:1353928/100‑1 (MQ=255) gaCGAAAAGCCAGGCTTCGCTATTTTTGCTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTCAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGc < 2:1557046/100‑1 (MQ=255) gAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCAt < 1:1543836/100‑1 (MQ=255) aTCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCACGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATaaaa > 2:1352259/1‑100 (MQ=255) tCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAat > 1:28458/1‑100 (MQ=255) ccAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCAATTGCCACAAAata > 2:701709/1‑100 (MQ=255) aGGCTTCGCTATTTTTGGTGCTATCAGCTAAGAGGACTGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCCCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAACatct > 2:1498101/1‑97 (MQ=255) aGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAatata < 1:1074899/100‑1 (MQ=255) gCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAAtatata < 1:424332/100‑1 (MQ=255) ttCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATaaa < 1:1744357/100‑1 (MQ=255) tCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCTGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATaaaa > 2:1574374/1‑100 (MQ=255) gCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATaaaaaa > 1:2140615/1‑100 (MQ=255) gCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATaaaaaa > 2:2198421/1‑100 (MQ=255) cTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAg > 1:2455888/1‑100 (MQ=255) cTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAg < 1:7084/100‑1 (MQ=255) tATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGc > 1:205104/1‑100 (MQ=255) tcttttGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGcc < 1:447483/98‑1 (MQ=255) aTTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTTCTCTGAGCCCCGTCCTTTCCCAGCACATTCATTAAACAGATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAgn < 2:117571/99‑2 (MQ=255) ttttGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCt > 2:2312791/1‑100 (MQ=255) tttGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGccaga > 2:447479/1‑97 (MQ=255) tGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGc > 2:1455646/1‑100 (MQ=255) tGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCttt < 2:2194167/100‑1 (MQ=255) gCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTc < 1:917527/100‑1 (MQ=255) ccATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCt > 2:1793231/1‑100 (MQ=255) cATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTa < 2:1949517/100‑1 (MQ=255) aTCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTaa < 1:731005/100‑1 (MQ=255) gggCTAAGAGGACTGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACg > 2:528525/3‑100 (MQ=255) cAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACg < 1:7294/100‑1 (MQ=255) ggCTAAGAGGACTGTCCTCTTAGCTCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGt > 2:859643/2‑100 (MQ=255) aGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACg > 2:2509509/1‑99 (MQ=255) aGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGt > 1:1907212/1‑100 (MQ=255) gCTAAGAGGACTGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTg > 1:2339678/1‑100 (MQ=255) gCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTg > 1:29664/1‑100 (MQ=255) gCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTg > 1:438296/1‑100 (MQ=255) gCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTACCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTg < 2:90597/100‑1 (MQ=255) gCTAAGAGGACAGTCCTCGTAGACCCCTCCTTTCCCAGCTCATTCATTAAACAAATCAATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTGTCTAATGt > 2:663651/1‑99 (MQ=255) cTAAGAGGACTGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGa > 2:1452359/1‑100 (MQ=255) cTAAGAGGACTGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGa > 2:1262492/1‑100 (MQ=255) tAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGaa < 2:2011254/100‑1 (MQ=255) tAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGaa < 2:1635725/100‑1 (MQ=255) tAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGa > 2:2286734/1‑99 (MQ=255) aaGAGGACTGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGaaa > 1:399197/1‑100 (MQ=255) aaGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGtaa > 2:967117/1‑100 (MQ=255) agagGACAGACCTCTTCGCCCCCTCCTTACACCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTTCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGAAAg < 2:2274395/100‑1 (MQ=255) ggACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGAAAGTgg < 2:696595/100‑1 (MQ=255) gACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCACTTGCTTTCTAACGTGAAAGTGGt < 2:65535/100‑1 (MQ=255) cAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGAAAGTGGttt < 2:2380997/100‑1 (MQ=255) aGTCCTCTTAGCACCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGAAAGTGGTTTa < 1:2185554/100‑1 (MQ=255) | GTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGAAAGTGGTTTA > NC_000913/2089756‑2089953 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |